Protein

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Genbank accession
XQQ51542.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,89
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,72
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKTAGQRPAASVLAEGELAINLKDKTIFTKDDSGSVIELGLKYGGTINGSLEVTENITGTLIGNSSTATKLQTPRKINGISFDGSKDITLTPSDINVNSTTFIKNNGELPTDANLDTYGPIEEYLGVWSKSTSTNAQPANKFPEENAVGVLEVFVAGQFAGTQRYTVRSGNVYIRSLSAKWNGVDGPWGVWRNVQASTRPLSQTIDLDSLGELEHCGLWRNSSSAIASFDRHYPEEGSAAQGFLEIFEGGLYARTQRYTTRMGMVYTRCLAAAWDASAPKWEEWKQVGHGTPATFYDGDLNDFKTPGLYNILGTDAVINCPTGEGLPAVIVGLLEVKQRASGGAIFQKFTTAGTGATTRDRIFERAYTGGAWGAWNEVYTSYSLPITLGMGGIKAQLAELDWQTFDFVPGSMFSVPLNKIKNMPANMDWGTIDGNLVMFSVGPSEHTGTGRTVQVWRGTVSQTNYRYFVVRVFGNSGNRTCTVRRVVLEDGRHTWTAQQDFNGAVNFGAPTNFNSTVNLNNTTTFKTEVKFRSLNAFRMYGGKFGTILRNDGESLYILSTDEDDQDGNFNTNRPFRYELRTGDVTLGGASGANVLKLKRDSLTAFFGGDINIKGLMTFDAGRLGSRDYFKFNHWGDSNNARDNIIQLEDSQGAHFSTERTLATGAIKTRFFGETFTDGTLYLNQMNNSSERFSINNWGNSEVGRAAVLEVGDSKGYHFYTERRTDNSLMFDVAGDFTAHGPSGITIKNSTGARHIWFRDSSDAEKAVIWATDEGILHIRNNHGGSFSHHFQGAMIKVGERVPYAGDQGLIRGEVSGGAYVNWRDRPAGLLLDCQQSVDSAHAIWKAVDWGRNFIAALDVHCPGDSNNTAAAILHVQAADYQFHANGSFDASGNGNFNDVYIRSDRRLKDNIEDYTGNALSLIGKLKVKTYDKVKSLKDREIIGHEIGIIAQDLQEILPEAINISKIGNLDKPDEVLTISNSAVNALLIKAIQEMSEEIKELKTPFFTKIARKISKYFKF
Physico‐chemical
properties
protein length:1030 AA
molecular weight: 113245,12020 Da
isoelectric point:6,22384
aromaticity:0,10194
hydropathy:-0,37806

