Protein
View in Explore- Genbank accession
- UGO49771.1 [GenBank]
- Protein name
- putative tail fiber protein
- RBP type
-
TSPTFTF
- Protein sequence
-
MIKNMITGSKGGSSKPHTPVEMEDNLISINRIRILLAVSDGEVDPDFSLKDLYFDDVPVMNHDGSLNFQNVKAEFRPGTQTQDYIQGFTDTASEITVARDLTAATPYIISVTNKNLSAIRIKILMPRGFTQEDNGDLTGVRVEYAVDMAIDGAEYNEVLHDVIEGKTMSGYDRSRRIDLPAFNERVLLRVRRLTDSTSARVTDLIKMQSYAEVVDAKFRYPLTGLVYVEFDSELFPNALPNISIKKKWKIINVPSNYDPISRTYSGSWDGTWKKAWSNNPAFVLYDLITNQRYGLDQRELGIALDKWSIYECAQYCDQMVPDGKGGTEPRYLCDVVIQSQVEAYQLVRDICSIFRGMSFWNGESLSIVIDKPRDASYIFTNDNVVNGDFSYTFASEKSMYTQCNVTFDDEQNMYQQDVEGVFETEAALRFGYNSTSITAIGCTRRSEANRRGRWILKTNVKSTTVNFATGLEGMIPTVGDVIVVSDNFWSSALTLNLSGRLMEVNGLQVFTPFKVDARAGDRILVNKPDGKPVGRTIARVSDDGKTLTLNTTFGFDVQPDTIFAIERTDIAQQRYVVTGITKGDGDEEFTYNITAVEYDPNKYDEIDYGVNIDDRPTSIVQPDILPAPQNVKIESYSRVVQGASVETMHVSWDKVEYASLYEMQWRKDNGNWNNTPRTANKETEVEGIYAGNYHVRVRSVAANGSASGWSAIVSAGLTGKVGEPEKPINLTASDNEVFGIRVKWGMPEGSGDTAYIELHQAPNGADGHPIVDEATLLTLIPFPQYEYWHSILPAGHVVWYKARAVDKIGNVSDWTDFVRGMASDDTSIITDHIKVDIENSDGYKWLQENAIKANDKIHSTAESVIENALANDKDVRRMRVENGKRKAEFLQSLKLIADETEARVTQVTQMSAQFDEKLTAQNSELREVIANSTETISQRIDQLTATFESEIDGVKQDIKAQITDVNQAITNEAEARASADRALSTQIGDTQSAVNQKLDSWVNGTSVGAMYGVKLGIRYNGQEYSAGMALSLVADGGGVKSQFLFDAGRFAIINNAQSGAFTLPFVVENNQVFINSLLVKNGSIGNAQIADQINSNNWQSGAAGWMINKNGYAEFNQITVRGTVYANAGSFTGNVYATDGWFRGTVYAEKIEGDVAKAVVLPFNGSVHIPAVNYNRHLVIPYVGIHGYTYSGGTWGGGTVWVDSTYGGRLANVQATAMHGGSSGYVLLPAGNATTLSYGGNLNHANAVPILTVLLFKA
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1258 AA molecular weight: 138866,66740 Da isoelectric point: 4,98185 aromaticity: 0,09380 hydropathy: -0,30668
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Escherichia phage vB_EcoD_Mishu [NCBI] |
2894792 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
UGO49771.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
OK499984
[NCBI]
CDS location
range 16307 -> 20083
strand +
strand +
CDS
