Protein

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Genbank accession
WPK39153.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,90
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MSSKIKFTDQYILSSVGQTSNNIVYLQVNDDQQLVVTHPMYATEWSTLGGLRVTGDQSKFDGSLEVGYELLVGQTSTFNNDMVVNGLVTVNRDSLDAMLIHGNVTLHGNLTVVGSSSGTTPGQVTISDNIMVVNTDDVGPGVTATYSGFEVQRGIPVGETNSHGEPGQGKLPSAGLVWNEVQKSWDLNYNPILSEKLPQNPRIINLGQPVADNDASTKKYVNDSITAALDDDIYLDRLTDVTISSPANKNILQYDSSTSQWRNLPYSFIRLTDVTGVSVPRGYVRWNAAGTQLVYETTIDYAQLTGLSDVAKAGQGSLSFLSDVTLSSLSNTQALFYNGTSWVNRLINYSDIQNTPTNNSYSFIGLNDTNNTVVNNGYVRWNAAGTQLVYETTIDYAQLTGLSDVAKAGQGSLDYLTDVSIGTASSGNVLRYNGTNWVNQVLSYTDLSNTPTNNSYSFIGLNDTNDTALSGGYLRWNPTGTQIVYQSTIDYAQLTGLSSVAKAGQGALSFLSDVTISSPGASNTLRYDTTSSKWVNTRLAYSDLTGQPTSANYQLVGLSDTASTSVPLGYLRWNSAGTQVTYATTIDISVISGKSTVASAGSATLSNLEDAAVTTPAGGNTLIWNASTNKWTNGILDVSNITNAVPVSRTVSAGTGLSGGGNLSSNITLSVNRTLTDTWYAAASHTHDASNITSGVIANARLPVGSTTAQGILQLTDSVASTSTTTAATPNSVKTAYDLATTKANISHTHDASNITTGTIAVARLPVSSTTAQGIVQLTDGVASTSTTTAATPNSVKTAYDLATTKANASHTHDASNITSGVIANARLPFASTTVYGIVTLLDSVASTSISTAATPNSVKTAYDLATTKANISHTHTPVQVGLSNISNNGNTITGNTTISGALSVTGNAVFNTSDIKLKDNIQPIKNPVELLSKISGYTYTRNDCNNEKQTGIIAQEVETIQPESVREVDGIKTVNHNGIIALLVSAVNELSKEIEELKQQLSYKKRD
Physico‐chemical
properties
protein length:1008 AA
molecular weight: 106511,15540 Da
isoelectric point:4,97400
aromaticity:0,06448
hydropathy:-0,18760

