Protein
View in Explore- Genbank accession
- BAW85692.1 [GenBank]
- Protein name
- tail spike protein
- RBP type
-
TSPTSPTSPTSP
- Protein sequence
-
MTNSLIQPKGSVSKETNIQSIARITGSKIEEVKYLEDGLDIAGLKFVYDSSTETIWKLNGNETGMVDSWNIVDESTIIIVTNISSYQINILEQIILSNDDAAGKIGTSNGLSVQKNLDNISNNITLDTGGVLKDALKFITPEMFVINNEKYIHGTTLDAVPYLQAAIDYGKTNNLPVVLSQRYPCITFPQTYELPRDDGTVYPGWITAGTDQNIDPEPIYTMRAAIRLYNDSVIIGTNMQTTGIRGNWSKTSGPYDLNGTIGVFISGDSGKDGYVRYHMHDLNISGFMIGRLCEGISAFSTEDNLQISSCGITGIFQGEDAVERGFIKLWYNIAGDVFGGQWLTRNYAYASTYLPPYPASDIYRAGWNDSSFTEKYHYYGDTSLNFTHTAYSSLDNFFNTYFFKTANSITTANGGRLSNNKQTGVWPLGEYKGITGRAKTVYSRYGREILNCNILEAKIMWSPRTPFYHTSQSGSWVGNSKIGNVILERVGIINYAAGNTTGNRFNVDNVDPWDPSQNFFPAMVCRGNIGCMDVTRSGHVQQSVSNEINPIVTGGQIHRQYRRSDDTSSYSMLTLQEFKNSWVSKYVFNSSYAFVQPLVFTSSNAQFKYDYGTFTPVLQIAGSYITLTEATGIYHRFGDIIRIHIRLRNSNLTINTAGPFRISGLPFISSSIQTGYTKGSVFTPQATGVTLIPLVTPSTDVLTILKDSAGTSFSHPAGTFDFSFHADFDYVISFNS
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 736 AA molecular weight: 81533,27150 Da isoelectric point: 5,69984 aromaticity: 0,11957 hydropathy: -0,23030
Domains
Domains [InterPro]
G3DSA:3.30.2020.50
1–93
1–93
1
736
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Klebsiella phage K64-1 [NCBI] |
1439894 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host |
Klebsiella pneumoniae [NCBI] |
573 | Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Klebsiella |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
BAW85692.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
LC121098.1
[NCBI]
CDS location
range 1 -> 2211
strand +
strand +
CDS
ATGACAAATAGTTTAATACAACCGAAAGGTTCAGTTTCTAAAGAAACTAATATACAAAGCATAGCAAGAATTACTGGGTCAAAAATTGAGGAAGTAAAATATTTAGAAGATGGACTAGATATTGCTGGTTTAAAATTTGTATATGATTCCAGTACTGAAACAATTTGGAAACTTAATGGGAATGAAACAGGGATGGTTGATTCTTGGAATATTGTAGATGAATCAACTATTATTATAGTAACTAATATATCATCATATCAAATTAATATTTTAGAACAAATTATTCTTTCTAATGATGATGCTGCTGGTAAAATTGGAACTAGTAACGGGTTATCAGTACAAAAAAATTTGGATAATATTTCAAATAATATAACACTTGATACTGGTGGAGTATTAAAAGATGCATTAAAATTTATAACTCCAGAAATGTTTGTCATTAATAATGAAAAATATATACATGGAACTACATTAGATGCAGTTCCTTATTTACAAGCGGCAATTGATTATGGAAAAACTAATAATTTACCAGTTGTATTGTCACAAAGATATCCATGTATAACATTTCCACAAACTTATGAATTACCAAGAGATGACGGTACTGTTTATCCGGGATGGATAACTGCCGGAACTGATCAAAATATAGATCCAGAACCAATTTATACAATGAGGGCAGCAATTAGACTATACAACGATTCTGTTATAATTGGAACAAATATGCAAACTACTGGTATTCGTGGTAATTGGAGCAAAACTAGTGGGCCATATGATTTAAATGGAACAATTGGTGTTTTTATTTCTGGTGATTCTGGAAAAGATGGTTATGTAAGATATCATATGCATGATTTAAATATATCAGGATTTATGATTGGTAGATTATGTGAAGGAATTAGTGCATTTTCAACTGAGGATAATTTACAAATTTCAAGTTGTGGAATAACCGGGATATTTCAAGGTGAAGACGCAGTTGAAAGAGGATTTATTAAATTATGGTATAATATAGCAGGTGATGTATTTGGTGGGCAATGGCTAACAAGAAACTATGCTTATGCATCAACTTATTTACCACCATATCCTGCATCAGACATTTATAGAGCAGGATGGAATGATTCTAGTTTCACTGAAAAATATCACTATTATGGTGATACAAGTCTTAATTTCACGCATACTGCATATTCTTCACTGGATAATTTTTTTAATACATATTTTTTTAAAACTGCTAATTCCATAACAACCGCAAATGGTGGTAGATTATCAAATAATAAACAAACTGGTGTATGGCCGTTGGGTGAATATAAAGGAATAACAGGTCGTGCCAAAACTGTATATTCAAGATATGGTCGTGAAATATTAAATTGTAATATTTTAGAAGCCAAAATAATGTGGTCTCCGAGAACTCCATTTTATCATACATCACAATCAGGTTCATGGGTAGGTAATAGTAAAATAGGAAATGTAATTTTAGAAAGAGTTGGTATAATCAATTATGCTGCCGGTAATACAACCGGTAATCGTTTTAATGTAGATAACGTAGACCCTTGGGATCCTTCACAAAATTTCTTCCCAGCAATGGTATGTAGAGGTAATATTGGTTGTATGGATGTTACTAGATCTGGACATGTTCAACAATCAGTCTCAAATGAAATAAACCCAATTGTTACTGGTGGTCAAATACATAGACAATATAGAAGATCAGATGATACTAGTAGTTATTCAATGTTAACCCTTCAGGAGTTTAAAAATAGTTGGGTAAGCAAATACGTTTTCAATAGTTCATATGCATTTGTTCAACCGTTGGTATTCACTTCATCAAATGCACAATTTAAATATGATTATGGAACATTTACTCCTGTACTTCAAATTGCAGGAAGTTATATAACTCTAACGGAAGCAACTGGTATATATCACAGATTCGGTGATATAATCAGAATACATATAAGATTGAGAAATAGTAATTTGACTATTAATACGGCTGGACCATTTAGAATATCTGGTTTACCATTTATTTCAAGCTCAATTCAAACTGGATATACAAAAGGTAGTGTGTTTACTCCACAGGCAACTGGTGTGACATTAATACCATTAGTTACTCCAAGTACTGATGTATTAACAATTTTAAAAGATAGTGCAGGAACCTCATTTTCACATCCAGCAGGAACTTTTGATTTTTCTTTCCACGCTGATTTTGATTATGTAATATCATTCAATAGCTAA
Tertiary structure
PDB ID
60b506f9ff430e65893f1b4612128098a96de15f7cf858c0678f560f28b86f3a
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Klebsiella Phage PhiK64-1 Encodes Multiple Depolymerases for Multiple Host Capsular Types | Pan,Y.J., Lin,T.L., Chen,C.C., Tsai,Y.T., Cheng,Y.H., Chen,Y.Y., Hsieh,P.F., Lin,Y.T. and Wang,J.T. | 2017 | 28077636 | GenBank |