Protein

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Genbank accession
YP_004421602.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence UniProt/TrEMBL
Probability 1,00
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,74
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,52
Protein sequence
MIEPKREPTQDFFVCLLKEPRWISTDDLYPILLIPGVNYPAEIAMMHPDFFGGDDIVFKPEPPIDPDGPDLSNYYTKPETNSLLDKKADKIHTHVVADITDLNLDKFATKEETYTKQEIDDKIDEIVPPEINLTDYAKKDAVNIFTKANTFTEAPSVEVDATLDNHVIRKKQFDNNIKEVKDLLSNVFSYKGSKPTYTEIEAIVNKKIGDVWYAEDTGYMYIWNGKTWYDLGKSFDASKFVDITSDQVAINGIKKFTGKLKALTPVDSDDVAILSWTTKQINDKVESVIGDLNSLNNEVSKDNLVNAINSVDDKFKTTAKTNKSNTFTGDQTYVDHILLESVPSERNHAVNLGYILDNPGGIKLPDHTALTQNSVTEITFGYANPVVYSAQQLKNVFLKDIVGNEYKAIMADKTSFTENPSKEMVVILSRTDYTKNIDVKFDITKTVDELKQYELKEGEVRVILSYDTISVYSSGYGYGAMFARNANKKDGDLIYDYYSGSQNDITNNRKVSIKIDKLGINTPDIVSISMTTNGSEKLTVKTDTLDPVENTYESADMTYIHTPVSKIAGDILYSNISQAIKSIHVLENNICSLKPADMELQLVRLKEFKQTINNMLQSMFDESPVTLKNGDYIDVSFSGSASYGTGYCGYVNIKDTIRNITYKAYKVSSNAFDTTSGTKVIAVLTSDNSKTNVTYSDSVSTLESYEVAENEILLEISFSAAKQYSAKYGYGAMLEYWGSVSDLCYDYYMGSNLDMDCPFKITLLKIGSSVKADTIQIGAPTFAGSLVMHLRKNTNDVINFLVSTGMNVTGRDGTESGSVYNLVEKSLKPLKVLTSEAHQSINGITTFNNKVYMNINNEKITDSKQLIHKEYLDKNIADNVAYNISNTPLVPYNDVSSLNTKNICVKISATTDSSNYSSGDTVVVSNFKIKLKGDDEYLKPYGVEVIDRENNKIGLNLIGDDTVYNDNDALLSTRPSDFNSSSVDLSSGSNALVTVKTNGAYDYSGVYDIPNPFREYNKKYSLFLSNDGLKNPYYQVDINSSKQVDNISFQLFGTSATNPFLYSKDCKIELFIENTIVKTFNIKGSSGNNSPVNINIDYKDGMFLISVLDSINYINNRINKNAELLTGSGKPNFSLNPNKVGSLYSDTTNKAVYMCIDNTSGANKWVNIVTGDEIKPNLRKIEITCNVRLRSGQYGGCMSGVKIGFDNGYASTKQIVKGLNSGQILLSLDGLGNLSGYSEVSSLTPSSQDIKVDVDTTGIYNDPSYHCVTNIFKQYLGNADQCSLWSDASVKQLKITLLSKKIPNKILYVGDGYYGQTSVSDVKAIWYYVNDNGDKIEGSIDNDLEISNNDSETNDSSYIYAFNIN
Physico‐chemical
properties
protein length:1365 AA
molecular weight: 151637,13860 Da
isoelectric point:4,90182
aromaticity:0,09524
hydropathy:-0,38110

Tail Spike Domain Segmentation

Segmented into three structural domains: N-terminal, central, and C-terminal.

Domain layout
YP_004421602.1
1 1365 aa
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 376 376 0,9696
Central domain 377 601 226 0,6260
C-terminal 602 1365 763 0,1201
N-terminal Central domain C-terminal

View these domains on the 3D structure via the Color by → Tail spike option in the Tertiary structure section below.

Taxonomy

Phage
Campylobacter phage NCTC12673 [NCBI] · taxon 2885915
Uroviricota Caudoviricetes Connertonviridae Fletchervirus NCTC12673
Host
Campylobacter jejuni [NCBI] · taxon 197
cellular organisms Bacteria Pseudomonadati Campylobacterota Epsilonproteobacteria Campylobacterales

