Protein

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Genbank accession
AHB80593.1 [GenBank]
Protein name
structural protein
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,64
Protein sequence
MPVGFNSPARNLFLLGSSGAQVATNFFKSIDQSSSTDGTFVPSEIKFNYLDQKYILSGSASDSNSKYVGWIEKRDYDSTTDPENPTSTSEWDVRIQATQSSANTLLLAMELDSNNNLVVAGRTSSIPWVAKYSNAGVLDWQSTSNTGDLSYTGITSDSNGNYYACGSTDGGTPATLEAVAFVEKFDSNGNPGWGKQAFMLGRDVVLEKISANSRGEVVAVGFLEDDSAEKGYIVKIDTNTGEVLWDRTLERNISGYGGSSNDDIAAAEVRCTACYIDSKDQIYVVGTITGNSPVDNGTGEFLIKYSPEGNIIWQKENETIHYTALDGAPNVVPFDVKSDGETEQTVVLSVEDQGSFALNDSDIFITKYSKNGDLVFRRKISKGIDNLGAASLDADPSFYYILFRDQKFDVLAGEPDRYTFGKVSTSGNGLGAFQYDDLGPTATDIDYTVISNAENKIGRLSDGSVRNDTSDLVTYPFTANKLVFDDLATHVSNKRRQMDSADSFEYGGSPAIRINEFDQELNLLGNVYSGSGDWLDQSGKGRDTSASPGEPFYGSGGARFDGIDNYLEIANSTDFQFGTGDWTIEFWWKGFPSGSFTAVITTLISSNEAGTWRIGTRYNSTNRIYFARGTGSDFTDRQIDVNVNDNRWHHIAFVRSNGVIIPFVDGVDRTSDLVNGNLLDSNSMTTSNPVKIGYNQRDNAYIEGSVSQLRVVKGIAVYTSNFTPPTEALTAIPGTSLLTCQGLSITDASSSNHTITDPNAGSSAMVQSDLPIGRPTYNAAGYWDFDGFSEYLDASPPILKNYAGGTIEAWFKTGDSTTNGSTIYSEHTSGITGAGWAHLRIRGGKLRYTINPASGLTVKIQCAKFVDDNNWHHVVFTGSGSGSNGYKFYIDGMRYNESIIGDDNGYKWFNNNPATNEYSIGKTGQSTDGNNYFMGSLGDVRIYSRALTQAQAHQNYNATKSKYINEAPSTAPRITDKSIVIDSLRLYYDFGNRATYDTAQNLIPNSEDFTKWNQAVHFWENNYAIAPDGTKTAALLKESIPSQQQLSYHNIGLGGTSLVVGETYTFSVYAKANTRDTFEMHMYGDSSASFNLTTGSSTSTSSMTDVGDGWWLCKWVREKTNTAGFDYVYLGFSGSTYAGAGVDESIFIWHPQFERDVTRGRYIKTSGISITAPTTVKNLSSSSSGVGASLYTGTINGGATFNSDGYFEFDGTDDYIQSSSLVAPSEADFSVIMWYKITSTSGRGGLMERAADAPFTGWFLGHSGTTRWAAQVRDADNDEVDFEFTFPTVDQWTCDAFTWNTSTQSLAPYRNGAAAAGTATQSGNAVGSLDGNTRYPMAIGARLNDSGAQYKPMECGEVQIYIKALTAAEVLQNFNATRSKYGV
Physico‐chemical
properties
protein length:1383 AA
molecular weight: 150365,81220 Da
isoelectric point:4,65815
aromaticity:0,11569
hydropathy:-0,41265

