Protein

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Genbank accession
YP_009612238.1 [GenBank]
Protein name
autotransporter adhesin
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,70
Seq2Symm
C1 confidence 0,993 truncated
C1 0,993
C2 0,006
C3 0,002
Predicted homo-oligomer symmetry (Seq2Symm, per-class probabilities; C1 = monomer, C2 = dimer, C3 = trimer).
Protein sequence
MLLNVTEVTSNLSSTRNLAFSADGEWIAAVPQITTASTTFQVYKKTSAGNFDDPAINVSIPVSNASIDYVTISPNSQKMAVATGINKVYLYNLVGGVWTYYNELTPPARPVSVKYAQDSNDLLVNCNNGVSLVYNTDLLTQLYTVTRSVQQVLVDSSLSADTNIFISSSATTNSTSYGVFIYTKTGGTYTTAQVTNFSNSIYGIKISADGLKIYISTNNGVYILRRASSTQTFNQSIYYSKSTSPILIRDFGIYDGKYLIGPGATTGLFGAYDSTEANKYLETSVLYDTPIDGPSIPTTYINSSTFSDNRFVAYVSGTAPKVYSVSKKTVTTAKFYDGNTISGYSTPVYQFVLSKDKTKFFTMFSARYNNSPTYNFGDVKNGQLIPNNKLSFNNTQAVSVSAGTVSSFSPSNNYFALSSANVLRLFKLSTDGVYDELSYTPALSIAPVVAEFSPNEQYVVSFSRTVINVHSINGTLATNVTVNLNGATLADLASIVWYSNTQFIVSSYSAGMYFFEYDSVNNRFNLKRSLLTSEYENRSMVLSQDKRFIYAIKNTAVGSFWGAKYTITDFDNISYTGIITDNYSNTAAAIKFIRLSPDGTKLFITGQSTPWFGMYTVDTVSGDITPITLTTKETINATAYGCDWLTNETFFVGYNGEYANNWSLKSYRYNSSTNSVTDDSTLLINMVTYSNINGAAITSDAKNIYVSAPSNITSTTGLTRFEKNSDGRYVRVQQLNNVSTGGVLIVANGKYMLAITATATNNARLYERNSEGLFVDYTEFTISGTISSSFFHKIDENNIVFITSTSGGGYFHYHISNEGVVTQKQTIDRINATSFYYVGQSYNSQYIYFSDTSTNLRIFEKQVSGDYTLKTSQAGVNANIFRLWSSPTNPSAGIMKLSTSMTYVDINADGTINFGATIQTNTTAACWYNDGSGFFITGTNATNNGITSTYLFDNSSKKWFKNPEVIYPTGSISGTLVNVNSGLDITNPAKDVVVYIQAQPTSISTSTITAGARAIGIQYVESEKVVTGSINVVLSSIETEGELVTDLAIDSDTLINPITTTGEIDTPIAATLDITLNPFIISGFFGEKSEYDIDLTLTTAFSIVRPDNWSELTTTPLEQPYAYGDVKLRPISNDGLLSLLPDVSGDVLINSITSTGILGEERSISGDTVIPSVITDGMILSTPFLVGDVTLPTIETSGTLSDGEEGSIEIILNRISTEGVLEQQQNATIDVTLNSITTEGLIETEFAINGDVTINSITTELNGYIIGNTLTGDVLISSIETTGSISYSLEANIDITLNNITTEGELRVSGNILPSDVLIPSIQTEGQLAQTQEIDGPIVINNITTEGFLETRLEITGNVLINSISSNGELKKLSARRRFMNIV
Physico‐chemical
properties
protein length:1383 AA
molecular weight: 150211,47640 Da
isoelectric point:4,58704
aromaticity:0,10412
hydropathy:-0,05886

Taxonomy

Phage
Agrobacterium phage Atu_ph07 [NCBI] · taxon 2024264
Uroviricota Caudoviricetes Polybotosvirus
Host
Agrobacterium tumefaciens [NCBI] · taxon 358
cellular organisms Bacteria Pseudomonadati Pseudomonadota Alphaproteobacteria Hyphomicrobiales

