Protein
- Genbank accession
- AFL47769.1 [GenBank]
- Protein name
- fibritin neck whiskers protein
- RBP type
-
TF
- Seq2Symm
-
C3 confidence 0,685
Predicted homo-oligomer symmetry (Seq2Symm, per-class probabilities; C1 = monomer, C2 = dimer, C3 = trimer).C3 0,685 C1 0,035 C2 0,018 - Protein sequence
-
MTTKVDFLPYVDGIPTDGQHRLSWIRNGDLLNGSDTKYGNEGNLNAFGVELQKNIVFLAENIDVLESNANITQEELEKIKEILGEVGTGSIVEKVNANTENIELINKTVETLTTSFNESKLILNQAVTDIGIRTELNGPNNIFTDLGFIKSRIGNNENEDISGLPSDGNPASGIILKILDQGKQINKNLSDLEELNTKFNDSDISGLSQNIDKLRLELGQSPEPNTPTVYARLNTLESSDRSVKEHLDEIDNKIGSGNISEKVEINTGIKKSIEDLKQNQDTLLTDLAKTNESLENVATKSNTNETNIGTLNDTVGINNDSPNTLLQRTANLETVQQNQTTTIQDMEVILGTSTTGLQGDVQNLKKALDGDSSASDPVAQAGLKAISSALIDKTNALQETQDRIVAAGAFSSKSFVLLGDATTNVVASDIAKVSLVRALPLMTKGVNGANSISILPDYVSAKSADVILVNIGTYDYLFDRELGTLADAKDGTEADTFYADVYKLFADLTAGTSRVLTCTGFRSKGFKDSVVSYPNNNGVNTSYDKYVLAVTEVADIFGIPVIPTHHELGISAKNIDLFANSDGLTKLGIDRFSILVAQSLR
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 601 AA molecular weight: 64814,44990 Da isoelectric point: 4,54072 aromaticity: 0,04825 hydropathy: -0,28253
Taxonomy
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AFL47769.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
HQ698922
[NCBI]
CDS location
range 94877 -> 96682
strand +
strand +
CDS
ATGACAACTAAAGTAGATTTTTTACCATATGTAGATGGTATTCCAACAGACGGCCAACACCGTCTTAGTTGGATTCGTAATGGCGACCTTTTAAATGGTTCTGATACAAAATATGGCAATGAAGGCAATCTAAATGCCTTCGGTGTTGAATTGCAAAAAAATATCGTTTTCTTAGCGGAAAATATTGATGTTTTAGAATCAAATGCTAATATTACACAAGAAGAACTTGAAAAAATAAAAGAAATTTTAGGTGAAGTTGGTACAGGTTCTATCGTCGAAAAGGTTAATGCAAATACAGAGAACATTGAATTAATTAATAAAACTGTTGAAACATTAACAACATCTTTTAATGAAAGTAAATTAATATTAAATCAAGCTGTAACCGATATTGGTATTAGAACTGAATTAAATGGACCTAATAATATTTTTACAGATTTAGGTTTTATTAAATCTAGAATTGGTAATAATGAAAATGAGGATATTAGCGGATTACCGAGTGATGGCAATCCCGCCTCTGGAATTATCTTAAAAATATTAGATCAAGGAAAACAAATTAATAAAAACTTATCGGATTTAGAAGAATTAAATACAAAGTTTAATGATTCAGATATTAGTGGGTTATCCCAAAATATTGATAAGTTACGGTTAGAACTTGGTCAATCTCCTGAGCCTAATACTCCGACAGTATATGCTAGACTGAATACATTAGAATCATCAGATAGAAGTGTTAAAGAACATTTAGATGAGATTGATAATAAAATCGGTTCTGGTAATATATCTGAAAAAGTTGAAATTAATACTGGTATTAAAAAATCAATTGAAGATTTAAAACAAAACCAAGATACTCTTTTGACAGATTTGGCTAAAACTAATGAAAGTTTAGAAAATGTAGCAACCAAATCTAATACTAATGAAACAAATATTGGCACATTAAATGATACTGTAGGTATTAATAATGATAGCCCAAATACTTTGTTACAGAGAACCGCTAATCTTGAAACTGTGCAACAAAATCAAACCACGACAATTCAAGATATGGAAGTAATTTTGGGTACAAGCACGACTGGTTTACAAGGTGATGTGCAAAATCTGAAAAAAGCTTTAGATGGTGACAGCTCAGCTAGTGATCCTGTTGCACAGGCCGGGCTTAAGGCTATTAGTTCCGCTTTAATTGATAAAACAAACGCTTTACAAGAAACTCAAGATCGTATTGTGGCCGCTGGTGCATTTTCGTCTAAAAGCTTTGTTCTTTTAGGGGATGCAACTACAAATGTGGTCGCCAGTGATATTGCGAAAGTTTCACTTGTGCGAGCTTTACCTCTAATGACAAAGGGCGTAAATGGTGCAAACTCAATTTCAATTTTACCGGATTATGTATCTGCAAAATCTGCTGATGTGATTTTAGTTAATATTGGTACTTATGATTACTTATTTGATCGGGAATTGGGTACATTGGCTGATGCTAAAGATGGAACAGAAGCTGATACTTTCTATGCAGATGTATATAAATTATTCGCAGATTTAACAGCTGGCACTTCCCGTGTTTTAACCTGTACTGGATTTAGATCAAAGGGGTTTAAAGATTCAGTTGTTTCTTATCCAAATAATAATGGTGTAAATACTTCATATGATAAGTATGTTTTAGCCGTAACAGAAGTTGCCGATATTTTTGGCATTCCAGTTATTCCAACACACCATGAATTAGGTATTAGCGCTAAAAATATTGATTTATTCGCAAATTCCGATGGCTTAACAAAATTGGGGATTGATAGATTCTCTATTTTAGTGGCCCAATCATTACGATAA
Genome Context
Tertiary structure
AFL47769.1
ESMFold2 structure
Source
ESMFold2
pLDDT
64.3
Oligomeric state
monomer