Protein

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Genbank accession
XUL00558.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber protein distal subunit
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,81
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKTAGARPAASVLAEGELAINLKDRVLFTKDDQGNIIDLGFAKGGSIDGNVIHTGNYNQTGDYTLNGVFTQTGNFNLTGIARVTRDIIAAGQIMTEGGELITKSSGTAHVRFFDGNSRERGIIYAPANDGLTTQVLNIRVQDYAAGSESIYAFSGSGLFISPEVSAHKSISSPQILTDKVITNGKKAGDYDIYSLANNTPLAESETAINHLRVMRNAVGSGIFHEVKDNDGITWYAGDGLDAYLWSFTWSGGLKAGHSISVGTPGGNKGYSELGTASISLGDNDTGLKWHQDGYFYTVNNGTRTFLYSPESTVSLRKMVMGYSVNGNDLTTPPTENYALATVVTYHDNNAFGDGQTLLGYYQGGNYHHYFRGKGTTNINTHGGLLVTPGNIDVIGGSVNIDGRNNSSTLMFRGNTTGYSSVDNMDIKVWGNTFVDPSGGIRKNIMEISDATSWMSYIQRLTTGEVEMNVNGSFESSGVTAGDRGVHTTGEISSGAVNALRIWNADYGAIFRRSEGSLHIIPTAYGEGKDGDIGPLRPFSMALDTGKVTIPDLQSSYNTFAANGYIKFVGHGAGAGGYDIQYAQAAPIFQEIDDDAVSKYYPIVKQKFLNGKSVWSLGTEIESGTFVLHHIKEDGSQGHTSRFNQDGTVNFPDNVLVGGGEAAIARNGNIFSDIWKTFTSAGDITNIRDAIATRVAKEGDTMTGRLTLKTNSDAVVIDYPADEAGYVKGKKGGADNWYVGNGGADNGLAFWSFQSQGGININPNGEVILAPQGVAMFNINRDRIHMNGSNWIAHKSGAWGDQWGLEAPYFLDFGSVGEDSYYPIIKGRSVISGQGYTTSVDLGIRRTPQAWGQAIIRVGNAEGADGPVGVFEFHSSGRFYSPNMVQTPAIGVGTDNGLGAPSIAIGDDDTGLSHGGDGRINMVANGIHIANWGAGYQSHPGLWDSNGAFWTEAGRAIVSHGHLVQANDSYSTYVRDVYVRSDIRVKKNLVKFENASEKLSKINGYTYMQKRGTDEEGNQKWEPNAGLIAQEVQAILPELVEGDLDGEALLRLNYNGVIGLNTAAINEHTAEIAELKSEIEELKKLVKSLLK
Physico‐chemical
properties
protein length:1101 AA
molecular weight: 118176,58050 Da
isoelectric point:5,41388
aromaticity:0,09355
hydropathy:-0,32289