Domains

Domains [InterPro]
cd19958
117–203
cd19958 cd19958 cd19958 IPR048390 IPR030392
IPR030392
914–971
IPR030392
XQQ51542.1
1 1030
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Shigella phage vB_Shso_BCPShso_001
[NCBI] 		3411941 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XQQ51542.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV295201 [NCBI]
CDS location
range 95377 -> 98469
strand +
CDS
ATGGCTACTTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAAGCAAAACCGCAGGTCAACGTCCTGCTGCTTCAGTATTAGCCGAAGGTGAATTGGCTATAAACTTAAAAGATAAAACAATTTTCACAAAAGATGACTCAGGTAGTGTTATAGAATTAGGTTTAAAATATGGAGGAACTATAAATGGGTCTTTAGAGGTTACAGAAAATATAACTGGAACTTTAATTGGAAATTCTAGCACAGCTACTAAATTGCAAACACCTAGGAAAATTAATGGTATATCTTTTGATGGGTCAAAAGATATCACGCTAACTCCATCTGACATAAATGTCAATAGCACAACATTTATAAAAAATAATGGCGAATTACCTACTGATGCTAATTTAGATACGTATGGGCCCATTGAAGAATATCTTGGTGTTTGGTCGAAATCTACTTCAACAAATGCGCAACCAGCAAATAAATTCCCAGAAGAAAATGCCGTAGGTGTACTAGAAGTATTTGTGGCCGGCCAATTTGCTGGCACTCAGCGTTATACTGTAAGATCTGGTAACGTCTATATTCGTTCCTTATCTGCTAAATGGAATGGCGTCGATGGTCCATGGGGTGTGTGGCGTAATGTTCAAGCGTCAACTCGTCCACTTTCACAAACGATTGACCTTGATAGCTTGGGAGAATTAGAACATTGTGGCTTATGGAGAAACAGTTCAAGCGCAATCGCATCATTTGATCGCCATTATCCAGAAGAAGGATCAGCCGCACAAGGATTTTTAGAAATATTTGAAGGTGGTTTATACGCAAGAACGCAGCGTTATACTACCCGCATGGGTATGGTTTATACTCGTTGTCTCGCTGCTGCATGGGATGCTAGTGCACCTAAGTGGGAGGAATGGAAGCAGGTTGGTCATGGCACACCAGCGACTTTCTATGATGGAGATCTGAATGATTTTAAAACTCCTGGGTTATATAACATTTTAGGCACTGATGCCGTTATTAACTGTCCTACTGGTGAAGGTTTACCAGCCGTTATTGTTGGTTTGCTGGAAGTTAAACAGCGTGCTTCTGGTGGTGCTATTTTCCAAAAATTTACTACTGCCGGAACGGGTGCAACTACTCGCGATCGTATTTTTGAGCGTGCATATACTGGTGGTGCGTGGGGTGCATGGAACGAAGTATATACATCTTATTCTCTTCCAATTACTTTGGGTATGGGTGGTATTAAAGCTCAATTAGCGGAGTTAGATTGGCAAACATTTGATTTTGTTCCTGGTAGTATGTTTAGTGTTCCTTTGAACAAAATAAAGAATATGCCAGCAAATATGGATTGGGGGACGATTGACGGAAACTTGGTTATGTTTTCCGTTGGTCCTAGCGAACACACTGGCACAGGGCGTACTGTTCAGGTTTGGCGCGGTACTGTATCCCAGACAAACTACCGTTATTTTGTCGTTCGTGTGTTCGGTAATTCTGGAAATAGAACTTGCACAGTCCGCCGTGTTGTTCTTGAAGATGGTCGCCACACATGGACAGCTCAACAAGATTTTAATGGTGCTGTTAACTTCGGTGCTCCTACCAATTTTAACTCTACTGTTAACCTTAATAACACTACCACATTTAAAACAGAAGTTAAATTCCGCTCATTGAATGCATTCCGTATGTATGGCGGAAAATTTGGTACAATTTTACGTAATGATGGAGAGAGTCTTTATATTCTTTCCACCGACGAAGATGATCAAGATGGAAACTTTAATACAAATAGACCTTTCCGTTATGAATTAAGAACTGGTGATGTTACTTTGGGTGGTGCTAGTGGTGCTAACGTTTTAAAATTAAAACGCGATTCTCTCACCGCATTTTTTGGTGGTGATATTAATATAAAAGGCTTGATGACTTTTGATGCCGGACGTTTAGGATCACGAGATTATTTTAAATTTAACCATTGGGGTGATAGTAATAATGCGCGCGATAACATCATCCAGTTAGAAGATAGTCAAGGCGCCCATTTTTCCACTGAACGTACTTTAGCGACAGGTGCAATTAAAACTCGTTTCTTTGGCGAAACATTCACTGATGGTACATTATACCTAAATCAGATGAATAATAGCTCTGAACGATTCTCTATCAACAATTGGGGAAATTCAGAAGTTGGTCGCGCGGCAGTATTGGAAGTCGGCGATTCAAAAGGTTATCACTTCTATACGGAACGCAGGACAGATAACAGTTTGATGTTTGATGTTGCTGGCGATTTTACTGCGCATGGACCTAGCGGAATAACCATCAAAAACTCAACTGGTGCACGACATATCTGGTTTAGAGATAGCAGCGATGCAGAAAAGGCTGTTATCTGGGCTACAGATGAGGGTATTTTACATATACGAAATAATCATGGGGGTTCATTTAGTCATCACTTCCAGGGTGCAATGATTAAAGTGGGAGAGCGTGTTCCTTATGCCGGAGATCAAGGGCTTATTCGCGGTGAAGTTTCTGGTGGTGCTTATGTGAATTGGAGAGATCGCCCTGCTGGTTTGTTGCTTGACTGTCAACAAAGCGTTGATAGTGCTCATGCTATTTGGAAAGCGGTTGATTGGGGGCGTAACTTCATCGCTGCTCTGGACGTTCATTGTCCCGGTGATAGTAATAATACTGCGGCAGCGATTCTTCATGTTCAGGCTGCTGATTATCAATTCCATGCAAATGGGAGCTTTGATGCCAGTGGCAACGGAAACTTTAACGATGTTTATATTCGATCAGACCGTCGCCTTAAAGACAATATAGAAGATTATACCGGAAATGCGTTAAGTTTGATTGGTAAACTGAAAGTGAAAACTTACGATAAAGTTAAATCTCTTAAGGACCGTGAAATTATCGGTCATGAGATCGGCATTATCGCACAGGATTTACAAGAAATATTACCAGAAGCGATTAATATTTCGAAAATTGGCAATCTTGATAAACCAGACGAAGTTCTGACAATTTCTAACTCCGCTGTGAATGCTCTTTTAATTAAGGCCATTCAGGAAATGAGTGAAGAAATTAAAGAATTAAAAACGCCTTTCTTCACTAAAATTGCTCGCAAAATTAGTAAATATTTTAAATTCTAA

Tertiary structure

PDB ID
b81488d46d4417aab2daf4688465bfd07788f6d8d13ef83a757d304c50e22769
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2324
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome sequence analysis of Shigella phage Tevdoradze,E., Chubinidze,S. and Golijashvili,R. 2023-02 — GenBank