Protein

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Genbank accession
XAN63925.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber protein distal subunit
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,83
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKTAGARPAASVLAEGELAINLKDRTIFTKDDLGNIIDLGFAKGGQVDGNVTIDGTLRVNGPINNFGNFSTSGTITASNIVSATVFRSTSGSFYTRAINDTANAHLWFENTNGSERGVLYSKPQSENEGVITMRVRQGTAAGAQNSEFHFISTDGGIFQAHKLTALTSISTPTISVNLINHDSKAFGQYDSQSLVNYVYPGTGETNGVNYLRKVRAKSGGTIWHEICTAQTGQADEVSWWTGSTPVSKQCGIRNDGRMIVRNSLALGTMTTDFPSSDYGNGGALGFGAYLALGDNGTGLRYQKTGVYDLVGSGSSVASVTPDSFRSTLKGIFGRSEDQGTTWIMPGTNAAFLSVQTQADENTAGDGQTHIGYNSGGKMNHYFRGKGKTNINTQEGMEVNPGILKLVTGANNVMFYADGGITSVKQLSIYNGIYLAANNSTAGLTFAPTTTVDGTKQILWEGGKRAGQNKNPVTVKVWGDSFDASGDRNRETVFEVADEQGYYFYAQRTNPASGQTVGPVNFKFNGTVETGHIIGLGNISASGTVSSSRFEALGDIAFKNANNRHIRFEYVNSGGATAVDGYIFKDGPSATNRRPGIRINCAAPNSSTSSGDFVFNEDGNLTVPVQVQPGNFGNFDSRYPKLFQLGANVNLDTLTGDNQLGEWAQHANANTSLALNYPEAQAGHLTVTAGAGVQQTYRVYNSSRVYLRSKYSTSAWTPWDRVVTEYYLKSGIPSQFVSKNSDGFRIAYGDYGFFIRNDGSNTYFMLTNSGDQMGPWNGLRPLAINNSNGNVTMSHSLTVGGSSSFSSALTVGNGLTVNGASGINVTSTAGDAISWGDAGARLANDGNLKGTRWASFGGALWLGDALDWVHGQNVSKSGDTMTGTLTLNNGQLVLNGGSGNIGFTKAGANPRSMRIFHAGDGTRGNRIEIADETNYIAYFQKLPGGQNQVSFNSATLSGLTQCNQFGVNTTNALGGNSITFGDNDTGIKQNGDGLLDIYANGVQTFRFQNGDLYSYKNINAPNVYIRSDIRLKSNFKPIENALDKVEKLNGIIYDKAEYIGGEAIETEAGIVAQTLQDVLPEAVRETEDSKGNKILTVSSQAQIALLVEAVKTLSSRVKELESKLM
Physico‐chemical
properties
protein length:1135 AA
molecular weight: 121130,48390 Da
isoelectric point:6,57169
aromaticity:0,09163
hydropathy:-0,35392