Domains

Domains [InterPro]
G3DSA:6.20.80.10
724–778
G3DSA:6.20.80.10 IPR030392
IPR030392
991–1050
IPR030392 Coil
XUL00558.1
1 1101
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage LF82-2
[NCBI] 		3424139 Viruses >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XUL00558.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV648360 [NCBI]
CDS location
range 59208 -> 62513
strand +
CDS
ATGGCTACTTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAAGCAAAACTGCAGGAGCACGTCCTGCCGCTTCAGTATTAGCCGAAGGTGAATTGGCTATAAACTTAAAAGACCGTGTACTTTTTACTAAAGATGACCAAGGAAATATTATTGATCTAGGTTTTGCTAAAGGTGGTAGTATTGACGGGAATGTTATTCATACTGGCAATTACAACCAAACTGGTGATTATACTTTAAATGGCGTCTTCACACAGACGGGTAATTTTAATTTAACTGGTATTGCTCGAGTAACTCGCGATATTATTGCCGCCGGGCAGATTATGACTGAAGGCGGAGAACTTATTACAAAAAGTTCAGGTACAGCACATGTTCGTTTTTTCGATGGCAATAGTCGCGAACGTGGAATCATTTATGCCCCGGCTAATGATGGTTTAACTACACAAGTACTTAATATCAGGGTTCAAGACTACGCTGCTGGTAGCGAAAGCATTTATGCATTTTCAGGCAGTGGCCTATTTATTTCACCTGAAGTATCAGCACATAAATCTATTTCGTCTCCACAAATTCTGACCGACAAAGTTATTACAAACGGGAAGAAGGCAGGAGATTATGATATCTATTCATTAGCAAATAACACTCCATTGGCAGAAAGCGAAACGGCTATTAACCACCTCCGTGTTATGCGAAATGCCGTAGGATCTGGTATATTCCATGAAGTTAAAGATAACGACGGGATAACCTGGTACGCCGGTGACGGGTTAGATGCCTATCTTTGGTCGTTTACCTGGTCCGGTGGATTGAAAGCAGGCCATTCTATTTCTGTTGGTACTCCTGGTGGCAATAAAGGATACTCTGAATTAGGGACTGCTTCAATTTCTCTTGGCGATAATGATACCGGGCTAAAATGGCATCAGGACGGATATTTCTATACAGTAAACAACGGAACAAGAACTTTCCTTTACAGCCCTGAATCAACTGTAAGCCTTAGAAAAATGGTCATGGGTTATTCTGTAAACGGCAACGATTTAACTACGCCGCCAACAGAAAACTATGCTTTGGCTACTGTCGTGACATATCACGATAATAACGCGTTTGGAGATGGCCAGACTCTTTTAGGATATTATCAAGGCGGTAATTATCATCACTATTTCCGCGGTAAAGGTACTACAAACATTAATACTCACGGCGGTTTGTTGGTTACTCCTGGTAATATTGATGTTATTGGCGGTTCTGTTAATATAGATGGTAGAAATAATTCTTCTACACTAATGTTTAGAGGCAACACAACAGGATACAGCTCGGTTGATAATATGGATATTAAAGTTTGGGGTAATACGTTTGTTGATCCAAGCGGAGGTATCCGTAAAAACATTATGGAAATTTCTGATGCAACTAGCTGGATGAGCTATATTCAAAGACTTACTACTGGCGAAGTAGAAATGAACGTTAATGGTTCATTTGAATCATCTGGTGTTACTGCTGGAGATAGAGGAGTTCACACAACAGGTGAAATTTCATCTGGAGCAGTGAATGCTCTTCGTATTTGGAACGCAGATTATGGAGCCATTTTTAGACGTTCAGAAGGAAGTCTTCATATTATTCCAACTGCTTATGGCGAAGGCAAAGATGGCGATATTGGTCCACTTCGCCCATTTAGTATGGCTTTAGATACTGGTAAAGTTACTATTCCAGATTTACAATCAAGTTACAATACGTTCGCTGCTAACGGTTATATTAAATTTGTTGGTCATGGAGCGGGTGCCGGCGGTTATGACATTCAATATGCTCAAGCGGCTCCTATTTTCCAGGAAATTGATGATGATGCTGTAAGCAAATATTATCCTATTGTTAAACAGAAGTTTTTAAACGGTAAATCTGTTTGGTCTTTAGGTACCGAAATTGAATCAGGTACATTTGTTTTACACCATATCAAAGAAGATGGATCACAAGGCCATACGTCTCGTTTTAATCAAGACGGTACCGTTAACTTCCCGGATAACGTTCTGGTCGGCGGGGGCGAAGCTGCTATTGCTCGTAATGGTAATATTTTCTCGGATATTTGGAAAACGTTTACTTCAGCAGGAGACATTACAAATATTCGCGATGCAATAGCTACTCGTGTTGCTAAAGAAGGCGATACGATGACAGGTCGTTTAACTCTTAAAACCAACTCAGATGCTGTTGTTATTGATTATCCGGCAGATGAAGCGGGTTATGTTAAGGGTAAAAAAGGTGGTGCTGATAACTGGTATGTCGGTAACGGTGGTGCTGATAATGGTTTAGCCTTCTGGAGCTTCCAATCCCAAGGCGGTATTAATATTAACCCTAATGGCGAGGTTATTTTAGCCCCACAAGGTGTTGCAATGTTCAATATAAACCGCGACCGTATTCATATGAATGGTTCCAACTGGATTGCACATAAATCTGGTGCATGGGGCGACCAATGGGGCTTAGAAGCACCTTATTTCCTTGATTTTGGTAGCGTTGGCGAAGACAGTTATTATCCTATCATTAAAGGCAGGTCTGTAATTAGTGGTCAAGGATATACTACTTCTGTTGACCTTGGTATTAGACGTACACCTCAAGCATGGGGACAAGCGATAATTCGAGTTGGTAATGCCGAAGGCGCTGACGGTCCTGTGGGTGTTTTTGAATTCCATTCGTCTGGACGATTCTATAGCCCTAATATGGTTCAAACTCCTGCAATCGGTGTTGGTACTGATAATGGACTTGGTGCTCCTAGTATTGCAATCGGCGATGATGACACTGGCCTATCACATGGCGGTGATGGCCGAATCAATATGGTTGCCAATGGTATACATATCGCAAACTGGGGTGCAGGCTATCAATCTCATCCTGGCCTTTGGGATTCAAATGGAGCCTTTTGGACAGAAGCTGGCAGAGCAATTGTTTCTCATGGTCATTTAGTTCAGGCGAATGACAGCTATTCAACGTATGTCCGTGATGTTTATGTCCGCTCTGATATTCGTGTTAAAAAGAACCTCGTTAAATTTGAAAATGCTTCTGAGAAGCTTTCTAAAATTAACGGTTACACTTATATGCAGAAACGTGGAACAGATGAAGAAGGTAATCAGAAATGGGAACCTAACGCTGGTTTGATAGCTCAAGAAGTTCAAGCTATTTTACCAGAATTAGTTGAAGGCGACCTAGATGGTGAAGCTTTACTTCGTTTGAACTATAACGGTGTAATTGGTTTAAATACAGCTGCAATCAATGAGCATACTGCAGAAATTGCAGAACTTAAGTCAGAGATTGAAGAGCTTAAAAAATTAGTTAAATCATTGTTAAAATAA

Tertiary structure

PDB ID
22c4f00146b457edb123e45fd7ea5030db3bb20b89374bac314c82593d01c827
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2513
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Isolation of Novel Phages Infecting Escherichia coli LF82 Steczynska,J.P. and Williams,K.P. 2025-10-09 — GenBank