Protein

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Genbank accession
AOO19441.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MANRIQLRRGGAQEWANANPTLAQGELGIELDTGRFKIGDGATAWNTLRYERPVESNTNTPNSLVQRDADGSFSAGTITSTLIGNASTSTRLEQTRQIQLSNDVTATGNFDGSQNLNLSTALSLINTLPHYLEGGVSNTTRTFTEVTVDQKGRVVNARTPSQLNLTDYGLDGSATSDTTLAQPWNANLEAISDETGTGLYSKTAAGVVETRLITGAAGQIVITDGGGISGNPLISLSVQANVVPGDYNTESLTSVSQAGSGGEPFGTETVNASKFSVDDKGRLTTVTNVPIATATEGSKYAAYAAGTTYVRYDIIEDSSRVYQAITGIAAGGGAPTHTDGSDAGGWRYLAAAAVEQKGLASFAQEDFDVDANGHVTIAAVGVDNTQLQNNRIGFADGNTVENFELDQELTATTGYRGFNYLNYLKVNDTSGNLLVGANNTGDSGAGELDVNVRSYFSDPDITLDGALNQTLDKTGDGNLTFQLSQNTATNRNFNILTTNAGSGSSNIIITAEDTIQISASEATGKVHVEDAKFQDNYIATTNATMNLDPGDDRAVTGLVRVWGNLQIDGTTTTINSTQLTVDDVTILLGGDTVPTTDDNLDRGIEFNYYDTEARLGFYGWDTNYSDLGGHAGGYRFLHAATNTNEVFTGTDSGIIAGNVKLTTGTNSTSNTTGDLVVAGGVGITQDVNIGGLLDVDSTLRVTSTSRFDDNVVLQGASKTLQLNNGSGTTKIEFQSTTGNGSLAGILDVTGNFNINTDKFNVVATSGNTSIAGTLGVTNIATFSNDIDANANMTLAGNLHMESTNDITVAKNVGTGVWEIQSSDYGSLRIDGGAYVAGSALVDGTLHVNGAIEVQDSATETESRLNWLRVRYRGRFGDTYQATPSYASHNTSTIRAHGGAGIERTLHVGGTGSGEGLFVGKRYSGDTVKFSVLGATGNTDIQGTFDVAGNSEFNGTVDVDADFAVRNGTTDKFFVDNVTGNTDIQGTLDVNGATEITNTLDVSNAVTFDQTLLVQGNSEFNGTVDVDANFAVRSGSTDKMTVASSSGNIATDGTLVVQGQTTINDSLIVDAANEVFSVRNGSAVEKFGVDADNGNTNIIGTLTVGDATQINDTFGVSGIVTLTNNTEQTLTGSYGADGSLRLTGGAAVQRNLAVGGAARVYGNTELTGTLDLNNSADISGALVTHDNVTITADNKTFAIQNASAANKFTVDTDNGNTDLRGTLDIGGDVTAESNLTVTGNLTINGTTTTVNSTVTTIDDPIITVGGDTAPASNDGKDRGVEFRYYDSSAKIGFFGYDRSANQFAFVVDATNSSEVLSGTDGNLRAGSLNLTGAGTALDVDANANIDGTLTVDGQIISQVSSGAALVIPNTTKINNLNADLLDSMTTASAATATTVVARDSSGDFAANIITVASGVGAAAGIQGNALTADTLKTARNITVAGVVSGDAEFNGSGDITITTTYVDADITALAAMAGTGFVSRTAANTYAQRTLAVTASSGITLTNADGVSGNPTINVASTASNSANNLVLRDASGDFAAGTITAALVGNVTGQTSDISNHDTGDLSEGSNLYFTNERVDDRVNALIVAGTGVTKAYNDSAGTYTLTVTQADIDTDNVTEGSTNLFTTAARTRTHFTYGTGIELSGAGALSVTQADIDTDNVTEGSTNIFYTEARFNTSLATKDTDDVSEGSSNLYFTNTRADTRADLRVAAATGANLDLSSKSTTNLSEGTNQYYTEARVQDKLDNAFAQLSAMLNNLATSTTLTLNLSGDPTPGAAVTTSVTNGGGGGFTAGTAVATTGGTGTSLTVNTTVVGGVITAAAVNAGGSGFLVNETVTVTNANAGKVLSLNLASLAGGSNYVTGTALATTGGSGSASLTVDITASAGAITNVTINDGGTGYVVGETITIVQVGGTGGTVDVATVATDATLQLTDVTTMEVGATVTGATSGTTGVITALAASAITVDTVDGFFKVGEVVSANDVTTLTVQSFA
