Genbank accession
QDF14444.1 [GenBank]
Protein name
tail protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,42
Seq2Symm
C3 confidence 0,963
C3 0,963
C1 0,431
C6 0,002
Predicted homo-oligomer symmetry (Seq2Symm, per-class probabilities; C1 = monomer, C2 = dimer, C3 = trimer).
Protein sequence
MIENTLPRKLVLGSIVPGYTKVYIPHSIFEDEDIVGKVFWVNNTKFVDTNTSVFYTIIDNLTQNTTYDDIIGSYYDAMIDSELLDNKIGLNLSDVATTKTLAYPTIDNVIVGAQEVDVGVGDPIITMDILGSADSIRIDKKLSSEDDTKWAPAYSGSPDGVSFTTGRGTYDFRVVGFIYFPDGVTTEFSPYNIVRNVKVENMFRPPSAPNNVSFKVAKIMDGMERYDLQVAWDWNKGTGSSVREFVLYFVETSEYNKTRWEKASKVNSGAAQASVITSFPFNKEYKFKVASVAWGPDDQAIVDSSIATFKIDKNTPIDSSFTNNTGIEVTYDHIKAYRNISGSKEQTFLLDANTGALAIGKLDIHGKAPVSVDPNSGNVNVDGAVISKTMYSASFVLSNLTGKDNPSIRTASKTGFGQSAQGMWMGYANNDSKFKFDLGDSTSFIRWDGNKLIISGKVQIGTPGGNVDIDKGIQGNFVANIYKASQTKPGKPTSNAFPPTGWSEVPITSSSGLVWISTAVIDSKTNKVAANSAWSTPIQFTAAAGKDGIASVLIYRQSVSKPSTPTNKAIPPSGWSLQIPARIAGQSIWVCSAIRTGTEPNITGSWSAPSKLSGDDGKPGANGKPGADGKPGANGKPGADGRPGSNGVRGPGFYAQAISGFSRFNNTSAATFFRNTFNSNPVKYDVLTQFNSSNPAIAETKQWNGSSWVSAALLVHGNMLVNGSITTEKIVADNAFLQKIGVNKIYDNSAAQSSNPEATYKMKIDLSAGSIHIR
Physico‐chemical
properties
protein length:774 AA
molecular weight: 83213,15540 Da
isoelectric point:7,59923
aromaticity:0,09819
hydropathy:-0,27326

