Protein
- Genbank accession
- AFE87374.1 [GenBank]
- Protein name
- neck passage structure protein
- RBP type
-
TF
- Seq2Symm
-
C1 confidence 0,390
Predicted homo-oligomer symmetry (Seq2Symm, per-class probabilities; C1 = monomer, C2 = dimer, C3 = trimer).C1 0,390 C3 0,322 C2 0,030 - Protein sequence
-
MSLDNFRNRAIVWDTVNKDFPQPIQIMQGDVNARTLSVKIIDNGGEIDLTGHSLKLTYQYTNSSNSGFVMIPPENLTKGEFILVIPTEMTKAGVIEANLILLNEDKEQVIVSKNLTFISDNSTVTDLAQEVNNKIDDFTKLLLENMPQVLRSELNDLHAQTESNKSNIELKANQADLDNLRATVDKQGVAISTKAEQTDLNNLRATVDEQGVAISTKADKSEIYEKIKILDEKIPINKFKDGQKDFSLYTSPSENSLYVVNKPLSSGSIIAHVSSNKDQAGSILIVKKNGLTFTILSKKNINLTAGHNTVDMDYTVSGDGTEYLATVGVINFKPNSRPGFYQIAYGSNVGNVGDTFETVDHTDMAIDLGVYAEYKGQLEIIHDDLLNRIEKFNSLPSLTNFLLPRYTQITEPVGFVGRWFDSTISGTNVKSTINQGSELYFKVKNTTSINVNFIVNTAYETPYFAYSIDGADMTRQLVTSPTLPTVSLDEHIIRVVVDGVTESEDKWIGEKGFAFKDITVDSTGTVTGVLPKNKKIMFFGDSITEGIRVLNMNANSDGNSATGAFPYIASTNLNAISYRVGFGGAGVTKSGNGGVPSLINFIDNMTKNKLAPYYEPDVIVVNMGTNDIDAATDVFKSQYTAVINRLLIKYSGTPLFIMVPFNGARKSEITDITNNKKGVYMVDTTGWDISTTDGLHPDVAGSIKAGTKLSDYIISTLGRNYFI
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 723 AA molecular weight: 79312,50320 Da isoelectric point: 5,03061 aromaticity: 0,08160 hydropathy: -0,21342
Taxonomy
Phage
Lactococcus phage ASCC368
[NCBI]
· taxon 1165145
Host
No host information
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AFE87374.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
JQ740798
[NCBI]
CDS location
range 7079 -> 9250
strand +
strand +
CDS
ATGAGTTTAGATAATTTTAGAAATAGAGCGATTGTATGGGATACGGTCAATAAAGACTTCCCACAACCAATTCAAATAATGCAAGGCGACGTCAACGCTAGAACATTGTCAGTTAAAATAATTGATAATGGAGGCGAAATTGATTTGACGGGTCATTCATTAAAACTTACATATCAATATACTAATAGCAGTAATTCAGGCTTTGTTATGATTCCTCCTGAAAACTTAACTAAAGGAGAGTTTATTTTGGTAATTCCTACTGAAATGACAAAAGCCGGAGTTATTGAAGCGAACTTAATACTTCTCAATGAAGATAAAGAGCAGGTTATCGTCAGTAAGAACCTTACATTTATATCAGATAATTCTACAGTTACAGACTTAGCTCAAGAAGTAAATAATAAGATTGATGATTTCACTAAATTATTATTGGAAAATATGCCACAAGTACTGCGTAGTGAGTTGAATGACTTACATGCTCAAACTGAATCAAACAAGAGCAATATTGAGCTTAAAGCCAATCAAGCGGATTTAGACAACTTACGAGCTACTGTTGATAAACAAGGTGTTGCGATTTCAACAAAAGCTGAACAAACAGACTTGAACAACTTACGAGCTACTGTTGATGAACAAGGTGTTGCGATTTCAACAAAAGCAGATAAATCAGAAATTTATGAAAAAATAAAGATATTAGATGAAAAAATTCCTATTAATAAGTTCAAAGATGGTCAAAAAGATTTTTCTTTGTATACATCACCTAGTGAAAACTCATTATATGTTGTTAATAAGCCTTTATCATCTGGTAGTATCATTGCTCATGTTAGTTCAAATAAAGATCAAGCAGGTTCAATTTTAATCGTCAAAAAAAACGGTTTAACTTTTACAATATTATCCAAAAAAAATATCAATTTAACAGCAGGACATAACACCGTTGATATGGATTATACTGTATCAGGAGACGGGACTGAATATCTTGCTACGGTTGGTGTTATCAACTTTAAGCCGAACAGCAGGCCAGGATTTTATCAAATTGCTTATGGCTCTAACGTTGGTAATGTTGGAGACACTTTTGAAACAGTTGATCACACGGACATGGCCATTGATTTGGGTGTCTATGCTGAATATAAAGGTCAATTAGAAATAATTCATGATGACTTATTAAACCGTATTGAAAAATTTAATTCTTTACCATCTTTAACGAATTTCTTGCTTCCTAGATACACACAAATAACTGAACCAGTTGGTTTTGTTGGCCGGTGGTTCGATTCAACAATTAGTGGCACGAATGTTAAATCAACAATCAATCAAGGTTCGGAGTTATATTTTAAAGTAAAAAATACAACTTCTATTAACGTCAACTTTATTGTTAATACCGCTTATGAAACGCCTTACTTTGCTTATTCGATTGATGGTGCTGACATGACACGACAATTAGTTACGTCACCAACACTTCCCACAGTGTCATTAGACGAACACATTATCAGAGTTGTTGTTGATGGTGTAACCGAATCAGAAGATAAATGGATTGGTGAGAAGGGGTTCGCGTTTAAAGATATTACAGTTGACAGTACAGGCACTGTTACTGGAGTATTACCGAAAAATAAAAAAATTATGTTCTTCGGTGATAGTATAACAGAAGGCATTCGGGTCCTAAACATGAACGCTAATTCTGATGGTAATAGCGCGACAGGCGCATTCCCATATATTGCAAGCACTAATTTAAATGCTATCTCTTATCGTGTTGGCTTTGGCGGCGCTGGTGTTACTAAGAGCGGCAACGGCGGTGTTCCTTCATTGATTAACTTTATTGATAATATGACTAAAAATAAATTAGCGCCTTATTATGAACCTGATGTTATTGTCGTTAATATGGGAACAAATGATATCGACGCGGCTACTGACGTATTTAAATCACAATATACAGCCGTTATTAATAGATTATTGATTAAATATAGCGGTACACCATTATTTATTATGGTGCCATTTAACGGTGCTAGAAAAAGTGAAATAACAGATATAACTAATAATAAAAAAGGTGTCTACATGGTTGACACTACTGGGTGGGATATTTCAACAACAGATGGTCTTCACCCTGACGTTGCAGGTAGCATAAAAGCTGGTACTAAATTATCAGATTATATTATTAGCACTTTAGGTAGAAATTATTTTATTTAG
Genome Context
Tertiary structure
AFE87374.1
ESMFold2 structure
Source
ESMFold2
pLDDT
80.8
Oligomeric state
monomer