Genbank accession
AFL47769.1 [GenBank]
Protein name
fibritin neck whiskers protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,48
Seq2Symm
C3 confidence 0,685
C3 0,685
C1 0,035
C2 0,018
Predicted homo-oligomer symmetry (Seq2Symm, per-class probabilities; C1 = monomer, C2 = dimer, C3 = trimer).
Protein sequence
MTTKVDFLPYVDGIPTDGQHRLSWIRNGDLLNGSDTKYGNEGNLNAFGVELQKNIVFLAENIDVLESNANITQEELEKIKEILGEVGTGSIVEKVNANTENIELINKTVETLTTSFNESKLILNQAVTDIGIRTELNGPNNIFTDLGFIKSRIGNNENEDISGLPSDGNPASGIILKILDQGKQINKNLSDLEELNTKFNDSDISGLSQNIDKLRLELGQSPEPNTPTVYARLNTLESSDRSVKEHLDEIDNKIGSGNISEKVEINTGIKKSIEDLKQNQDTLLTDLAKTNESLENVATKSNTNETNIGTLNDTVGINNDSPNTLLQRTANLETVQQNQTTTIQDMEVILGTSTTGLQGDVQNLKKALDGDSSASDPVAQAGLKAISSALIDKTNALQETQDRIVAAGAFSSKSFVLLGDATTNVVASDIAKVSLVRALPLMTKGVNGANSISILPDYVSAKSADVILVNIGTYDYLFDRELGTLADAKDGTEADTFYADVYKLFADLTAGTSRVLTCTGFRSKGFKDSVVSYPNNNGVNTSYDKYVLAVTEVADIFGIPVIPTHHELGISAKNIDLFANSDGLTKLGIDRFSILVAQSLR
Physico‐chemical
properties
protein length:601 AA
molecular weight: 64814,44990 Da
isoelectric point:4,54072
aromaticity:0,04825
hydropathy:-0,28253

Taxonomy

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession
AFL47769.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
HQ698922 [NCBI]
CDS location
range 94877 -> 96682
strand +
CDS
ATGACAACTAAAGTAGATTTTTTACCATATGTAGATGGTATTCCAACAGACGGCCAACACCGTCTTAGTTGGATTCGTAATGGCGACCTTTTAAATGGTTCTGATACAAAATATGGCAATGAAGGCAATCTAAATGCCTTCGGTGTTGAATTGCAAAAAAATATCGTTTTCTTAGCGGAAAATATTGATGTTTTAGAATCAAATGCTAATATTACACAAGAAGAACTTGAAAAAATAAAAGAAATTTTAGGTGAAGTTGGTACAGGTTCTATCGTCGAAAAGGTTAATGCAAATACAGAGAACATTGAATTAATTAATAAAACTGTTGAAACATTAACAACATCTTTTAATGAAAGTAAATTAATATTAAATCAAGCTGTAACCGATATTGGTATTAGAACTGAATTAAATGGACCTAATAATATTTTTACAGATTTAGGTTTTATTAAATCTAGAATTGGTAATAATGAAAATGAGGATATTAGCGGATTACCGAGTGATGGCAATCCCGCCTCTGGAATTATCTTAAAAATATTAGATCAAGGAAAACAAATTAATAAAAACTTATCGGATTTAGAAGAATTAAATACAAAGTTTAATGATTCAGATATTAGTGGGTTATCCCAAAATATTGATAAGTTACGGTTAGAACTTGGTCAATCTCCTGAGCCTAATACTCCGACAGTATATGCTAGACTGAATACATTAGAATCATCAGATAGAAGTGTTAAAGAACATTTAGATGAGATTGATAATAAAATCGGTTCTGGTAATATATCTGAAAAAGTTGAAATTAATACTGGTATTAAAAAATCAATTGAAGATTTAAAACAAAACCAAGATACTCTTTTGACAGATTTGGCTAAAACTAATGAAAGTTTAGAAAATGTAGCAACCAAATCTAATACTAATGAAACAAATATTGGCACATTAAATGATACTGTAGGTATTAATAATGATAGCCCAAATACTTTGTTACAGAGAACCGCTAATCTTGAAACTGTGCAACAAAATCAAACCACGACAATTCAAGATATGGAAGTAATTTTGGGTACAAGCACGACTGGTTTACAAGGTGATGTGCAAAATCTGAAAAAAGCTTTAGATGGTGACAGCTCAGCTAGTGATCCTGTTGCACAGGCCGGGCTTAAGGCTATTAGTTCCGCTTTAATTGATAAAACAAACGCTTTACAAGAAACTCAAGATCGTATTGTGGCCGCTGGTGCATTTTCGTCTAAAAGCTTTGTTCTTTTAGGGGATGCAACTACAAATGTGGTCGCCAGTGATATTGCGAAAGTTTCACTTGTGCGAGCTTTACCTCTAATGACAAAGGGCGTAAATGGTGCAAACTCAATTTCAATTTTACCGGATTATGTATCTGCAAAATCTGCTGATGTGATTTTAGTTAATATTGGTACTTATGATTACTTATTTGATCGGGAATTGGGTACATTGGCTGATGCTAAAGATGGAACAGAAGCTGATACTTTCTATGCAGATGTATATAAATTATTCGCAGATTTAACAGCTGGCACTTCCCGTGTTTTAACCTGTACTGGATTTAGATCAAAGGGGTTTAAAGATTCAGTTGTTTCTTATCCAAATAATAATGGTGTAAATACTTCATATGATAAGTATGTTTTAGCCGTAACAGAAGTTGCCGATATTTTTGGCATTCCAGTTATTCCAACACACCATGAATTAGGTATTAGCGCTAAAAATATTGATTTATTCGCAAATTCCGATGGCTTAACAAAATTGGGGATTGATAGATTCTCTATTTTAGTGGCCCAATCATTACGATAA

Genome Context

Tertiary structure

AFL47769.1
ESMFold2 structure
Source ESMFold2
pLDDT 64.3
Oligomeric state monomer