ATGATCAAAAATATGATAACTGGCAGTAAGGGCGGTTCTTCAAAGCCTCATACACCTGTTGAAATGGAAGATAACCTAATTTCAATTAACAGGATCAGAATTCTTTTAGCTGTTTCTGATGGTGAAGTTGATCCAGACTTTTCATTGAAAGATTTATATTTTGATGACGTTCCGGTTATGAATCATGATGGTTCACTAAACTTTCAGAATGTTAAGGCAGAATTCAGACCAGGGACGCAAACGCAGGATTATATTCAGGGGTTTACTGATACAGCCAGCGAAATTACAGTTGCTCGCGATCTGACAGCCGCAACGCCTTATATTATTTCCGTGACTAATAAAAACCTTTCCGCGATCCGTATTAAAATTTTAATGCCGCGAGGGTTTACGCAGGAGGATAACGGAGATTTAACAGGCGTTCGCGTTGAATATGCAGTTGATATGGCTATTGATGGCGCTGAATATAACGAGGTTTTGCATGATGTGATCGAAGGTAAAACAATGAGCGGTTACGACAGAAGCCGCAGAATTGATTTACCTGCTTTCAATGAGCGTGTTTTATTGCGCGTTCGTCGCCTGACAGACAGCACGTCAGCGAGAGTTACCGATCTGATTAAAATGCAAAGCTATGCGGAAGTTGTAGACGCTAAATTTCGTTACCCATTGACTGGTTTAGTATATGTTGAGTTTGACAGCGAATTATTCCCTAATGCGTTGCCGAATATCAGCATTAAGAAAAAATGGAAAATCATTAATGTTCCGTCAAATTATGATCCTATTTCCCGCACTTATTCAGGGTCATGGGATGGAACATGGAAAAAGGCATGGAGTAATAACCCTGCTTTTGTTCTGTATGATTTGATTACCAATCAGCGTTACGGACTCGATCAAAGAGAATTAGGCATCGCGCTTGATAAATGGAGCATTTACGAATGTGCGCAGTATTGCGATCAGATGGTTCCAGACGGTAAAGGCGGAACAGAGCCGCGCTATCTTTGCGACGTTGTGATCCAGAGCCAGGTAGAAGCGTATCAGCTTGTGCGTGATATTTGTTCAATCTTCCGTGGAATGAGCTTTTGGAATGGTGAGAGCCTTTCAATCGTGATCGATAAGCCTCGCGATGCGTCATACATCTTTACTAATGACAACGTGGTTAACGGCGATTTCAGCTACACGTTTGCCAGCGAGAAAAGCATGTACACGCAATGCAACGTGACTTTCGACGACGAACAAAACATGTATCAACAGGACGTTGAGGGTGTTTTTGAAACAGAGGCAGCGTTACGTTTTGGATATAACAGTACGTCAATAACTGCTATCGGTTGCACACGACGCAGCGAAGCCAACCGCCGTGGACGCTGGATTTTAAAAACCAACGTCAAGAGCACAACAGTAAACTTTGCTACTGGCCTGGAAGGTATGATCCCAACGGTAGGCGATGTAATTGTTGTTTCGGATAACTTCTGGTCAAGCGCTTTGACGCTGAATCTATCAGGTCGATTGATGGAGGTTAACGGGTTGCAGGTGTTCACGCCGTTTAAGGTTGACGCAAGAGCAGGTGATCGCATTCTGGTAAATAAGCCGGATGGTAAGCCAGTTGGTCGAACCATTGCGCGTGTGAGTGATGACGGTAAAACGCTAACGCTAAACACGACATTTGGCTTTGACGTTCAGCCGGATACCATTTTTGCAATTGAGCGAACAGATATTGCACAGCAACGATATGTTGTAACCGGAATCACTAAGGGTGACGGTGATGAAGAATTTACCTACAACATAACGGCTGTTGAATACGATCCTAACAAATACGATGAAATTGATTATGGCGTAAACATTGATGACCGTCCGACTTCAATCGTGCAGCCTGACATTTTGCCAGCACCGCAAAACGTCAAGATCGAATCTTATTCGCGAGTTGTTCAGGGTGCGAGCGTGGAAACAATGCACGTTTCATGGGATAAGGTTGAATATGCAAGCCTTTATGAAATGCAGTGGAGAAAAGACAATGGCAACTGGAACAACACGCCGCGCACAGCCAACAAGGAAACGGAAGTTGAAGGTATTTACGCAGGAAACTATCACGTAAGGGTTAGATCTGTTGCAGCTAATGGTTCAGCGTCTGGATGGTCAGCAATTGTTAGCGCCGGATTAACTGGCAAAGTTGGCGAGCCAGAAAAGCCGATTAACCTTACAGCGTCTGACAATGAGGTTTTCGGCATTCGCGTAAAATGGGGTATGCCGGAGGGTTCTGGTGATACAGCTTACATAGAGTTGCATCAAGCGCCGAACGGTGCTGATGGTCATCCTATTGTTGATGAAGCAACGCTCTTAACGCTGATACCGTTCCCGCAATATGAGTATTGGCATTCAATACTGCCAGCGGGTCATGTTGTCTGGTACAAGGCAAGGGCAGTTGACAAAATCGGGAATGTGTCTGATTGGACTGACTTTGTGCGCGGCATGGCTTCCGACGATACGAGCATTATCACGGATCATATTAAGGTCGATATTGAAAATTCTGATGGATATAAGTGGTTACAGGAAAACGCAATAAAGGCCAATGATAAGATCCACAGCACAGCGGAATCAGTGATTGAAAACGCATTAGCGAATGATAAAGATGTGCGACGTATGCGAGTTGAAAACGGCAAGCGTAAAGCGGAGTTCTTGCAATCGCTGAAACTCATTGCAGACGAAACAGAAGCAAGGGTAACGCAGGTCACTCAAATGAGTGCGCAATTTGACGAGAAATTAACGGCTCAAAATAGCGAATTGAGAGAGGTAATTGCTAACAGCACTGAAACCATTAGCCAAAGGATTGATCAGCTTACAGCTACGTTTGAGAGCGAAATTGATGGTGTTAAGCAGGATATCAAAGCACAGATAACTGATGTTAACCAGGCAATCACCAATGAAGCGGAAGCGCGAGCGTCAGCGGATAGGGCGTTATCAACTCAAATTGGTGATACCCAATCAGCGGTTAACCAGAAACTTGATTCATGGGTTAACGGTACAAGCGTTGGTGCGATGTACGGCGTTAAGTTGGGGATCAGGTATAACGGGCAGGAATATAGCGCAGGCATGGCGCTTTCTCTTGTCGCTGATGGTGGAGGAGTTAAATCACAATTCCTGTTTGATGCTGGACGATTCGCGATCATCAACAATGCTCAAAGCGGAGCCTTTACATTGCCGTTTGTAGTTGAGAATAACCAGGTGTTTATCAATAGCTTGCTTGTGAAAAACGGCTCTATTGGAAATGCTCAGATTGCGGATCAGATTAACTCTAACAACTGGCAGAGCGGCGCGGCTGGATGGATGATTAATAAGAATGGTTATGCTGAATTTAACCAGATAACGGTAAGGGGTACGGTGTACGCAAACGCCGGATCATTCACTGGTAACGTTTACGCTACAGATGGTTGGTTTAGGGGTACTGTTTACGCTGAAAAAATTGAGGGTGACGTTGCAAAGGCTGTTGTTCTTCCGTTTAACGGATCGGTTCACATTCCGGCGGTTAACTACAACAGACATCTTGTGATCCCTTATGTTGGTATTCATGGGTACACATATTCAGGTGGTACATGGGGCGGCGGTACTGTTTGGGTTGATTCAACATATGGCGGTCGCCTTGCTAACGTTCAGGCAACTGCAATGCATGGCGGATCAAGTGGTTATGTTCTGTTGCCAGCAGGTAACGCAACTACGCTTTCATATGGTGGAAATCTAAACCACGCAAACGCAGTACCGATCTTAACAGTTCTGCTATTCAAAGCATAA
Tertiary structure
PDB ID
d5ff74dcd09d1e8badc8d69649e38113eb9d92ddf592ccc750da8393bcd4e60f
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50