Protein

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Genbank accession
WPK39153.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,90
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MSSKIKFTDQYILSSVGQTSNNIVYLQVNDDQQLVVTHPMYATEWSTLGGLRVTGDQSKFDGSLEVGYELLVGQTSTFNNDMVVNGLVTVNRDSLDAMLIHGNVTLHGNLTVVGSSSGTTPGQVTISDNIMVVNTDDVGPGVTATYSGFEVQRGIPVGETNSHGEPGQGKLPSAGLVWNEVQKSWDLNYNPILSEKLPQNPRIINLGQPVADNDASTKKYVNDSITAALDDDIYLDRLTDVTISSPANKNILQYDSSTSQWRNLPYSFIRLTDVTGVSVPRGYVRWNAAGTQLVYETTIDYAQLTGLSDVAKAGQGSLSFLSDVTLSSLSNTQALFYNGTSWVNRLINYSDIQNTPTNNSYSFIGLNDTNNTVVNNGYVRWNAAGTQLVYETTIDYAQLTGLSDVAKAGQGSLDYLTDVSIGTASSGNVLRYNGTNWVNQVLSYTDLSNTPTNNSYSFIGLNDTNDTALSGGYLRWNPTGTQIVYQSTIDYAQLTGLSSVAKAGQGALSFLSDVTISSPGASNTLRYDTTSSKWVNTRLAYSDLTGQPTSANYQLVGLSDTASTSVPLGYLRWNSAGTQVTYATTIDISVISGKSTVASAGSATLSNLEDAAVTTPAGGNTLIWNASTNKWTNGILDVSNITNAVPVSRTVSAGTGLSGGGNLSSNITLSVNRTLTDTWYAAASHTHDASNITSGVIANARLPVGSTTAQGILQLTDSVASTSTTTAATPNSVKTAYDLATTKANISHTHDASNITTGTIAVARLPVSSTTAQGIVQLTDGVASTSTTTAATPNSVKTAYDLATTKANASHTHDASNITSGVIANARLPFASTTVYGIVTLLDSVASTSISTAATPNSVKTAYDLATTKANISHTHTPVQVGLSNISNNGNTITGNTTISGALSVTGNAVFNTSDIKLKDNIQPIKNPVELLSKISGYTYTRNDCNNEKQTGIIAQEVETIQPESVREVDGIKTVNHNGIIALLVSAVNELSKEIEELKQQLSYKKRD
Physico‐chemical
properties
protein length:1008 AA
molecular weight: 106511,15540 Da
isoelectric point:4,97400
aromaticity:0,06448
hydropathy:-0,18760

Domains

Domains [InterPro]
DC_0911
ATT
1–387
DC_0911 DC_0165 DC_0613
IPR005068
STR
706–745
IPR005068 IPR005068 IPR005068 IPR030392
IPR030392
CHP
914–966
IPR030392 Coil
WPK39153.1
1 1008
Architecture
ATT
STR
RBD
STR
RBD
STR
RBD
STR
RBD
ATT 1-387 | STR 442-542 | RBD 680-705 | STR 706-745 | RBD 746-768 | STR 769-808 | RBD 809-831 | STR 832-871 | RBD 872-1006 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Pseudomonas phage Cassandra
[NCBI] 		3092175 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Pseudomonas aeruginosa PAO1
[NCBI] 		208964 Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Pseudomonadales > Pseudomonadaceae > Pseudomonas

