Protein
View in Explore- Genbank accession
- QBX18290.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fibers protein
- RBP type
-
TSPTF
- Protein sequence
-
MDLIIHDAKLKKVAYIDNELQDTLSFYDDKWSRYLDTASSTFEFTVYKNGIKSDTVKQKAYQTLTERSFVSFKYNKRTYLFNVMKTEETETTIRCYCENLNLELLNEMAGPYKAKTEMSFVEYCNTFFLLVGGAITIGHNEIEDRERTLEWTGTDTKLKRLLSIANQFDAEIEFETILDEDSSLKSFILNIYKENDDKNQGVGKVRQDVVLRHGHNITGVKRTIDKTGIFNMITPVGKATVDVKVTKANPKYVAPKLNAVTYSGGSLSNGGRTISKSLVNEILNLCVQHKLLPSGVFSQMYLESFWGNSPVARADNNWGGLTWTGSTTRPSGIKVTQGTARPANEGGYYMHFASVSDYMKDYTYLLAEQGIYKVKGANNIDAYTKGLFRVGGAAYDYAAAGYGHYAPLMRSIRGGINSASNGAMDTLDNQFKTAGTVGTAPVSQIATKTKDALAQLGAIKGQRVGSGQCYALSALYSLKLGGAGLGGGVTGFRGVRPGGGAAASHIGEDYNWDQFGWKVVRPSEVKHLIPGSIANIRANAGSPVYTGGWGHTVVIKALSGDTLTVYEQNFAGHQYVEERTYSASAYLGVIQTLVYPPEIVQGKRIDGTESAPVQSGTPGNNEPKTISETQQQEKTVGIPNDLYREWKNEDGVVEFYIKNGSIYAPISKELYPSAFSGEEVSDNWIKKSVEYETIDIEQIISYSLQDIRKNCYPSISYEVKGTDENLDMGDTVKIDDEEFPEGLVLSARVSEQHISFTNDSTNQTIFDNYKALKNKLSKDLIDRYEELAEQAKPYELRLLTDKGTQFKNSTGLSVLTAELWKNNKQYDATFQFRNFDTLLASGLTYTVDGSTIPIDKPFLISVDAFIGNDLVATKQITFTNVTDGTDGIGIKSSSVMHGISTSATVQPTNWTEAMPVAKQGEYLWKRKITDYTDPSKPDTIELTYSYQGKNGSAGTSVSVTKIEYQVGTSGTTAPTGTWSTAIPSVPDGQFLWSKTTMSDNSVIYGINKQGAKGDKGDTYYPHTAWANSEDGKVDFSTTESKGRRYKGDYSDTNVAGSPDPTKYKWVDMVGGVESGGTNVYSIAGNATIGKSHISDLNMDISTGVIRFVASGPDPFIGVVRSHPFVYNNVYGIKIPVVAGKDIAVTITNPKITKNYVSYFTNDGKTVKQYKGYFASKFIIPKPELAGVDFITMRIGAGSSNVSIGDVFETKIQAEYGNIYSDWSPADEDVRANIDTKADQALTQDQLNLLLETQNLMTAEMKSKATAEQADSLLATVNKILSDSAITGADTEAKLIANAERIEAFRKDFDDKMVQLDFVSNYMRVTDLGFEISANDGSSSLLIQKDRISMLSAGKEVMYISQGLIHIDNGVFTKTLQIGNFRESQADGDPTTNLEIYVG
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1398 AA molecular weight: 153512,11630 Da isoelectric point: 5,39819 aromaticity: 0,09800 hydropathy: -0,38269
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Streptococcus phage Javan407 [NCBI] |
2548153 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QBX18290.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
MK448753.1
[NCBI]
CDS location
range 29739 -> 33935
strand +
strand +
CDS