Domains

Domains [InterPro]
IPR005068
706–745
IPR005068 IPR005068 IPR005068 IPR030392
IPR030392
914–966
IPR030392 Coil
WPK39153.1
1 1008
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Pseudomonas phage Cassandra
[NCBI] 		3092175 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WPK39153.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OR805292 [NCBI]
CDS location
range 249654 -> 252680
strand +
CDS
ATGTCGAGTAAAATTAAATTCACGGATCAATATATCCTATCTAGTGTTGGGCAAACTTCTAATAATATAGTATATTTGCAAGTAAATGATGATCAGCAATTAGTTGTTACTCATCCTATGTATGCAACTGAATGGTCTACATTAGGTGGGCTTAGAGTAACAGGTGATCAGTCTAAATTTGATGGATCATTAGAAGTTGGATATGAATTGCTAGTAGGACAAACATCTACCTTTAACAATGACATGGTAGTAAACGGTTTAGTTACAGTAAACAGAGATTCTCTAGATGCGATGCTCATTCACGGGAATGTTACATTACATGGCAACTTAACTGTAGTAGGTAGCAGCTCAGGGACTACACCCGGGCAAGTAACTATTTCCGACAACATTATGGTTGTGAATACAGATGACGTAGGTCCAGGCGTCACTGCAACATATTCTGGTTTTGAAGTCCAACGTGGAATTCCCGTAGGCGAAACTAATAGTCACGGTGAACCCGGCCAAGGTAAATTGCCTTCTGCTGGTTTAGTTTGGAATGAAGTGCAAAAATCCTGGGATCTTAATTATAACCCTATTCTTTCTGAAAAATTACCACAAAATCCTAGAATAATTAACTTAGGGCAGCCAGTTGCTGACAACGATGCTTCTACAAAAAAATATGTGAATGATAGCATAACTGCTGCACTCGACGATGATATTTATTTAGATAGACTTACTGATGTAACAATTTCTTCTCCGGCTAATAAAAATATACTACAGTACGATTCTTCTACATCGCAATGGAGAAATTTACCATATTCGTTTATACGATTAACGGATGTAACTGGTGTATCTGTCCCGAGAGGATATGTGAGATGGAATGCAGCAGGAACACAGTTAGTATATGAAACCACTATAGATTATGCACAGTTAACTGGGTTGTCTGATGTAGCTAAAGCAGGACAAGGATCTCTAAGTTTTCTTAGTGATGTAACATTATCATCGTTATCTAATACACAGGCATTATTTTATAATGGAACCTCTTGGGTTAATAGACTAATTAATTACTCCGACATTCAAAATACTCCTACTAACAATTCGTATAGTTTTATTGGATTAAATGATACAAATAATACAGTTGTTAATAACGGATATGTGAGATGGAATGCAGCAGGAACACAGTTAGTATATGAAACCACTATAGATTATGCACAGTTAACTGGGTTGTCTGATGTAGCTAAAGCAGGACAAGGATCGTTAGATTATTTAACAGATGTTAGTATAGGAACTGCTAGCTCTGGTAATGTGCTAAGATATAACGGAACTAATTGGGTAAACCAAGTATTATCATATACTGATCTTTCTAATACTCCTACTAACAATTCGTATAGTTTTATTGGATTAAATGATACTAACGATACTGCACTGTCGGGCGGCTATTTACGATGGAATCCCACTGGAACACAGATAGTATATCAATCCACTATAGATTATGCCCAGTTAACTGGGTTATCTTCTGTTGCTAAAGCAGGACAAGGGGCTCTAAGTTTTCTTAGTGATGTAACTATATCGTCACCTGGCGCTAGTAATACATTGCGATACGATACTACTTCGTCTAAATGGGTAAACACTAGACTTGCTTATTCCGATTTAACAGGTCAACCAACCTCTGCTAATTATCAACTAGTTGGGTTAAGTGATACTGCAAGCACATCTGTACCACTTGGATATCTTAGATGGAACTCCGCTGGAACTCAAGTAACATATGCTACTACGATAGATATATCAGTTATATCTGGTAAATCTACTGTAGCTTCTGCTGGTTCAGCAACACTATCTAATCTAGAAGATGCTGCTGTTACAACGCCTGCTGGCGGGAATACTTTAATATGGAATGCGTCTACAAATAAATGGACAAACGGCATATTAGATGTATCTAATATTACTAATGCTGTACCTGTTAGTAGAACAGTATCTGCAGGAACTGGACTATCTGGCGGAGGAAATTTATCTAGTAATATTACGTTGTCGGTTAATAGAACATTAACTGATACATGGTATGCTGCTGCATCACATACTCATGATGCATCTAATATTACGTCTGGTGTTATTGCGAATGCTAGACTGCCAGTTGGAAGCACAACAGCACAAGGTATTTTACAGTTAACAGATAGTGTTGCTAGCACATCTACAACTACTGCCGCTACACCTAATTCAGTAAAAACTGCATATGATTTGGCAACGACAAAAGCTAATATATCACATACTCATGATGCATCTAATATTACTACTGGTACTATTGCTGTAGCCAGACTTCCAGTTTCGTCTACTACTGCACAAGGTATAGTTCAGCTTACTGACGGTGTTGCTAGCACATCTACAACTACTGCTGCTACACCCAATTCAGTAAAAACTGCATATGATTTGGCAACGACAAAAGCTAATGCTTCTCACACCCATGATGCATCTAATATTACGTCTGGTGTTATTGCGAATGCTAGACTGCCGTTTGCCTCAACTACTGTATATGGTATAGTAACTCTGTTAGATTCAGTTGCCAGTACATCTATATCTACTGCTGCTACACCGAATTCGGTGAAAACTGCATATGACTTAGCAACGACAAAAGCTAATATATCACATACACATACTCCTGTTCAAGTAGGTTTATCGAATATTTCTAATAACGGAAATACTATAACGGGAAATACAACTATATCCGGTGCATTGTCAGTAACAGGAAATGCTGTTTTTAATACATCTGATATAAAATTAAAAGATAATATACAGCCCATTAAAAATCCAGTAGAACTTCTTAGCAAAATTTCAGGATATACCTATACTAGAAATGATTGTAATAACGAAAAACAAACCGGTATTATTGCGCAGGAAGTTGAAACGATACAACCTGAAAGTGTAAGAGAGGTAGACGGTATAAAAACTGTAAACCATAATGGAATAATTGCACTGTTAGTTAGTGCAGTTAATGAACTTTCTAAAGAAATAGAAGAATTAAAACAACAACTTTCTTACAAAAAAAGGGACTAA

Tertiary structure

PDB ID
9b4fd9e9718e38ec8f9744cdbaa26d697cbd660b25d13470eebc1c98cb85ea33
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2534
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Phage Paride can kill dormant, antibiotic-tolerant cells Maffei,E., Harms,A. and Humolli,D. — — GenBank