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WPK39153.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OR805292.1 [NCBI]
CDS location
range 249654 -> 252680
strand +
CDS
ATGTCGAGTAAAATTAAATTCACGGATCAATATATCCTATCTAGTGTTGGGCAAACTTCTAATAATATAGTATATTTGCAAGTAAATGATGATCAGCAATTAGTTGTTACTCATCCTATGTATGCAACTGAATGGTCTACATTAGGTGGGCTTAGAGTAACAGGTGATCAGTCTAAATTTGATGGATCATTAGAAGTTGGATATGAATTGCTAGTAGGACAAACATCTACCTTTAACAATGACATGGTAGTAAACGGTTTAGTTACAGTAAACAGAGATTCTCTAGATGCGATGCTCATTCACGGGAATGTTACATTACATGGCAACTTAACTGTAGTAGGTAGCAGCTCAGGGACTACACCCGGGCAAGTAACTATTTCCGACAACATTATGGTTGTGAATACAGATGACGTAGGTCCAGGCGTCACTGCAACATATTCTGGTTTTGAAGTCCAACGTGGAATTCCCGTAGGCGAAACTAATAGTCACGGTGAACCCGGCCAAGGTAAATTGCCTTCTGCTGGTTTAGTTTGGAATGAAGTGCAAAAATCCTGGGATCTTAATTATAACCCTATTCTTTCTGAAAAATTACCACAAAATCCTAGAATAATTAACTTAGGGCAGCCAGTTGCTGACAACGATGCTTCTACAAAAAAATATGTGAATGATAGCATAACTGCTGCACTCGACGATGATATTTATTTAGATAGACTTACTGATGTAACAATTTCTTCTCCGGCTAATAAAAATATACTACAGTACGATTCTTCTACATCGCAATGGAGAAATTTACCATATTCGTTTATACGATTAACGGATGTAACTGGTGTATCTGTCCCGAGAGGATATGTGAGATGGAATGCAGCAGGAACACAGTTAGTATATGAAACCACTATAGATTATGCACAGTTAACTGGGTTGTCTGATGTAGCTAAAGCAGGACAAGGATCTCTAAGTTTTCTTAGTGATGTAACATTATCATCGTTATCTAATACACAGGCATTATTTTATAATGGAACCTCTTGGGTTAATAGACTAATTAATTACTCCGACATTCAAAATACTCCTACTAACAATTCGTATAGTTTTATTGGATTAAATGATACAAATAATACAGTTGTTAATAACGGATATGTGAGATGGAATGCAGCAGGAACACAGTTAGTATATGAAACCACTATAGATTATGCACAGTTAACTGGGTTGTCTGATGTAGCTAAAGCAGGACAAGGATCGTTAGATTATTTAACAGATGTTAGTATAGGAACTGCTAGCTCTGGTAATGTGCTAAGATATAACGGAACTAATTGGGTAAACCAAGTATTATCATATACTGATCTTTCTAATACTCCTACTAACAATTCGTATAGTTTTATTGGATTAAATGATACTAACGATACTGCACTGTCGGGCGGCTATTTACGATGGAATCCCACTGGAACACAGATAGTATATCAATCCACTATAGATTATGCCCAGTTAACTGGGTTATCTTCTGTTGCTAAAGCAGGACAAGGGGCTCTAAGTTTTCTTAGTGATGTAACTATATCGTCACCTGGCGCTAGTAATACATTGCGATACGATACTACTTCGTCTAAATGGGTAAACACTAGACTTGCTTATTCCGATTTAACAGGTCAACCAACCTCTGCTAATTATCAACTAGTTGGGTTAAGTGATACTGCAAGCACATCTGTACCACTTGGATATCTTAGATGGAACTCCGCTGGAACTCAAGTAACATATGCTACTACGATAGATATATCAGTTATATCTGGTAAATCTACTGTAGCTTCTGCTGGTTCAGCAACACTATCTAATCTAGAAGATGCTGCTGTTACAACGCCTGCTGGCGGGAATACTTTAATATGGAATGCGTCTACAAATAAATGGACAAACGGCATATTAGATGTATCTAATATTACTAATGCTGTACCTGTTAGTAGAACAGTATCTGCAGGAACTGGACTATCTGGCGGAGGAAATTTATCTAGTAATATTACGTTGTCGGTTAATAGAACATTAACTGATACATGGTATGCTGCTGCATCACATACTCATGATGCATCTAATATTACGTCTGGTGTTATTGCGAATGCTAGACTGCCAGTTGGAAGCACAACAGCACAAGGTATTTTACAGTTAACAGATAGTGTTGCTAGCACATCTACAACTACTGCCGCTACACCTAATTCAGTAAAAACTGCATATGATTTGGCAACGACAAAAGCTAATATATCACATACTCATGATGCATCTAATATTACTACTGGTACTATTGCTGTAGCCAGACTTCCAGTTTCGTCTACTACTGCACAAGGTATAGTTCAGCTTACTGACGGTGTTGCTAGCACATCTACAACTACTGCTGCTACACCCAATTCAGTAAAAACTGCATATGATTTGGCAACGACAAAAGCTAATGCTTCTCACACCCATGATGCATCTAATATTACGTCTGGTGTTATTGCGAATGCTAGACTGCCGTTTGCCTCAACTACTGTATATGGTATAGTAACTCTGTTAGATTCAGTTGCCAGTACATCTATATCTACTGCTGCTACACCGAATTCGGTGAAAACTGCATATGACTTAGCAACGACAAAAGCTAATATATCACATACACATACTCCTGTTCAAGTAGGTTTATCGAATATTTCTAATAACGGAAATACTATAACGGGAAATACAACTATATCCGGTGCATTGTCAGTAACAGGAAATGCTGTTTTTAATACATCTGATATAAAATTAAAAGATAATATACAGCCCATTAAAAATCCAGTAGAACTTCTTAGCAAAATTTCAGGATATACCTATACTAGAAATGATTGTAATAACGAAAAACAAACCGGTATTATTGCGCAGGAAGTTGAAACGATACAACCTGAAAGTGTAAGAGAGGTAGACGGTATAAAAACTGTAAACCATAATGGAATAATTGCACTGTTAGTTAGTGCAGTTAATGAACTTTCTAAAGAAATAGAAGAATTAAAACAACAACTTTCTTACAAAAAAAGGGACTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
9b4fd9e9718e38ec8f9744cdbaa26d697cbd660b25d13470eebc1c98cb85ea33
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2927
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Phage Paride can kill dormant, antibiotic-tolerant cells Maffei,E., Harms,A. and Humolli,D. — — GenBank