Protein

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Genbank accession
XQP09315.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber protein distal subunit
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,83
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKTAGARPAASVLAEGELAINLKDRVLFTKDDQGNIIDLGFAKGGSIDGNVIHIGNYNQTGDYTLNGTFTQTGNFNLTGIARVTRDIIAAGQIMTEGGELITKSSGTAHVRFHDSADRERGIIYAPANDGLTTQVVNIRVKDYAAGDESTYAFSGSGLFTSPEVSAWKSMSTPQILTNRVITNNKSTSDYDIYSMADNVPLSESTTAINHLRVMRNAVGAGVFHEVKDNDGITWYTGDGLDTYLWSFTWSGGLKAGHSISVGTPGGNKGYSELGTASISLGDNDTGFKWHQDGYYFSVNNGTKTFLFSPSETTSLRKFVAGYSTNGTDLTTPPTENYALATVVTYHDNNAYGDGQTLLGYYQGGNYHHYFRGKGTTNINTHGGLLVTPGNIDVIGGSVNIDGRNNASTLLFRGNTTGSSSVDNMTISVWGNTFTNPSVGNRKNVMEISDATSWMSYIQRLTTGEVEMNVNGSFESSGVTAGNRGVHTTGEISSGAVNALRIWNADYGAIFRRSEGSLHIIPTAYGEGKHGDIGPLRPFSMALDTGKVTIPDLQSSYNTFAANGYIKFTGHGAGAGGYDIQYVQAAPIFQEIDDDAVSKYYPIVKQKFLNGKSVWSLGTEINSGTFVIHHLKEDGSQGHTSRFNQDGTVNFPDNVQVGGGEATIARNGNIFSDIWKLFSSAGDITNLHDAIASRVAKEGDTMTGRLTLKTNSDAVVIDYPADEAGYVKGKKGGVNNWYVGNGGADNAISFYSFQTNSGVNINDVGEITLSPQGSATFNFNRDRLYINGAYWIAHQAGDWANQWRQEAPIFVDFGYVGNDSYYPIIKGKSVITNEGYVSGVDFGMRRITNQWAQAIIRVGNQENASDPQAIFEFHHNGNMYVPDMVKAGVRISAGGGDPAWTGACVVIGDNDTGLVHGGDGRINMVANGMHIASWSSAYHLHEGLWDTTGALWTEQGRAIISFGHLIQQSDAYSTFVRDVYVRSDIRVKKDLVKFENASEKLSKINGYTYMQKRGLDEEGNQKWEPNAGLIAQEVQAILPELVEGDPDGEALLRLNYNGIIGLNTAAINEHTAEIAELKSEIEELKALVKSLLK
Physico‐chemical
properties
protein length:1103 AA
molecular weight: 119243,53810 Da
isoelectric point:5,46839
aromaticity:0,09791
hydropathy:-0,34397

