Protein

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Genbank accession
YP_009322954.1 [GenBank]
Protein name
tail protein
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,86
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,60
Protein sequence
MANFNKSFNFRGGFQVDETTFIVRGEKVGIGSSVPDTLLDVNGTITAKGLAIDSSADVIIESANVGFLSATTIHVGVASISAGIITSATPTGIVTYYGDARFLQGLPTSQWIDTDVGLGYTSIYAAGNVGVDTTDPRYAFQVGGVPFPTIDGPPLPAQDGVGIENGNVYASGIVSTRGEFIGLGSNITAIDGSNITVGAIGSMAYGPLIVTEEVIADRFTGIASTAISVTPDATLEFDTATANEFNAVNRFVSTTGKLQIGDDSTSSAVGDIDVFKTGSNSSVYSLSNQVSKLFVGAQRQSGQARQFGGLRHGLVGSDPLTQINDLDLVNYDIGNLNFYLHSGSGGPGITTGAFRWIYGQTGFSLAELSKEGVFSLKGNGVSGSIVLEVAGISSFSDAVYINGDLNVPAGNNVDIGADITVSGNFDFSGSTITFPDQVTMEELIISDTLTVGNPLSDFVTITSTQISNGNSIIGNGTINSTSIQGDTINGTSVNATELQYTTSLVGPQFSINSLGDLQASSITSASASLSSIISTDITTGSLSVTSSLSAINANVTTITSDTVNSTNINGTTLDISGTSTLNDISSNSIDTPLANITAVNTNSIAPLSSSSISIPGDIDGAGNGTITDFSELNSNLVNCTTLRVDQIEIAPGLFSSTSVRLTFTSDSVPDGAYVDLTLTPLPSN
Physico‐chemical
properties
protein length:684 AA
molecular weight: 70151,41250 Da
isoelectric point:4,05003
aromaticity:0,06725
hydropathy:0,14678

Tail Spike Domain Segmentation

Segmented into three structural domains: N-terminal, central, and C-terminal.

Domain layout
YP_009322954.1
1 684 aa
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 232 232 0,9462
Central domain 233 673 442 0,1637
C-terminal 674 684 10 0,3163
N-terminal Central domain C-terminal

View these domains on the 3D structure via the Color by → Tail spike option in the Tertiary structure section below.

Taxonomy

Phage
Synechococcus phage S-CAM7 [NCBI] · taxon 1883368
Uroviricota Caudoviricetes Pantevenvirales Mazuvirus Mazuvirus scam7
Host
Synechococcus sp. WH 7803 [NCBI] · taxon 32051
Bacteria Cyanobacteria Oscillatoriophycideae Chroococcales Synechococcus

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession
YP_009322954.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_031927 [NCBI]
CDS location
range 26561 -> 28615
strand +
CDS
ATGGCTAATTTTAATAAGTCCTTCAATTTTAGAGGTGGATTCCAGGTCGATGAAACAACTTTCATCGTCCGTGGAGAGAAGGTGGGCATTGGTTCCAGTGTCCCCGATACTCTCCTAGATGTAAATGGAACCATCACAGCTAAAGGACTGGCTATTGATTCTAGTGCTGATGTTATTATAGAGAGTGCGAATGTAGGCTTCTTAAGTGCTACAACTATTCACGTTGGTGTTGCTTCTATTAGTGCTGGTATTATTACATCAGCAACTCCAACTGGAATCGTCACATACTATGGCGATGCAAGATTTTTACAAGGACTACCAACTTCGCAGTGGATTGATACTGATGTTGGGTTAGGCTACACAAGTATCTACGCAGCTGGTAATGTTGGTGTAGATACAACAGATCCCCGTTATGCCTTCCAGGTTGGTGGTGTTCCTTTCCCCACCATAGATGGACCACCACTACCCGCACAGGATGGCGTAGGTATTGAGAATGGTAATGTATATGCTTCTGGTATTGTATCTACCCGTGGTGAGTTTATTGGTTTAGGTAGTAATATCACTGCTATTGATGGTAGTAATATTACTGTTGGTGCTATTGGTTCTATGGCTTATGGTCCTCTAATTGTAACAGAGGAAGTCATTGCTGATAGGTTCACTGGTATTGCTTCTACAGCTATTAGTGTAACTCCTGATGCTACACTAGAGTTTGATACTGCAACAGCTAATGAGTTTAACGCAGTAAATAGATTCGTATCTACCACAGGTAAGCTACAGATAGGTGATGACTCAACATCTTCCGCTGTAGGTGATATTGATGTATTTAAGACTGGTTCTAATTCATCAGTATATTCACTATCAAATCAAGTATCCAAGCTATTTGTAGGGGCACAAAGACAATCTGGTCAGGCTAGGCAGTTCGGTGGACTACGACACGGATTAGTTGGTAGCGACCCACTCACTCAAATTAATGACCTTGACCTAGTAAACTATGATATTGGTAATCTAAACTTTTATCTACACTCTGGTAGTGGTGGTCCAGGTATTACTACTGGTGCTTTCCGCTGGATATATGGTCAGACTGGCTTCTCTCTAGCAGAACTATCCAAAGAAGGTGTATTTTCACTGAAAGGTAATGGTGTTTCTGGTTCTATTGTATTGGAAGTTGCTGGTATCTCTAGTTTTTCTGACGCAGTATATATTAACGGAGACTTAAACGTTCCCGCAGGGAATAATGTTGATATTGGTGCTGATATAACTGTTAGTGGTAATTTTGACTTTAGTGGTAGTACTATAACCTTCCCAGATCAAGTTACAATGGAAGAATTGATAATAAGTGATACTCTCACAGTTGGTAATCCATTATCAGATTTTGTAACTATTACATCAACGCAAATATCTAATGGAAATAGTATTATTGGTAATGGCACTATCAACTCTACTTCAATTCAGGGTGATACAATTAATGGTACATCTGTAAATGCAACAGAATTACAATATACCACATCTTTAGTTGGTCCTCAATTCTCAATAAATTCTCTGGGTGATCTACAGGCATCTTCAATAACATCTGCATCTGCATCATTATCATCAATTATATCCACAGATATTACTACTGGCAGTCTTTCTGTTACTAGCTCTTTATCTGCAATTAATGCAAATGTAACTACAATTACTTCGGATACGGTTAATTCCACTAATATTAATGGAACAACATTGGATATTTCGGGAACCAGTACATTAAATGATATATCTTCCAATTCTATAGATACCCCTTTAGCAAATATAACTGCGGTTAATACTAATAGTATTGCTCCACTTAGTTCATCATCTATCTCTATACCTGGAGATATTGATGGCGCTGGAAATGGAACTATCACAGATTTTAGTGAATTGAATTCTAATTTAGTTAACTGTACAACACTTAGAGTTGATCAAATTGAGATCGCCCCAGGATTGTTTAGTTCAACTAGCGTTAGATTGACCTTCACTAGTGATTCAGTTCCCGATGGTGCTTATGTTGATCTTACATTGACCCCACTTCCATCTAACTGA

Genome Context

Tertiary structure

YP_009322954.1
ESMFold structure
Source ESMFold
pLDDT 49.1
Oligomeric state monomer
Download structure