Domains

Domains [InterPro]
cd19958
654–732
cd19958 IPR048390 IPR030392
IPR030392
1037–1094
IPR030392 Coil
XAN63925.1
1 1135
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Salmonella phage F13076
[NCBI] 		3143138 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XAN63925.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PP738980 [NCBI]
CDS location
range 120716 -> 124123
strand -
CDS
ATGGCTACTTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAAGCAAAACCGCAGGTGCACGTCCTGCTGCTTCAGTATTAGCCGAAGGTGAATTGGCTATAAACTTAAAAGATAGAACAATTTTTACTAAAGATGATTTAGGAAATATCATTGATCTGGGTTTTGCTAAAGGCGGGCAAGTTGATGGAAATGTAACTATTGATGGAACTTTACGCGTCAATGGACCAATAAACAACTTTGGAAATTTTTCTACAAGTGGCACTATCACGGCAAGTAATATTGTTTCTGCTACAGTATTCAGATCAACATCCGGTTCATTTTATACAAGAGCAATAAATGATACAGCAAATGCCCATCTTTGGTTTGAAAATACGAATGGGTCGGAAAGAGGGGTTTTATACTCAAAACCACAGTCTGAAAATGAAGGCGTAATTACAATGCGTGTTCGCCAAGGAACCGCAGCGGGGGCTCAAAATTCAGAATTTCATTTCATTTCTACTGATGGTGGTATCTTCCAGGCACACAAATTAACTGCTTTAACTTCTATTAGTACACCAACTATTAGTGTTAATTTAATTAATCATGATTCTAAAGCCTTTGGACAATATGATTCTCAATCTTTAGTCAACTATGTTTATCCTGGAACCGGTGAAACTAACGGAGTAAACTATCTTCGTAAAGTGCGTGCTAAATCTGGCGGCACTATATGGCATGAAATCTGTACGGCCCAAACAGGTCAGGCTGATGAGGTTTCTTGGTGGACTGGTAGTACTCCAGTATCTAAACAATGCGGTATTCGTAATGACGGGCGAATGATTGTTCGTAATAGTCTTGCACTTGGCACAATGACTACTGATTTTCCGTCAAGTGATTATGGTAATGGAGGTGCTTTAGGATTTGGCGCTTATTTAGCTCTAGGTGATAACGGCACAGGTTTACGTTATCAAAAAACCGGTGTTTATGATTTAGTCGGTTCTGGATCATCTGTTGCATCTGTTACTCCAGATAGTTTCCGTAGTACTCTTAAAGGTATATTTGGTCGTTCAGAAGACCAAGGCACCACATGGATTATGCCTGGCACTAATGCCGCTTTCTTGTCTGTTCAAACACAAGCTGATGAAAACACTGCTGGAGACGGCCAGACACATATTGGCTATAACTCAGGCGGTAAAATGAACCACTATTTCCGTGGTAAAGGCAAAACTAATATTAATACTCAAGAAGGCATGGAAGTTAACCCGGGTATTCTTAAACTAGTAACCGGTGCAAATAATGTAATGTTTTATGCTGATGGCGGTATTACATCTGTTAAGCAGCTTTCAATATATAACGGCATATATTTAGCAGCTAATAATTCTACTGCTGGGCTAACATTCGCTCCAACTACTACAGTTGATGGCACTAAGCAAATTTTGTGGGAAGGTGGTAAGCGCGCTGGTCAAAACAAAAACCCTGTTACAGTTAAAGTGTGGGGTGATTCATTTGACGCATCCGGTGATCGTAATCGTGAAACCGTTTTTGAAGTAGCTGATGAGCAAGGTTATTATTTCTACGCTCAACGTACTAATCCTGCATCAGGTCAAACAGTAGGTCCGGTTAACTTTAAATTTAACGGAACTGTCGAAACAGGCCATATCATAGGCCTTGGTAATATAAGTGCCTCCGGCACAGTATCATCTTCAAGATTTGAGGCTCTTGGCGATATAGCATTTAAAAATGCTAACAACCGCCATATTCGTTTCGAATATGTTAATAGTGGCGGAGCAACTGCTGTAGATGGTTATATCTTCAAAGATGGCCCTTCGGCTACAAACCGTCGTCCTGGTATTCGTATTAACTGTGCTGCTCCTAATTCTTCTACTAGTTCTGGTGATTTCGTCTTTAATGAAGACGGGAACCTTACGGTTCCCGTTCAAGTACAACCAGGTAATTTCGGCAACTTTGATTCACGTTATCCGAAGTTGTTCCAATTAGGCGCAAATGTAAACCTTGATACTTTAACAGGTGATAATCAGCTTGGCGAATGGGCCCAGCATGCAAATGCAAATACATCGTTAGCTTTGAATTATCCTGAAGCTCAAGCGGGCCATTTAACAGTTACCGCTGGTGCAGGTGTTCAACAAACTTATCGCGTTTATAATTCAAGTCGTGTATACTTACGTTCAAAATATAGCACGAGTGCTTGGACTCCTTGGGACCGGGTTGTAACAGAATATTATTTGAAATCTGGAATTCCTTCTCAATTCGTATCTAAAAACTCTGATGGATTCCGTATTGCATATGGTGACTACGGGTTCTTTATCCGTAATGATGGCAGCAATACTTATTTCATGTTGACCAACTCTGGTGACCAAATGGGCCCATGGAACGGCCTTCGTCCGCTGGCTATTAATAACTCTAATGGCAACGTAACAATGAGTCATTCATTGACCGTTGGTGGTTCTTCATCATTTAGTAGTGCTTTAACAGTAGGTAATGGATTGACTGTTAACGGCGCCTCAGGTATTAACGTTACTAGTACTGCTGGTGATGCTATTTCTTGGGGTGACGCCGGCGCTCGTTTAGCAAATGACGGTAACTTAAAAGGAACACGTTGGGCTTCATTTGGCGGGGCGTTATGGCTTGGTGATGCTTTAGATTGGGTTCACGGTCAAAACGTTTCTAAGTCTGGCGACACTATGACAGGTACATTAACCTTAAATAACGGTCAACTTGTACTTAATGGTGGCTCAGGTAATATTGGTTTTACTAAAGCAGGTGCCAACCCGCGCAGTATGCGTATATTCCATGCTGGCGATGGAACTCGTGGTAACCGTATTGAAATTGCCGATGAAACTAACTATATTGCTTATTTTCAAAAATTACCTGGTGGTCAAAACCAAGTTTCATTCAATAGCGCTACACTTTCTGGATTAACACAGTGTAATCAGTTTGGCGTTAATACAACAAACGCACTTGGTGGAAACAGTATAACATTTGGTGATAATGACACTGGTATTAAGCAAAATGGTGATGGATTATTAGACATATATGCGAACGGCGTGCAAACTTTCCGTTTCCAAAACGGCGATTTGTACTCATACAAAAATATAAATGCTCCAAACGTTTATATTCGTTCTGATATTCGTTTAAAATCCAACTTTAAACCTATCGAAAATGCACTTGATAAAGTTGAAAAACTTAACGGTATCATTTACGATAAAGCTGAATACATCGGTGGAGAGGCAATTGAAACTGAAGCGGGTATTGTGGCTCAAACGTTGCAAGACGTTTTACCAGAAGCCGTCCGTGAAACAGAAGATAGCAAGGGTAATAAAATACTCACTGTTTCTTCTCAAGCCCAGATTGCTCTTCTAGTTGAAGCTGTGAAAACACTTTCTTCTCGTGTAAAAGAACTTGAATCTAAACTTATGTAA

Tertiary structure

PDB ID
d5f2009df79fa2f141592fad300b6fa4ed228756303b5a110bb722a089ac0c6d
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2407
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50