Protein
- Genbank accession
- QBX22164.1 [GenBank]
- Protein name
- capsid and scaffold protein
- RBP type
-
TF
- Seq2Symm
-
C3 confidence 0,938
Predicted homo-oligomer symmetry (Seq2Symm, per-class probabilities; C1 = monomer, C2 = dimer, C3 = trimer).C3 0,938 C1 0,438 C2 0,001 - Protein sequence
-
MATSNFNGTYGKLLKLEGLYGVVSQDKVKNQSKIRVWTNLIMGNGGNISGGSGNVTIHLNGGGAINNVTVNIGSNSKILLWYQEYTINHDSQGNAKVDISLTVYSGFSNYGSATVKLSGDLPQIKRASTVSAPTTDLGSNATITITPSDSSYTHTVRYEFNGKTGVIAQNVTTSTNWQVPLSFANDLPNSISGIVTIYVDTYAGNTPLGTNSTSMNVNVPSTLIPTISSFTLTETNATVSKLITDSNYFVQIYSQIKANLGSASGVNKSTISSFKAEIVGKDMSVSSDGGVFGLINFSGTFTVRATVTDSRGRESKPLDKTITILEYKPPQLNYSVLRTGSTSSTLTVTRNAQISPLTVNGAQKNIMTLTFKVSPYNKEAYTTDNGQASGQWSAISSLTNSQANLAGTYVANSSWDIIGVLTDSLGGLVTFKTTVTSEKVVFSYDKNGMGIGKPREFGVLDVAKGGIYHDGKLIQLKQLTDDKGKWLPDIKVVTPDSSPRFKDVSVTSIDATSAVTASKILMTDTKRTTFGFPFGLSAQALRKGNMVTLVISRSGANVGSYEYSLMNETIPLGYRPAIETPFPIVANSGASVQGTAVLHLLNNGQVKLTNNLTSTKIWNGTITYITNDTYPS
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 632 AA molecular weight: 67348,92790 Da isoelectric point: 9,29139 aromaticity: 0,07911 hydropathy: -0,14446
Taxonomy
Phage
Streptococcus phage Javan637
[NCBI]
· taxon 2548292
No lineage information
Host
No host information
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QBX22164.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
MK448824
[NCBI]
CDS location
range 35131 -> 37029
strand +
strand +
CDS
ATGGCAACGAGTAATTTTAACGGCACTTATGGTAAACTTTTAAAACTCGAAGGTCTCTACGGGGTTGTCTCGCAGGATAAAGTTAAAAACCAGTCAAAAATTCGTGTTTGGACCAATCTAATCATGGGTAATGGAGGTAATATTTCAGGAGGATCAGGAAACGTTACTATTCATCTTAATGGTGGTGGGGCTATCAATAATGTAACTGTTAACATAGGCAGTAATTCAAAAATTTTACTTTGGTATCAAGAATATACGATTAATCACGATTCACAAGGAAATGCGAAAGTTGATATTTCTTTAACTGTTTATAGTGGTTTCTCAAACTATGGAAGTGCGACTGTTAAATTAAGTGGGGACTTACCTCAAATAAAAAGAGCTTCAACAGTTTCAGCACCGACCACCGATTTAGGAAGCAATGCTACGATTACGATTACCCCGTCAGACAGCTCTTATACTCATACGGTGAGATACGAGTTTAATGGCAAAACAGGAGTAATTGCTCAAAATGTTACGACATCTACAAATTGGCAAGTGCCTCTAAGCTTTGCGAATGACTTGCCTAATTCGATAAGTGGTATTGTTACGATATATGTTGATACATATGCAGGAAATACACCGCTTGGGACTAATTCTACATCTATGAATGTTAATGTCCCGAGTACGTTAATTCCGACCATTAGTAGTTTTACACTTACTGAAACTAATGCAACAGTTTCTAAGTTAATAACAGATTCAAATTATTTTGTACAAATATACTCACAAATTAAAGCCAATCTTGGAAGTGCTAGCGGTGTCAATAAATCAACAATAAGTAGTTTTAAAGCTGAAATAGTTGGTAAGGACATGTCAGTCAGTTCAGACGGTGGCGTATTTGGATTAATTAATTTTTCCGGTACTTTTACAGTTAGGGCGACGGTAACAGATTCAAGAGGTCGTGAGAGTAAGCCACTTGATAAAACGATAACCATTCTTGAATATAAGCCACCTCAATTAAATTATTCGGTTTTAAGAACTGGAAGTACATCAAGCACATTAACTGTTACTAGAAATGCCCAAATATCGCCTTTAACAGTAAACGGCGCACAAAAAAACATAATGACACTTACTTTTAAGGTATCACCCTATAATAAGGAAGCATACACAACAGATAACGGCCAAGCTTCTGGACAATGGTCGGCAATAAGTAGTTTAACCAACTCGCAAGCAAATCTTGCTGGAACTTATGTAGCGAATTCCTCATGGGATATTATAGGAGTGTTGACTGATAGTTTAGGTGGATTAGTAACCTTTAAAACAACAGTAACGTCTGAAAAGGTAGTATTTTCTTATGATAAAAATGGTATGGGAATAGGAAAGCCACGCGAATTTGGTGTCTTAGATGTTGCAAAAGGTGGTATCTATCATGATGGTAAGCTCATTCAGTTAAAACAATTGACAGATGATAAAGGGAAATGGTTGCCTGATATTAAAGTTGTCACTCCAGATTCAAGTCCTCGTTTCAAAGATGTATCTGTCACAAGTATAGATGCAACATCAGCAGTAACTGCATCTAAAATATTAATGACTGATACTAAACGGACCACTTTTGGTTTTCCTTTTGGCTTGTCAGCTCAAGCTTTGCGCAAGGGAAATATGGTTACACTTGTTATTAGTCGTTCAGGTGCAAATGTTGGATCATATGAATATAGTTTAATGAATGAAACCATTCCTTTAGGATATCGACCAGCTATTGAAACCCCTTTTCCTATAGTCGCAAATAGTGGGGCTAGTGTTCAAGGCACAGCAGTTTTACACTTGTTGAATAATGGACAAGTTAAATTAACAAATAACTTAACAAGTACAAAAATTTGGAATGGAACGATCACTTATATCACAAATGATACTTATCCATCTTAG
Genome Context
Tertiary structure
QBX22164.1
ESMFold2 structure
Source
ESMFold2
pLDDT
81.7
Oligomeric state
monomer