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession
YP_009612238.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_042013 [NCBI]
CDS location
range 404199 -> 408350
strand -
CDS
ATGCTATTAAATGTCACAGAGGTAACTTCGAATTTATCATCGACACGAAATCTTGCATTTTCTGCGGATGGGGAATGGATTGCTGCCGTTCCACAAATAACAACCGCAAGCACAACATTTCAAGTTTATAAAAAAACAAGTGCCGGTAATTTTGATGATCCCGCTATAAATGTATCAATACCAGTATCAAATGCCAGTATTGATTATGTAACCATTTCTCCAAATTCTCAGAAAATGGCTGTTGCTACTGGTATCAATAAAGTATACCTTTATAATTTAGTAGGAGGCGTTTGGACTTATTATAATGAGTTGACACCACCTGCACGCCCGGTATCAGTGAAATATGCACAAGATAGTAACGACTTGCTCGTTAATTGTAATAATGGCGTATCACTTGTATACAATACCGATCTTCTGACGCAGTTATACACTGTTACAAGAAGTGTACAACAAGTATTGGTGGATTCGTCATTAAGTGCAGATACGAATATTTTCATTTCGTCATCAGCAACAACGAACTCAACCTCATATGGTGTCTTTATATATACCAAAACCGGTGGAACATACACAACCGCGCAAGTAACAAATTTTTCTAACTCAATTTATGGTATTAAGATTTCAGCAGACGGTTTAAAAATTTATATTTCTACTAATAACGGCGTATATATTCTTAGACGTGCGTCCTCAACGCAAACATTTAATCAGAGCATATATTATAGTAAAAGTACATCGCCAATATTGATTCGTGATTTCGGTATTTATGACGGGAAATATCTTATCGGTCCCGGTGCAACAACAGGTCTATTTGGTGCATACGATTCTACTGAAGCCAACAAATACCTCGAGACTTCAGTTTTATATGACACTCCTATTGATGGTCCCTCTATTCCAACAACATACATTAATTCTAGTACCTTTAGCGATAACCGTTTTGTTGCATATGTTTCTGGAACGGCACCAAAAGTATATTCTGTATCTAAAAAAACTGTTACTACTGCTAAGTTTTATGATGGCAATACCATCTCTGGATATTCTACTCCGGTATATCAATTTGTTTTATCAAAAGATAAAACCAAATTTTTCACTATGTTCTCGGCTAGATATAACAATAGCCCTACATATAATTTTGGTGACGTTAAAAATGGTCAACTTATACCAAACAATAAGTTATCATTTAATAATACACAAGCTGTTTCGGTTTCAGCCGGGACAGTGTCGTCTTTCTCTCCATCAAATAATTATTTTGCATTATCATCTGCTAATGTTTTACGCCTATTTAAATTATCTACGGACGGAGTATATGATGAACTTTCATATACTCCTGCGTTGTCAATAGCGCCGGTCGTTGCTGAATTTTCTCCAAATGAACAATACGTGGTATCTTTTAGTAGAACTGTTATTAATGTTCATAGTATTAATGGTACTCTTGCAACCAACGTAACAGTCAATCTCAACGGTGCAACATTAGCCGATTTGGCAAGTATTGTGTGGTATTCTAATACTCAATTTATTGTAAGCTCCTATAGCGCCGGTATGTATTTCTTTGAATATGATTCGGTCAATAACAGATTTAATTTGAAACGATCATTATTAACGTCTGAATATGAGAATAGATCAATGGTCTTATCTCAAGATAAGCGTTTTATCTATGCAATCAAAAACACGGCGGTTGGTTCATTTTGGGGTGCAAAATATACCATTACGGATTTTGACAATATTAGCTATACCGGTATTATAACAGACAACTATAGCAATACCGCTGCCGCTATTAAATTCATCCGCCTATCACCAGACGGTACAAAATTATTCATCACCGGTCAGAGTACCCCTTGGTTTGGAATGTACACGGTTGATACCGTATCAGGGGATATAACTCCTATAACATTAACTACCAAGGAAACTATTAACGCAACAGCGTATGGTTGTGATTGGTTAACTAATGAAACATTTTTCGTAGGTTATAATGGCGAATATGCTAATAACTGGTCATTAAAATCATACAGATATAATTCTTCAACCAATAGTGTTACAGATGATTCTACGTTATTAATTAACATGGTAACATATAGCAATATTAATGGCGCGGCTATAACAAGTGATGCCAAAAATATATATGTATCAGCACCATCAAACATTACCAGTACAACTGGCTTAACAAGATTTGAAAAAAATTCAGATGGAAGATATGTCAGAGTCCAGCAATTAAACAACGTTTCCACTGGTGGCGTATTAATTGTCGCTAATGGAAAATACATGCTTGCGATAACGGCGACAGCTACCAATAATGCACGCCTTTATGAACGTAATAGTGAAGGTCTATTTGTAGATTATACCGAATTTACCATATCCGGTACAATAAGTAGTTCATTCTTTCATAAAATTGACGAAAATAATATTGTTTTCATTACAAGCACATCTGGTGGTGGATATTTTCATTACCACATTTCAAACGAAGGTGTTGTTACTCAGAAACAAACTATTGACAGAATTAATGCGACATCATTCTATTATGTAGGACAATCTTATAATAGTCAGTACATATATTTTTCTGATACATCAACAAATCTTAGAATATTTGAAAAACAAGTTTCTGGAGATTATACACTAAAAACATCGCAGGCCGGTGTTAACGCCAATATATTCCGTCTGTGGTCAAGCCCAACAAACCCATCCGCAGGTATTATGAAACTATCAACTTCAATGACGTATGTTGATATAAATGCAGATGGAACTATAAATTTTGGGGCAACTATTCAGACAAATACAACAGCCGCTTGCTGGTATAATGATGGTAGTGGTTTCTTCATTACAGGAACAAACGCTACTAATAATGGTATAACGTCTACTTATTTGTTTGATAATTCATCAAAAAAATGGTTTAAAAACCCGGAGGTTATATATCCAACCGGTTCAATATCTGGCACATTAGTAAATGTTAATAGTGGGCTAGATATCACCAATCCTGCAAAAGACGTGGTTGTTTATATACAAGCTCAACCAACATCCATATCAACATCAACCATAACGGCTGGCGCTCGTGCAATAGGTATCCAATACGTTGAATCAGAAAAAGTAGTTACAGGATCGATTAATGTAGTTCTAAGTAGCATCGAGACCGAAGGTGAACTAGTCACTGATCTAGCTATAGACTCCGACACATTAATAAACCCAATAACAACAACAGGTGAAATAGATACACCTATTGCAGCTACGTTAGATATAACGTTAAATCCATTTATAATTTCTGGTTTCTTCGGTGAAAAATCAGAATATGACATCGATCTAACATTGACTACTGCATTTTCTATAGTAAGACCCGATAATTGGAGTGAGTTAACAACAACCCCATTAGAACAACCCTATGCATACGGTGACGTTAAGCTTCGTCCTATATCTAATGATGGATTGCTATCACTATTACCAGATGTATCAGGGGATGTGTTGATTAATTCAATTACATCAACCGGTATTCTTGGCGAAGAAAGATCAATCTCAGGCGATACAGTAATACCGTCTGTTATAACGGATGGCATGATTTTAAGCACGCCTTTCCTTGTTGGCGATGTAACATTACCAACAATCGAAACGTCAGGAACATTAAGCGACGGTGAAGAAGGTTCAATAGAAATCATATTGAATCGTATTAGTACCGAGGGTGTATTAGAACAACAGCAAAACGCTACTATTGATGTAACGCTGAATAGTATTACAACTGAAGGATTGATTGAAACAGAATTTGCAATCAATGGTGATGTAACAATCAATAGCATAACTACTGAATTAAATGGTTATATTATTGGTAACACCCTAACAGGGGACGTTTTAATTAGTTCTATCGAAACCACAGGGTCTATTTCGTATTCCCTCGAGGCAAACATAGACATAACATTGAATAATATTACTACAGAAGGTGAATTGCGCGTTTCTGGAAATATTTTACCGTCTGATGTATTGATACCAAGTATCCAAACTGAAGGTCAGCTTGCTCAGACACAAGAAATTGACGGCCCGATTGTTATTAATAATATTACAACGGAAGGCTTCTTAGAAACACGACTTGAAATCACCGGAAATGTTCTTATTAATAGCATTTCATCAAATGGCGAATTGAAAAAATTATCTGCAAGAAGAAGATTTATGAATATTGTATAA

Genome Context

Tertiary structure

YP_009612238.1
ESMFold2 structure
Source ESMFold2
pLDDT 62.1
Oligomeric state monomer
Download structure