Protein

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Genbank accession
WPK39153.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,90
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,99
Protein sequence
MSSKIKFTDQYILSSVGQTSNNIVYLQVNDDQQLVVTHPMYATEWSTLGGLRVTGDQSKFDGSLEVGYELLVGQTSTFNNDMVVNGLVTVNRDSLDAMLIHGNVTLHGNLTVVGSSSGTTPGQVTISDNIMVVNTDDVGPGVTATYSGFEVQRGIPVGETNSHGEPGQGKLPSAGLVWNEVQKSWDLNYNPILSEKLPQNPRIINLGQPVADNDASTKKYVNDSITAALDDDIYLDRLTDVTISSPANKNILQYDSSTSQWRNLPYSFIRLTDVTGVSVPRGYVRWNAAGTQLVYETTIDYAQLTGLSDVAKAGQGSLSFLSDVTLSSLSNTQALFYNGTSWVNRLINYSDIQNTPTNNSYSFIGLNDTNNTVVNNGYVRWNAAGTQLVYETTIDYAQLTGLSDVAKAGQGSLDYLTDVSIGTASSGNVLRYNGTNWVNQVLSYTDLSNTPTNNSYSFIGLNDTNDTALSGGYLRWNPTGTQIVYQSTIDYAQLTGLSSVAKAGQGALSFLSDVTISSPGASNTLRYDTTSSKWVNTRLAYSDLTGQPTSANYQLVGLSDTASTSVPLGYLRWNSAGTQVTYATTIDISVISGKSTVASAGSATLSNLEDAAVTTPAGGNTLIWNASTNKWTNGILDVSNITNAVPVSRTVSAGTGLSGGGNLSSNITLSVNRTLTDTWYAAASHTHDASNITSGVIANARLPVGSTTAQGILQLTDSVASTSTTTAATPNSVKTAYDLATTKANISHTHDASNITTGTIAVARLPVSSTTAQGIVQLTDGVASTSTTTAATPNSVKTAYDLATTKANASHTHDASNITSGVIANARLPFASTTVYGIVTLLDSVASTSISTAATPNSVKTAYDLATTKANISHTHTPVQVGLSNISNNGNTITGNTTISGALSVTGNAVFNTSDIKLKDNIQPIKNPVELLSKISGYTYTRNDCNNEKQTGIIAQEVETIQPESVREVDGIKTVNHNGIIALLVSAVNELSKEIEELKQQLSYKKRD
Physico‐chemical
properties
protein length:1008 AA
molecular weight: 106511,15540 Da
isoelectric point:4,97400
aromaticity:0,06448
hydropathy:-0,18760

Domains

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Domain architecture
WPK39153.1
1 1008 aa
STR 706–745 · STR 769–808 · STR 832–871 · CHP 914–1002 ·
ATT Attachment Domain STR Structural Domain RBD Receptor-Binding Domain CBM Carbohydrate-Binding Module LEC Lectin-like Domain ENZ Enzymatic Domain CHP Intramolecular Chaperone LNK Linker/Spacer Domain TAS Tail-Associated Structural TTP Tail Tubular Protein UNK Uncharacterized Domain Unmapped
Proteins with similar domain architecture

Taxonomy

Phage
Pseudomonas phage Cassandra [NCBI] · taxon 3092175
Viruses Duplodnaviria Heunggongvirae Uroviricota Caudoviricetes
Host
Pseudomonas aeruginosa PAO1 [NCBI] · taxon 208964
Bacteria Proteobacteria Gammaproteobacteria Pseudomonadales Pseudomonadaceae Pseudomonas