Physico‐chemical
properties
protein length:1987 AA
molecular weight: 203392,39010 Da
isoelectric point:4,18610
aromaticity:0,05687
hydropathy:-0,12516

Domains

Domains [InterPro]
SSF69349
STR
4–202
SSF69349 DC_1607 DC_1607 DC_0029
IPR041352
ATT
5–43
IPR041352 DC_1607 DC_0029
AOO19441.1
1 1987
Architecture
ATT
STR
STR
RBD
ATT 4-43 | STR 44-202 | STR 346-1569 | RBD 1658-1987
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Cyanophage S-RIM12_WH_07_0310
[NCBI] 		2928624 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Brizovirus > Brizovirus rhodeisland06
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AOO19441.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX349327 [NCBI]
CDS location
range 90885 -> 96848
strand +
CDS
ATGGCAAATAGAATACAGTTAAGACGCGGTGGTGCTCAGGAATGGGCAAACGCAAATCCAACTCTTGCACAGGGTGAACTTGGAATTGAACTTGATACTGGTCGGTTCAAAATCGGTGATGGTGCAACGGCATGGAACACGCTGAGATATGAGCGTCCTGTAGAGTCCAACACTAATACTCCAAACAGTCTTGTACAGAGAGACGCAGACGGAAGTTTTTCTGCGGGTACTATTACATCAACTCTTATTGGTAATGCTTCAACATCAACTAGACTTGAACAGACTAGACAGATTCAGTTATCTAATGATGTAACAGCGACTGGTAACTTTGATGGTTCCCAAAACTTAAATCTAAGTACTGCTTTATCACTGATCAATACCCTTCCCCATTACTTGGAAGGTGGTGTAAGTAATACTACTAGAACTTTTACTGAGGTTACTGTTGACCAGAAGGGTAGAGTTGTAAATGCTAGAACTCCTTCTCAACTAAATCTTACTGATTATGGTCTTGATGGTTCTGCAACTAGTGACACAACTTTAGCACAACCTTGGAATGCAAACTTAGAAGCAATTTCAGACGAAACTGGTACTGGTTTATATTCAAAAACTGCAGCGGGTGTTGTTGAGACCAGACTTATTACTGGTGCTGCTGGTCAAATTGTTATCACTGACGGTGGTGGTATTAGTGGCAATCCTCTAATCTCACTGTCAGTTCAAGCAAACGTTGTTCCTGGAGATTATAATACAGAATCTCTCACTTCAGTATCTCAAGCTGGTAGTGGTGGAGAACCTTTTGGTACAGAGACTGTTAATGCTTCTAAGTTCTCTGTTGACGATAAAGGACGTTTAACAACCGTAACGAATGTACCTATTGCTACTGCTACCGAGGGTAGTAAGTATGCGGCATATGCAGCAGGTACAACATATGTTAGATATGATATCATTGAAGATAGTAGTAGAGTATATCAAGCAATTACAGGAATTGCTGCAGGTGGTGGCGCTCCAACTCATACTGATGGTTCAGATGCTGGTGGGTGGAGATATCTTGCTGCTGCAGCAGTAGAGCAGAAAGGACTTGCTTCTTTCGCACAAGAAGATTTTGATGTTGATGCCAACGGACATGTAACTATTGCTGCTGTTGGTGTAGATAATACACAACTCCAAAACAATCGTATTGGTTTCGCTGACGGTAATACCGTAGAAAATTTTGAACTGGATCAAGAACTTACTGCAACCACTGGATACCGAGGATTCAATTATCTTAACTATCTTAAAGTTAATGATACGAGCGGTAATCTACTCGTTGGCGCTAATAATACGGGGGACAGCGGAGCTGGCGAACTTGATGTTAATGTACGGTCGTACTTCTCTGACCCTGATATTACTCTCGACGGCGCTCTTAATCAGACATTGGATAAGACTGGGGATGGTAACCTTACCTTCCAGTTAAGTCAGAATACTGCTACAAATAGAAACTTTAACATTCTGACAACTAATGCTGGTTCTGGATCCAGCAACATTATTATTACTGCTGAAGATACTATACAGATTAGTGCATCAGAAGCAACTGGTAAGGTCCATGTAGAGGATGCAAAATTCCAAGATAATTACATCGCCACAACCAATGCGACGATGAACCTCGACCCTGGTGATGACCGTGCAGTCACTGGTTTAGTTCGTGTCTGGGGTAACCTTCAGATTGATGGCACAACAACTACAATTAATTCCACACAATTGACTGTAGATGATGTCACCATTCTACTTGGTGGTGATACTGTTCCTACAACTGATGATAATCTGGATCGTGGTATTGAATTCAACTATTATGACACTGAAGCACGCTTAGGTTTCTATGGTTGGGATACCAATTATTCTGATTTAGGTGGTCATGCAGGCGGATATCGTTTCCTTCATGCTGCCACAAATACCAACGAAGTCTTTACGGGTACTGATTCTGGTATTATTGCAGGTAATGTAAAACTGACAACTGGTACTAACTCAACCTCTAATACAACTGGTGACCTTGTAGTTGCTGGTGGTGTTGGTATTACTCAGGATGTAAATATCGGCGGTCTTCTAGATGTTGATAGTACATTGCGTGTTACTAGCACCTCTCGTTTCGACGATAATGTAGTTCTGCAGGGTGCTTCTAAGACTTTACAACTGAATAATGGTAGTGGTACAACCAAGATTGAATTCCAATCTACAACTGGTAACGGTTCTCTTGCTGGTATTCTGGATGTAACTGGAAACTTCAATATTAATACTGATAAGTTTAATGTTGTTGCTACTTCTGGCAATACCTCCATTGCTGGCACATTGGGTGTTACAAACATTGCAACATTCTCTAACGACATTGATGCTAACGCCAACATGACATTGGCTGGTAACCTTCACATGGAGAGCACCAATGACATTACGGTTGCTAAGAATGTTGGCACTGGTGTTTGGGAGATTCAGTCTAGTGACTACGGATCTCTGAGAATTGATGGTGGTGCATACGTTGCAGGATCTGCTCTAGTTGATGGTACACTTCATGTTAACGGTGCTATTGAAGTTCAAGATAGTGCAACAGAGACTGAATCTAGACTGAACTGGTTGAGAGTTAGGTATAGAGGTCGTTTCGGTGACACTTATCAGGCAACTCCTTCCTATGCATCTCATAACACTTCCACCATCAGAGCACATGGTGGTGCTGGTATTGAAAGAACTCTACATGTTGGTGGCACAGGATCTGGTGAAGGTCTGTTTGTTGGTAAGAGATACTCTGGTGATACAGTTAAGTTTAGCGTTTTAGGTGCAACTGGTAATACTGACATTCAAGGCACATTCGATGTTGCTGGTAACTCCGAGTTCAATGGCACAGTTGATGTTGATGCAGACTTTGCTGTAAGAAATGGCACAACGGATAAATTCTTTGTTGATAATGTAACTGGCAACACCGATATCCAAGGCACTCTGGATGTCAATGGTGCAACTGAGATTACAAATACTCTGGATGTTAGCAACGCTGTTACATTCGACCAGACACTGTTAGTCCAAGGCAACTCTGAGTTTAACGGTACTGTTGATGTTGATGCTAACTTCGCTGTAAGAAGTGGTAGCACGGATAAGATGACCGTTGCTTCTTCTTCAGGTAACATTGCAACTGACGGCACACTGGTTGTCCAAGGTCAAACAACCATTAACGATTCACTGATTGTTGATGCTGCTAATGAAGTCTTCTCTGTCAGAAACGGATCTGCTGTTGAGAAGTTTGGTGTTGATGCTGATAACGGTAATACAAATATCATCGGCACACTGACCGTTGGTGATGCAACTCAGATTAATGACACCTTCGGTGTATCTGGTATTGTCACACTTACTAATAACACTGAGCAAACCCTGACAGGTAGTTATGGTGCTGATGGTTCTCTAAGACTTACTGGTGGTGCTGCTGTCCAAAGAAACCTCGCTGTTGGTGGTGCTGCAAGAGTCTACGGCAACACTGAACTGACTGGTACTCTCGACCTTAACAATAGTGCAGACATCTCTGGTGCTTTAGTAACACATGATAATGTTACGATTACTGCAGACAATAAGACATTTGCAATTCAGAATGCATCTGCTGCTAATAAATTTACGGTAGATACCGATAATGGAAACACTGATCTTCGTGGCACCTTAGACATCGGTGGTGATGTAACTGCTGAGTCCAATCTTACTGTTACTGGAAATCTTACTATCAATGGAACGACAACTACTGTCAACTCTACGGTCACAACTATCGATGACCCTATTATTACTGTGGGTGGTGACACAGCACCAGCGTCTAACGACGGTAAGGATCGTGGTGTTGAGTTCCGTTATTACGACAGCTCTGCGAAAATTGGTTTCTTCGGATACGATAGATCCGCCAACCAATTCGCATTCGTAGTAGACGCAACTAATTCATCAGAAGTTCTTTCTGGTACTGACGGTAACCTTCGTGCTGGTAGTCTTAATCTTACTGGTGCTGGCACTGCACTCGATGTTGATGCAAATGCAAATATTGATGGCACTCTGACTGTAGATGGTCAAATCATCTCTCAGGTTTCTTCTGGTGCTGCTCTAGTCATTCCTAACACGACCAAGATTAACAACCTCAATGCTGACCTTCTGGACAGCATGACAACTGCTTCTGCAGCAACTGCAACTACTGTTGTTGCTCGTGACTCTAGTGGAGACTTTGCTGCAAATATCATTACGGTTGCTTCTGGTGTAGGTGCCGCTGCTGGTATTCAAGGTAATGCTCTTACTGCAGATACACTTAAAACGGCAAGAAACATCACAGTTGCTGGTGTTGTTTCTGGAGATGCTGAGTTTAATGGTTCTGGTGATATTACAATCACTACAACATATGTTGACGCAGACATCACTGCACTTGCTGCAATGGCAGGAACTGGTTTTGTTTCCAGAACTGCTGCCAATACATATGCTCAACGCACACTCGCTGTCACAGCATCTTCTGGTATTACACTGACAAATGCTGATGGGGTTTCTGGCAATCCAACCATTAACGTCGCTTCTACAGCAAGTAACTCAGCAAACAACCTCGTCCTTCGTGATGCATCTGGTGACTTTGCTGCTGGGACTATTACTGCAGCATTAGTTGGTAATGTTACTGGTCAAACATCTGATATTAGTAATCACGATACTGGAGACCTTTCTGAGGGATCCAATCTATACTTTACTAATGAGCGTGTTGATGACAGAGTTAATGCTCTGATTGTTGCGGGTACAGGTGTCACTAAGGCATATAACGATTCTGCAGGCACCTATACGCTTACTGTAACGCAGGCAGACATCGATACCGACAATGTAACCGAAGGTTCCACAAACCTCTTTACAACCGCTGCTAGGACCCGTACACACTTCACATATGGTACAGGTATTGAACTTAGCGGTGCAGGTGCTCTGAGTGTCACTCAGGCAGACATTGATACTGATAATGTAACTGAAGGTTCTACTAATATCTTCTA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Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
260148f56ff988fdf06056c18070b2fdfcbd0f2a581e0de187f0ef13636bfc76
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5238
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50