Taxonomy

Host
Vibrio campbellii ATCC BAA-1116 [NCBI] · taxon 2902295

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession
QDF14444.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MK895508 [NCBI]
CDS location
range 24113 -> 26437
strand +
CDS
ATGATTGAAAACACACTGCCTAGGAAACTAGTCCTAGGCTCTATTGTACCGGGATATACTAAAGTGTACATCCCACACTCTATCTTTGAGGACGAGGATATAGTTGGTAAGGTATTCTGGGTAAACAATACTAAGTTCGTAGATACCAATACAAGTGTATTCTATACTATTATTGATAACCTAACACAGAATACAACATATGATGATATCATAGGGTCTTATTATGACGCTATGATTGATTCTGAGTTATTAGATAATAAGATAGGTCTTAATTTATCTGATGTAGCTACCACTAAGACATTAGCGTACCCTACTATAGATAATGTTATAGTAGGGGCTCAGGAAGTCGATGTCGGCGTAGGCGATCCTATAATTACAATGGATATACTTGGTTCTGCCGACTCTATTCGTATAGACAAAAAGCTGTCATCAGAAGACGATACTAAATGGGCACCTGCATACAGTGGTAGCCCTGATGGTGTGTCTTTTACTACAGGTAGAGGCACGTATGACTTTAGGGTCGTTGGGTTTATTTACTTTCCTGATGGTGTTACTACAGAATTCTCTCCTTATAATATAGTAAGAAATGTTAAAGTAGAGAACATGTTCCGTCCACCAAGTGCTCCTAATAATGTCTCATTTAAGGTAGCAAAAATAATGGATGGGATGGAGAGGTATGATCTACAAGTCGCTTGGGACTGGAATAAAGGTACTGGCAGTTCTGTCAGAGAATTTGTTCTTTACTTTGTAGAGACTAGCGAGTATAATAAAACCAGATGGGAAAAAGCCAGCAAGGTTAATAGTGGCGCGGCTCAAGCCTCTGTTATTACAAGTTTCCCATTTAATAAAGAATATAAATTTAAGGTGGCGTCAGTAGCATGGGGGCCAGACGACCAAGCTATAGTAGACTCATCTATTGCTACCTTTAAGATTGATAAGAATACTCCAATAGATTCTTCATTCACTAATAATACTGGTATAGAAGTAACATATGACCATATAAAAGCTTATAGAAATATAAGTGGGTCTAAGGAACAAACATTCCTACTAGATGCAAATACAGGTGCTCTGGCAATAGGTAAACTTGATATTCATGGTAAAGCGCCAGTATCAGTAGACCCTAATAGTGGTAATGTAAACGTTGATGGGGCGGTAATATCCAAGACAATGTACTCTGCCTCGTTCGTGCTGTCCAATCTAACAGGTAAAGATAATCCTAGTATTAGGACTGCATCTAAAACTGGTTTTGGTCAGTCTGCCCAAGGTATGTGGATGGGCTATGCGAACAACGATTCTAAATTCAAGTTCGACCTAGGAGACTCTACTAGCTTCATAAGATGGGATGGGAATAAGTTAATTATTTCTGGTAAAGTTCAGATTGGTACCCCAGGCGGTAATGTTGATATTGATAAAGGTATACAAGGTAACTTCGTAGCTAATATCTACAAAGCATCACAAACAAAACCTGGTAAACCTACTAGTAACGCTTTCCCACCAACAGGGTGGAGCGAAGTACCTATTACAAGTTCTAGTGGGTTAGTGTGGATTTCTACAGCAGTAATTGATTCTAAAACTAATAAGGTAGCTGCCAATAGTGCATGGTCTACACCTATACAGTTTACAGCGGCCGCAGGTAAGGATGGTATAGCCTCAGTACTTATATACAGACAATCAGTGTCCAAACCTAGTACACCTACTAATAAAGCAATCCCTCCATCTGGGTGGTCATTACAGATTCCAGCTAGAATAGCCGGTCAATCTATCTGGGTATGCAGTGCTATTAGGACAGGTACAGAGCCTAATATAACAGGTAGCTGGTCAGCGCCAAGCAAGCTAAGCGGCGATGATGGTAAGCCAGGTGCTAATGGTAAGCCGGGGGCCGATGGTAAACCCGGTGCTAACGGTAAGCCGGGGGCCGATGGACGACCTGGGTCTAATGGTGTAAGAGGCCCAGGTTTCTATGCACAAGCAATCTCTGGATTCTCTAGATTTAATAACACTTCAGCAGCTACGTTCTTTAGGAACACGTTTAATAGCAACCCTGTTAAGTATGATGTATTAACACAATTCAATTCTAGCAATCCAGCCATAGCAGAAACTAAGCAATGGAATGGTTCTAGTTGGGTTAGTGCGGCTCTACTTGTTCATGGTAACATGCTTGTAAATGGGTCTATAACTACTGAGAAGATAGTGGCCGATAATGCTTTCTTACAGAAAATTGGAGTTAACAAAATCTATGATAATAGCGCAGCCCAATCATCTAACCCAGAAGCAACGTATAAAATGAAGATAGACCTCTCTGCAGGCTCTATACATATAAGATAA

Genome Context

Tertiary structure

QDF14444.1
ESMFold2 structure
Source ESMFold2
pLDDT 73.0
Oligomeric state monomer