Domains

Domains [InterPro]
IPR011047
217–414
IPR011047 G3DSA:2.60.120.200 IPR013320 G3DSA:2.60.120.200
IPR013320
531–712
IPR013320 PF13385 IPR013320
PF13385
561–712
PF13385 G3DSA:2.60.120.200 PF13385
AHB80593.1
1 1383
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage ACG-2014h
[NCBI] 		1340810 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AHB80593.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KF156338 [NCBI]
CDS location
range 165256 -> 169407
strand +
CDS
ATGCCAGTAGGTTTTAATAGTCCCGCCAGAAACCTTTTTCTTTTAGGTTCTTCTGGCGCACAAGTAGCAACGAACTTTTTTAAGTCTATCGATCAGTCTTCATCAACTGATGGTACTTTTGTTCCAAGTGAAATTAAATTTAATTACCTAGATCAAAAGTACATTCTGTCTGGTTCAGCATCAGATAGTAACTCAAAATATGTTGGGTGGATTGAAAAAAGAGATTACGATTCCACTACTGATCCAGAAAATCCAACATCAACGTCTGAATGGGATGTAAGAATTCAAGCGACACAATCATCTGCTAATACATTACTGCTTGCTATGGAGTTGGATAGTAACAACAATTTAGTTGTTGCTGGTAGAACAAGTAGTATTCCTTGGGTTGCGAAGTATTCTAATGCTGGTGTACTAGACTGGCAATCAACATCTAACACTGGTGACTTATCATATACTGGCATTACATCAGATAGCAATGGAAACTATTATGCTTGTGGTAGCACAGATGGTGGAACCCCAGCAACCCTGGAGGCAGTAGCATTTGTAGAAAAGTTTGATAGTAATGGCAACCCTGGATGGGGCAAACAAGCATTTATGTTAGGCAGAGATGTTGTTTTGGAAAAAATCTCTGCTAACTCTAGAGGTGAGGTAGTCGCTGTTGGATTCCTAGAAGATGACAGTGCTGAGAAAGGATACATCGTTAAGATTGATACCAACACAGGTGAAGTTCTATGGGACAGAACACTAGAGAGGAATATATCTGGATATGGTGGATCAAGTAATGATGATATTGCAGCTGCCGAGGTAAGATGTACTGCTTGTTATATTGACAGCAAGGATCAAATTTATGTTGTTGGTACTATTACTGGTAATAGTCCTGTTGACAATGGTACAGGAGAGTTCCTTATCAAGTATAGTCCCGAAGGAAATATTATATGGCAGAAAGAAAACGAGACTATACATTACACTGCGCTTGATGGTGCCCCTAATGTAGTTCCATTTGATGTTAAATCTGATGGTGAAACAGAGCAAACAGTTGTGCTATCGGTAGAAGACCAAGGATCTTTTGCTCTTAATGATTCTGATATTTTTATAACTAAGTATTCTAAAAATGGAGACTTAGTTTTTAGAAGAAAAATTAGTAAAGGTATTGATAATTTAGGTGCTGCTTCTCTAGATGCTGACCCGTCATTCTATTATATTTTGTTTAGAGATCAGAAATTTGATGTGCTGGCAGGAGAACCAGACAGATATACTTTTGGTAAGGTCAGTACGTCTGGTAATGGTTTGGGTGCTTTCCAATATGATGATTTAGGACCAACCGCAACAGATATTGACTATACTGTTATCTCTAATGCAGAAAATAAAATTGGCAGACTATCTGATGGTTCTGTAAGGAATGATACAAGTGATCTAGTTACATATCCTTTCACTGCTAACAAACTAGTCTTTGATGATCTTGCTACTCATGTCTCTAACAAGAGGAGACAGATGGATAGTGCTGATAGTTTTGAGTATGGTGGTAGTCCTGCTATTAGAATTAATGAGTTTGACCAAGAGTTAAACCTACTCGGCAATGTCTATTCTGGTAGTGGAGACTGGTTAGATCAATCAGGTAAAGGTAGGGATACTAGTGCTTCTCCTGGAGAACCTTTTTATGGTTCTGGTGGAGCAAGATTTGATGGTATTGATAATTATTTAGAAATTGCAAACAGCACAGACTTTCAATTTGGAACTGGTGATTGGACTATTGAATTTTGGTGGAAAGGGTTTCCTTCAGGATCTTTTACTGCTGTCATTACAACACTGATCTCCAGTAATGAAGCAGGAACTTGGAGAATTGGAACAAGATACAACAGCACCAACAGAATTTATTTTGCTCGTGGAACTGGTAGTGATTTTACAGATAGACAAATAGATGTCAATGTTAATGATAATCGATGGCATCATATTGCTTTTGTTAGAAGTAATGGAGTCATCATTCCTTTTGTTGATGGTGTTGATCGAACATCAGACTTAGTAAATGGGAATCTCCTTGATTCTAATAGTATGACTACAAGCAATCCTGTCAAGATTGGATATAACCAGAGAGATAATGCTTATATTGAGGGTAGTGTTTCTCAATTGAGAGTAGTTAAAGGAATAGCAGTATATACAAGCAACTTTACACCACCAACCGAGGCTTTAACTGCTATTCCAGGTACATCTTTACTAACATGTCAAGGACTTTCTATAACTGATGCTAGTAGTAGCAATCATACAATTACAGATCCTAATGCAGGAAGTTCGGCCATGGTGCAGAGCGATTTACCCATTGGTAGACCTACCTACAACGCCGCTGGATACTGGGACTTTGATGGATTTTCTGAGTACCTTGATGCATCACCTCCAATTCTTAAGAACTATGCTGGTGGAACAATTGAAGCATGGTTTAAGACAGGAGATAGTACAACCAATGGATCTACAATTTATTCGGAACATACAAGTGGAATTACTGGAGCTGGTTGGGCACATCTCAGAATTCGCGGCGGTAAACTAAGGTATACTATTAATCCTGCGAGCGGATTGACAGTAAAAATTCAATGTGCCAAGTTTGTGGATGATAACAATTGGCATCATGTTGTGTTCACTGGTAGTGGGTCTGGATCAAATGGTTATAAGTTTTATATTGATGGTATGAGATACAATGAATCTATAATAGGTGATGATAATGGATACAAATGGTTTAATAACAACCCTGCAACGAACGAATATTCTATTGGAAAAACTGGACAAAGTACAGATGGTAACAATTATTTTATGGGTTCACTCGGTGATGTTCGTATCTATTCAAGAGCTCTAACACAAGCACAAGCCCACCAGAACTATAACGCTACCAAGTCTAAGTATATCAACGAAGCACCTTCCACAGCACCTAGGATTACTGATAAGTCTATTGTAATTGATAGCCTGAGACTATACTATGACTTTGGAAACAGAGCAACGTATGATACAGCACAAAACCTTATTCCTAATAGTGAAGACTTTACTAAGTGGAATCAAGCAGTTCACTTCTGGGAAAATAACTATGCTATTGCTCCTGATGGAACTAAGACAGCAGCATTATTAAAAGAATCTATCCCATCACAGCAGCAGTTGTCTTACCACAATATTGGTCTCGGTGGAACATCTTTAGTTGTTGGAGAAACATATACTTTTAGTGTATATGCCAAAGCAAATACCAGAGATACCTTCGAGATGCATATGTATGGTGATAGCAGTGCTAGTTTCAATTTGACTACTGGATCTTCAACGTCCACTTCTTCCATGACAGATGTTGGAGATGGTTGGTGGTTATGTAAGTGGGTTAGAGAAAAGACTAATACTGCAGGTTTTGATTATGTTTATCTTGGATTTTCTGGTAGCACATACGCTGGTGCTGGAGTAGATGAATCGATATTCATTTGGCATCCTCAATTTGAAAGAGATGTTACCCGTGGCAGATACATCAAAACATCTGGAATTTCTATCACAGCACCAACCACAGTCAAGAACCTCTCAAGTTCTTCTTCTGGAGTTGGAGCGTCGCTTTATACTGGCACAATCAACGGAGGAGCTACATTTAATAGTGATGGATACTTTGAGTTTGATGGAACAGATGATTACATCCAATCAAGTAGTCTAGTGGCACCTTCAGAAGCAGACTTTAGTGTTATCATGTGGTATAAGATTACTAGCACTTCTGGTAGAGGTGGTCTCATGGAAAGAGCAGCTGATGCTCCTTTCACTGGATGGTTTTTAGGTCATAGTGGAACCACCAGATGGGCTGCTCAGGTTAGAGATGCCGATAATGATGAGGTTGATTTCGAGTTTACTTTCCCAACAGTTGATCAATGGACTTGTGATGCGTTCACTTGGAATACCTCAACACAATCACTAGCACCATATAGAAATGGTGCTGCTGCTGCTGGAACAGCAACGCAATCTGGAAATGCTGTTGGATCTTTAGATGGCAATACAAGGTATCCTATGGCAATTGGTGCTAGACTTAATGACAGTGGAGCACAATACAAACCTATGGAGTGTGGTGAGGTTCAGATATATATTAAAGCTCTAACAGCAGCAGAAGTTCTCCAAAACTTCAATGCCACCCGTAGTAAGTATGGTGTCTGA

Tertiary structure

PDB ID
43e56c561907712f3fa6ffede814b3172b5a5eb0f852a294f69901f0681ca881
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7546
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50