Domains

Domains [InterPro]
IPR048390
450–549
IPR048390 G3DSA:6.20.80.10 IPR030392
IPR030392
993–1052
IPR030392 Coil
XQP09315.1
1 1103
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage GEP001
[NCBI] 		3403470 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XQP09315.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV173775 [NCBI]
CDS location
range 72125 -> 75436
strand -
CDS
ATGGCTACTTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAAGCAAAACTGCAGGAGCACGTCCTGCCGCTTCAGTATTAGCCGAAGGTGAATTGGCTATAAACTTAAAAGACCGCGTACTTTTTACTAAAGACGACCAAGGAAATATCATTGATCTTGGTTTTGCTAAGGGCGGTAGTATTGACGGGAATGTTATTCATATAGGAAACTATAATCAAACTGGTGATTATACTTTAAATGGCACCTTCACTCAGACAGGTAATTTTAATTTAACTGGTATTGCTCGAGTAACTCGCGATATTATTGCCGCCGGGCAGATTATGACCGAAGGCGGAGAACTTATTACAAAAAGTTCAGGTACAGCACATGTTCGTTTTCATGATTCAGCTGATCGTGAACGTGGAATCATTTATGCACCGGCTAATGATGGATTAACTACGCAAGTAGTTAATATCCGCGTTAAAGACTACGCCGCGGGTGATGAAAGCACCTATGCATTTTCAGGCAGTGGCCTATTTACTTCACCTGAAGTATCAGCATGGAAATCTATGTCAACTCCTCAGATTTTGACAAATAGAGTTATTACTAATAATAAATCTACGAGCGATTATGACATTTATTCTATGGCAGACAACGTTCCATTGTCTGAAAGCACTACTGCTATTAATCATCTCCGTGTTATGCGCAATGCTGTAGGCGCTGGTGTATTCCATGAAGTTAAAGATAATGATGGAATAACTTGGTATACTGGAGATGGCTTAGACACTTATCTTTGGTCGTTTACCTGGTCCGGTGGATTGAAAGCAGGCCATTCTATTTCTGTTGGTACTCCTGGTGGCAATAAAGGATACTCTGAATTAGGGACTGCTTCAATTTCTCTTGGCGATAATGATACCGGATTTAAATGGCATCAGGATGGATATTATTTCAGCGTCAATAATGGAACGAAAACATTTTTATTTAGCCCTAGCGAAACAACTAGCCTAAGAAAATTTGTAGCTGGATATTCTACTAATGGAACAGATTTAACTACTCCTCCGACTGAAAACTATGCTTTGGCTACTGTTGTTACTTACCATGATAATAACGCATACGGTGACGGTCAGACTCTTTTAGGATATTACCAAGGTGGTAATTATCATCATTATTTCCGCGGTAAGGGTACCACAAACATTAATACTCATGGCGGTTTGTTAGTTACTCCAGGTAATATTGACGTTATTGGTGGTTCTGTTAATATTGATGGTCGTAATAATGCTTCTACGCTGTTGTTTAGAGGTAACACAACTGGTAGCAGTTCAGTTGATAATATGACAATTTCTGTATGGGGTAATACGTTTACTAATCCTAGTGTAGGTAATCGTAAAAATGTCATGGAAATTTCTGATGCAACTAGCTGGATGAGTTATATTCAAAGACTTACTACTGGTGAAGTAGAAATGAACGTCAATGGTTCATTTGAATCATCCGGTGTTACTGCTGGAAATAGAGGAGTTCACACAACAGGCGAAATTTCATCTGGAGCAGTGAATGCGCTTCGCATTTGGAACGCAGATTATGGAGCTATTTTTAGACGTTCAGAAGGCAGTCTTCATATTATTCCAACTGCTTATGGCGAAGGTAAACATGGCGATATCGGTCCACTTCGCCCGTTTAGTATGGCTTTAGATACTGGTAAAGTTACTATTCCAGATTTACAATCAAGTTACAATACGTTCGCAGCAAACGGTTATATTAAATTTACTGGTCATGGAGCGGGTGCCGGCGGTTATGACATTCAATATGTTCAAGCGGCTCCTATTTTCCAGGAAATCGATGATGATGCTGTAAGCAAATATTATCCTATTGTTAAACAGAAGTTTCTAAACGGTAAATCCGTTTGGTCTTTAGGTACTGAAATTAATTCAGGTACATTCGTTATTCATCATCTGAAAGAAGATGGTTCACAAGGCCATACGTCTCGTTTTAATCAGGACGGTACTGTTAACTTCCCAGATAACGTACAGGTTGGTGGTGGTGAAGCTACTATTGCTCGAAATGGTAATATCTTCTCTGATATTTGGAAATTATTTAGCTCTGCTGGTGATATAACCAACCTTCATGATGCTATTGCCTCCCGTGTGGCTAAAGAAGGCGACACGATGACAGGCCGTTTAACTCTTAAAACCAACTCAGACGCTGTTGTTATTGATTATCCAGCAGATGAAGCTGGCTATGTTAAAGGTAAAAAAGGTGGTGTTAATAACTGGTATGTAGGCAATGGCGGCGCTGATAATGCTATATCGTTTTATAGTTTTCAAACTAACAGCGGTGTTAACATTAATGATGTCGGAGAAATTACTTTATCTCCTCAAGGGTCTGCTACTTTTAATTTTAATAGGGACCGTCTTTATATAAATGGAGCATACTGGATTGCGCACCAAGCTGGCGATTGGGCAAACCAATGGCGACAAGAAGCACCGATATTTGTGGATTTTGGCTACGTAGGTAATGATAGCTATTATCCAATTATCAAAGGGAAATCTGTCATTACTAACGAAGGATACGTATCAGGCGTAGATTTTGGTATGCGCCGTATCACTAACCAATGGGCTCAGGCTATTATTCGTGTTGGTAACCAGGAAAATGCTAGCGATCCGCAAGCTATCTTCGAATTCCACCATAATGGAAACATGTACGTTCCTGACATGGTTAAAGCTGGAGTAAGAATATCAGCTGGTGGAGGTGACCCTGCATGGACAGGCGCATGTGTTGTTATTGGTGATAATGACACTGGGTTAGTTCATGGCGGTGACGGTCGTATTAACATGGTTGCAAATGGAATGCATATTGCTTCATGGTCGTCCGCTTACCATCTCCATGAAGGTCTTTGGGATACCACTGGTGCTTTGTGGACTGAACAAGGAAGAGCTATTATTTCTTTTGGTCATTTAATCCAACAAAGCGATGCCTATTCCACATTTGTCCGCGATGTTTATGTCCGTTCTGATATTCGTGTTAAAAAAGACCTTGTTAAATTTGAAAATGCTTCTGAGAAGCTTTCTAAAATTAACGGTTACACTTATATGCAGAAGCGAGGCCTAGATGAAGAAGGCAATCAGAAATGGGAACCTAACGCCGGTTTGATAGCTCAAGAAGTTCAAGCTATTTTACCTGAATTGGTTGAAGGTGACCCTGATGGTGAAGCTTTACTTCGTTTGAACTATAACGGTATAATTGGTTTAAATACAGCTGCAATCAATGAGCATACTGCAGAAATTGCAGAACTTAAATCAGAAATCGAAGAACTTAAAGCATTAGTTAAATCGTTGTTAAAATAA

Tertiary structure

PDB ID
ed1fbc79fe08720e5574c4904d1283446af7268e6afe407a1603116566239b27
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2457
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50