TTGGATTTAATTATTCATGACGCAAAATTAAAAAAAGTTGCATATATCGATAACGAATTACAAGACACCTTGTCTTTTTATGACGACAAGTGGTCACGTTATTTGGATACTGCATCATCAACATTTGAATTTACCGTTTATAAAAATGGTATTAAATCAGACACAGTAAAACAAAAGGCCTATCAGACACTAACTGAAAGGTCTTTTGTTTCGTTTAAATATAACAAGCGAACGTATTTGTTTAATGTGATGAAAACAGAAGAAACAGAAACAACAATTAGATGTTACTGTGAAAACCTCAATCTCGAGTTGCTAAACGAAATGGCTGGTCCATATAAAGCAAAAACTGAGATGTCATTTGTAGAGTATTGTAACACGTTCTTTTTATTAGTGGGTGGCGCTATAACTATTGGTCACAATGAAATTGAAGATCGTGAGCGTACTCTTGAGTGGACTGGAACAGATACTAAGTTAAAACGTTTGTTGTCTATTGCTAATCAATTTGATGCAGAAATTGAATTTGAAACTATTTTGGATGAAGATTCTAGCTTGAAATCATTCATTCTTAATATTTATAAAGAAAATGACGATAAAAATCAAGGCGTTGGTAAGGTTCGTCAAGATGTCGTTTTAAGACATGGTCATAATATTACAGGTGTAAAACGCACAATTGATAAAACTGGTATTTTTAACATGATTACACCAGTCGGAAAAGCTACAGTTGACGTTAAAGTCACAAAAGCGAATCCCAAATATGTAGCACCTAAATTAAATGCAGTCACTTATTCAGGCGGTTCACTTTCAAACGGTGGACGGACAATTTCCAAAAGTCTTGTAAATGAAATTTTAAACCTTTGTGTCCAACATAAGTTATTACCGTCTGGTGTATTTTCTCAAATGTACCTTGAATCATTCTGGGGTAATTCCCCAGTCGCTCGAGCTGATAATAACTGGGGTGGATTAACATGGACTGGCTCAACGACTAGACCATCTGGTATTAAAGTTACGCAAGGTACTGCACGTCCAGCTAACGAGGGCGGTTATTACATGCACTTCGCAAGTGTGTCGGACTACATGAAAGACTACACTTACTTATTAGCTGAGCAAGGTATTTACAAAGTAAAAGGTGCTAACAACATTGATGCTTATACAAAAGGTCTATTCCGTGTTGGTGGGGCGGCTTACGATTATGCAGCAGCTGGATATGGTCATTATGCACCATTAATGCGGTCAATTCGCGGTGGTATTAACAGTGCATCAAACGGTGCTATGGATACACTCGATAATCAATTTAAAACAGCTGGCACTGTTGGGACTGCACCAGTAAGTCAAATAGCAACCAAAACAAAAGATGCATTAGCTCAACTTGGAGCAATTAAAGGTCAACGTGTTGGATCTGGTCAATGTTACGCTTTATCAGCCTTGTACTCACTTAAATTAGGTGGGGCAGGCCTTGGCGGTGGAGTTACTGGGTTTAGGGGGGTGAGACCCGGTGGAGGTGCCGCCGCCTCACATATCGGGGAAGATTACAACTGGGATCAATTTGGATGGAAAGTTGTTAGACCATCCGAGGTTAAGCACTTAATTCCTGGATCTATTGCTAATATCAGAGCTAATGCAGGCAGTCCAGTTTATACTGGTGGCTGGGGGCATACAGTAGTTATCAAAGCGTTATCTGGGGACACTTTAACCGTTTATGAACAAAACTTTGCTGGTCATCAATATGTTGAAGAACGCACGTACTCCGCAAGCGCTTATTTAGGCGTTATCCAAACATTGGTTTACCCGCCTGAAATTGTGCAAGGCAAGCGTATAGATGGCACAGAGAGTGCGCCAGTACAGTCAGGCACGCCTGGGAATAATGAGCCTAAAACGATATCCGAAACGCAACAACAAGAAAAAACTGTAGGCATCCCAAACGATTTATATCGTGAGTGGAAAAACGAGGATGGTGTGGTAGAATTTTACATTAAAAATGGTTCAATATATGCCCCAATCTCAAAAGAACTTTATCCATCCGCCTTTTCTGGGGAAGAAGTTTCTGATAATTGGATTAAAAAGTCGGTTGAATATGAAACAATTGACATCGAACAAATTATTTCTTACTCGCTTCAAGACATTAGAAAAAATTGTTATCCATCTATTTCTTACGAGGTTAAGGGAACAGATGAAAATCTTGATATGGGTGATACAGTTAAAATTGATGATGAAGAATTCCCTGAGGGGTTAGTTTTATCTGCAAGGGTATCTGAGCAACATATATCATTTACTAATGACAGTACTAATCAGACTATTTTTGATAACTATAAAGCTTTAAAAAACAAACTAAGCAAAGACTTAATAGATCGATACGAAGAATTAGCAGAACAAGCTAAACCATATGAATTGAGACTTTTAACGGATAAAGGGACACAATTTAAAAACTCAACTGGTCTATCTGTGTTGACTGCAGAACTTTGGAAAAATAATAAGCAATATGATGCCACGTTCCAATTTAGAAATTTTGATACTTTACTTGCTAGTGGGCTAACTTATACAGTTGACGGTTCAACAATTCCAATTGACAAACCTTTTTTAATATCCGTTGATGCATTTATTGGTAATGACTTAGTTGCTACAAAGCAAATAACGTTTACTAATGTTACGGACGGTACAGACGGAATTGGTATTAAATCGTCATCCGTAATGCATGGCATATCCACATCAGCAACTGTACAGCCTACAAATTGGACAGAGGCAATGCCAGTTGCAAAACAAGGTGAATACTTATGGAAAAGGAAAATCACAGATTACACTGACCCAAGCAAACCAGATACCATTGAATTGACTTACAGTTACCAAGGTAAAAATGGAAGTGCTGGCACATCAGTCTCTGTAACTAAGATTGAGTATCAAGTAGGAACATCTGGAACTACAGCTCCTACAGGAACTTGGTCAACTGCTATTCCAAGCGTACCAGACGGGCAGTTTTTATGGTCTAAGACAACAATGTCAGATAACAGTGTTATCTATGGCATTAATAAACAAGGTGCAAAAGGCGATAAGGGAGACACTTACTACCCACACACGGCTTGGGCTAACAGCGAGGATGGCAAAGTAGACTTTAGCACGACCGAATCAAAAGGTAGACGGTATAAAGGCGACTACTCAGATACTAATGTAGCAGGTAGCCCAGACCCTACTAAATACAAGTGGGTTGATATGGTTGGAGGCGTTGAATCTGGCGGAACAAATGTATACTCAATAGCCGGTAACGCAACAATTGGTAAAAGTCACATTTCTGATTTAAACATGGATATTTCTACAGGCGTTATTCGTTTCGTTGCGTCTGGCCCAGACCCATTTATCGGAGTCGTCAGGTCACATCCTTTTGTTTACAATAATGTTTATGGTATTAAAATACCAGTTGTTGCAGGTAAAGACATTGCAGTAACTATCACTAATCCAAAGATAACTAAAAACTATGTTTCGTATTTTACAAATGATGGTAAAACTGTTAAGCAGTATAAAGGATATTTCGCTTCAAAATTTATTATCCCAAAACCTGAATTGGCTGGTGTTGATTTTATTACAATGCGAATTGGTGCAGGTAGTTCTAATGTTTCGATTGGTGATGTTTTTGAAACTAAAATTCAAGCAGAATATGGGAATATTTATTCAGATTGGTCGCCAGCCGATGAAGATGTTAGAGCAAATATTGATACCAAAGCTGACCAAGCCCTAACCCAAGACCAATTAAATCTCTTGCTTGAGACTCAAAACTTAATGACTGCAGAAATGAAGTCAAAGGCAACTGCTGAACAAGCTGATAGTTTGCTTGCGACTGTTAACAAAATTCTTTCTGATAGCGCTATAACTGGTGCTGATACAGAAGCAAAATTAATCGCAAATGCTGAACGTATTGAAGCTTTTAGAAAAGATTTTGACGATAAGATGGTTCAGCTTGATTTTGTTTCAAACTACATGCGCGTTACTGACTTAGGTTTTGAAATTTCAGCTAATGACGGTTCATCAAGTTTGTTAATTCAAAAAGACCGTATTTCAATGCTTTCAGCTGGTAAAGAAGTTATGTATATTTCGCAAGGATTAATTCATATTGACAATGGGGTATTTACCAAAACACTTCAAATTGGTAATTTCCGTGAGTCACAGGCTGATGGTGACCCAACAACAAACTTAGAAATTTATGTAGGTTAG
Tertiary structure
PDB ID
0ddbf48b1cd37e2f3f2feeb9cfbc4732021e377ea692ef9706412985447f60d2
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50