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession
WPK39153.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OR805292.1 [NCBI]
CDS location
range 249654 -> 252680
strand +
CDS
ATGTCGAGTAAAATTAAATTCACGGATCAATATATCCTATCTAGTGTTGGGCAAACTTCTAATAATATAGTATATTTGCAAGTAAATGATGATCAGCAATTAGTTGTTACTCATCCTATGTATGCAACTGAATGGTCTACATTAGGTGGGCTTAGAGTAACAGGTGATCAGTCTAAATTTGATGGATCATTAGAAGTTGGATATGAATTGCTAGTAGGACAAACATCTACCTTTAACAATGACATGGTAGTAAACGGTTTAGTTACAGTAAACAGAGATTCTCTAGATGCGATGCTCATTCACGGGAATGTTACATTACATGGCAACTTAACTGTAGTAGGTAGCAGCTCAGGGACTACACCCGGGCAAGTAACTATTTCCGACAACATTATGGTTGTGAATACAGATGACGTAGGTCCAGGCGTCACTGCAACATATTCTGGTTTTGAAGTCCAACGTGGAATTCCCGTAGGCGAAACTAATAGTCACGGTGAACCCGGCCAAGGTAAATTGCCTTCTGCTGGTTTAGTTTGGAATGAAGTGCAAAAATCCTGGGATCTTAATTATAACCCTATTCTTTCTGAAAAATTACCACAAAATCCTAGAATAATTAACTTAGGGCAGCCAGTTGCTGACAACGATGCTTCTACAAAAAAATATGTGAATGATAGCATAACTGCTGCACTCGACGATGATATTTATTTAGATAGACTTACTGATGTAACAATTTCTTCTCCGGCTAATAAAAATATACTACAGTACGATTCTTCTACATCGCAATGGAGAAATTTACCATATTCGTTTATACGATTAACGGATGTAACTGGTGTATCTGTCCCGAGAGGATATGTGAGATGGAATGCAGCAGGAACACAGTTAGTATATGAAACCACTATAGATTATGCACAGTTAACTGGGTTGTCTGATGTAGCTAAAGCAGGACAAGGATCTCTAAGTTTTCTTAGTGATGTAACATTATCATCGTTATCTAATACACAGGCATTATTTTATAATGGAACCTCTTGGGTTAATAGACTAATTAATTACTCCGACATTCAAAATACTCCTACTAACAATTCGTATAGTTTTATTGGATTAAATGATACAAATAATACAGTTGTTAATAACGGATATGTGAGATGGAATGCAGCAGGAACACAGTTAGTATATGAAACCACTATAGATTATGCACAGTTAACTGGGTTGTCTGATGTAGCTAAAGCAGGACAAGGATCGTTAGATTATTTAACAGATGTTAGTATAGGAACTGCTAGCTCTGGTAATGTGCTAAGATATAACGGAACTAATTGGGTAAACCAAGTATTATCATATACTGATCTTTCTAATACTCCTACTAACAATTCGTATAGTTTTATTGGATTAAATGATACTAACGATACTGCACTGTCGGGCGGCTATTTACGATGGAATCCCACTGGAACACAGATAGTATATCAATCCACTATAGATTATGCCCAGTTAACTGGGTTATCTTCTGTTGCTAAAGCAGGACAAGGGGCTCTAAGTTTTCTTAGTGATGTAACTATATCGTCACCTGGCGCTAGTAATACATTGCGATACGATACTACTTCGTCTAAATGGGTAAACACTAGACTTGCTTATTCCGATTTAACAGGTCAACCAACCTCTGCTAATTATCAACTAGTTGGGTTAAGTGATACTGCAAGCACATCTGTACCACTTGGATATCTTAGATGGAACTCCGCTGGAACTCAAGTAACATATGCTACTACGATAGATATATCAGTTATATCTGGTAAATCTACTGTAGCTTCTGCTGGTTCAGCAACACTATCTAATCTAGAAGATGCTGCTGTTACAACGCCTGCTGGCGGGAATACTTTAATATGGAATGCGTCTACAAATAAATGGACAAACGGCATATTAGATGTATCTAATATTACTAATGCTGTACCTGTTAGTAGAACAGTATCTGCAGGAACTGGACTATCTGGCGGAGGAAATTTATCTAGTAATATTACGTTGTCGGTTAATAGAACATTAACTGATACATGGTATGCTGCTGCATCACATACTCATGATGCATCTAATATTACGTCTGGTGTTATTGCGAATGCTAGACTGCCAGTTGGAAGCACAACAGCACAAGGTATTTTACAGTTAACAGATAGTGTTGCTAGCACATCTACAACTACTGCCGCTACACCTAATTCAGTAAAAACTGCATATGATTTGGCAACGACAAAAGCTAATATATCACATACTCATGATGCATCTAATATTACTACTGGTACTATTGCTGTAGCCAGACTTCCAGTTTCGTCTACTACTGCACAAGGTATAGTTCAGCTTACTGACGGTGTTGCTAGCACATCTACAACTACTGCTGCTACACCCAATTCAGTAAAAACTGCATATGATTTGGCAACGACAAAAGCTAATGCTTCTCACACCCATGATGCATCTAATATTACGTCTGGTGTTATTGCGAATGCTAGACTGCCGTTTGCCTCAACTACTGTATATGGTATAGTAACTCTGTTAGATTCAGTTGCCAGTACATCTATATCTACTGCTGCTACACCGAATTCGGTGAAAACTGCATATGACTTAGCAACGACAAAAGCTAATATATCACATACACATACTCCTGTTCAAGTAGGTTTATCGAATATTTCTAATAACGGAAATACTATAACGGGAAATACAACTATATCCGGTGCATTGTCAGTAACAGGAAATGCTGTTTTTAATACATCTGATATAAAATTAAAAGATAATATACAGCCCATTAAAAATCCAGTAGAACTTCTTAGCAAAATTTCAGGATATACCTATACTAGAAATGATTGTAATAACGAAAAACAAACCGGTATTATTGCGCAGGAAGTTGAAACGATACAACCTGAAAGTGTAAGAGAGGTAGACGGTATAAAAACTGTAAACCATAATGGAATAATTGCACTGTTAGTTAGTGCAGTTAATGAACTTTCTAAAGAAATAGAAGAATTAAAACAACAACTTTCTTACAAAAAAAGGGACTAA

Genome Context

Tertiary structure

WPK39153.1
ColabFold structure
Source ColabFold
pLDDT 29.3
Oligomeric state monomer
Download structure

Literature

Title Authors Date PMID Source
Phage Paride can kill dormant, antibiotic-tolerant cells Maffei,E., Harms,A. and Humolli,D. — — GenBank