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession
YP_004421602.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_015464.1 [NCBI]
CDS location
range 36870 -> 40967
strand -
CDS
ATGATAGAACCAAAAAGAGAACCTACACAAGATTTTTTTGTATGTTTATTAAAAGAACCTAGATGGATTAGTACTGATGACTTATATCCTATTTTATTAATACCAGGAGTCAATTATCCTGCTGAAATAGCTATGATGCATCCTGATTTTTTTGGTGGGGATGATATTGTATTTAAGCCTGAACCCCCAATTGATCCAGATGGTCCTGATTTATCTAACTATTATACAAAACCAGAAACAAATAGTTTATTAGATAAGAAAGCAGATAAAATTCATACACATGTTGTAGCTGATATAACAGATTTAAATTTGGATAAATTTGCTACAAAAGAAGAAACATATACTAAACAAGAGATAGATGATAAAATAGACGAAATAGTACCACCTGAAATTAATTTAACTGATTATGCAAAGAAAGATGCAGTTAATATTTTTACAAAAGCTAATACTTTTACAGAAGCACCTTCAGTAGAAGTAGATGCAACACTAGATAATCATGTTATTAGAAAGAAACAGTTTGACAATAACATAAAAGAAGTTAAAGATCTACTATCTAATGTATTTTCATATAAAGGATCAAAACCTACATATACAGAAATAGAAGCCATTGTTAATAAAAAGATAGGTGATGTATGGTATGCTGAAGATACTGGATATATGTATATATGGAATGGTAAAACTTGGTATGATTTAGGTAAATCTTTTGATGCTAGTAAATTTGTTGATATAACTTCAGACCAAGTAGCAATAAATGGTATTAAAAAATTCACAGGAAAATTAAAAGCATTAACACCTGTTGATTCTGATGATGTGGCTATTTTGAGCTGGACAACAAAACAAATAAATGACAAAGTTGAATCTGTTATTGGTGATTTAAATTCACTAAATAATGAAGTTTCTAAAGATAATTTAGTTAATGCTATAAATAGTGTAGATGATAAGTTTAAAACAACAGCTAAAACCAATAAATCAAATACATTTACAGGTGATCAAACTTATGTAGATCATATTTTACTAGAATCTGTTCCTTCTGAAAGAAATCATGCAGTTAATTTGGGATACATTTTAGATAATCCTGGAGGTATAAAGCTTCCTGATCATACAGCACTTACACAAAATTCTGTTACAGAAATAACTTTTGGATATGCAAATCCAGTAGTGTACTCTGCACAACAATTAAAAAATGTATTCCTAAAAGATATAGTAGGCAATGAATATAAAGCTATAATGGCAGATAAAACATCATTTACAGAAAATCCTTCAAAGGAAATGGTTGTTATACTTTCTAGAACTGATTATACAAAAAATATAGATGTTAAGTTTGATATAACTAAAACAGTTGATGAGCTTAAACAATATGAGCTTAAAGAAGGAGAAGTTAGAGTTATACTATCTTATGATACTATATCTGTTTATTCTAGTGGATATGGTTATGGAGCCATGTTTGCTAGAAACGCTAATAAAAAAGACGGAGATTTAATATATGATTATTATTCTGGAAGTCAAAATGATATAACAAATAATAGAAAAGTATCTATAAAAATAGATAAACTTGGTATTAATACTCCAGATATTGTAAGTATATCTATGACTACAAATGGTTCTGAAAAATTAACAGTAAAAACAGATACACTAGATCCTGTAGAAAATACATACGAATCTGCGGATATGACTTATATTCATACTCCTGTCAGCAAAATTGCAGGAGATATTCTGTATAGTAATATATCTCAAGCAATTAAATCAATACATGTGTTAGAAAATAATATATGCTCTTTAAAGCCTGCAGATATGGAATTACAACTTGTAAGACTTAAAGAATTTAAACAAACAATAAATAATATGTTGCAATCTATGTTTGATGAGAGCCCTGTAACTCTAAAAAATGGAGATTACATAGATGTTTCATTTAGTGGTAGTGCAAGCTATGGAACAGGATATTGTGGGTATGTTAATATAAAAGATACTATAAGAAATATTACATATAAAGCTTATAAAGTATCTTCAAATGCTTTTGATACAACTAGTGGAACTAAAGTTATTGCAGTTCTAACTTCTGATAACAGTAAAACAAATGTAACTTATTCTGATAGTGTATCAACATTAGAATCTTATGAAGTAGCAGAAAATGAGATATTATTAGAAATATCATTTTCTGCTGCTAAGCAATATTCTGCTAAATACGGGTATGGAGCTATGTTAGAATATTGGGGTTCTGTATCTGATTTATGTTATGATTATTATATGGGTTCAAACCTAGATATGGATTGTCCATTTAAAATAACATTACTCAAAATAGGAAGTTCTGTTAAAGCTGATACTATACAAATAGGTGCTCCTACTTTTGCAGGATCATTAGTTATGCACCTAAGAAAAAATACAAACGATGTTATTAATTTCCTTGTATCTACAGGTATGAATGTAACAGGAAGAGATGGGACTGAAAGTGGATCAGTATATAATTTAGTAGAAAAATCATTGAAACCATTAAAAGTTCTAACATCTGAAGCACATCAATCTATAAATGGGATAACTACTTTTAATAATAAAGTGTATATGAATATAAACAATGAAAAAATTACAGACAGCAAACAACTAATACATAAAGAATACCTAGATAAAAATATTGCAGACAATGTAGCATATAATATTAGTAATACTCCATTAGTACCTTACAATGATGTTAGTTCTTTAAATACAAAAAATATTTGTGTAAAAATATCTGCGACAACTGATAGCTCTAATTATTCATCTGGTGATACAGTAGTAGTTAGTAATTTCAAGATAAAACTTAAAGGAGATGATGAGTACCTTAAACCTTATGGGGTTGAAGTTATTGATAGAGAAAATAATAAAATAGGTTTAAATTTAATAGGAGATGATACAGTATATAATGATAATGATGCTTTATTATCTACAAGACCTTCTGATTTTAATTCATCTAGTGTAGATCTTTCTAGTGGAAGTAACGCCTTAGTAACTGTTAAAACTAATGGAGCTTATGATTATAGTGGAGTTTATGATATACCAAATCCTTTTAGAGAATATAATAAAAAATACTCTTTATTCTTAAGTAATGATGGGTTAAAAAATCCTTATTACCAAGTTGATATAAATAGCTCCAAACAAGTTGATAATATATCTTTTCAATTATTTGGAACTAGTGCTACAAATCCTTTTTTATATTCTAAAGACTGTAAAATTGAATTGTTTATAGAAAATACTATTGTAAAAACCTTCAATATTAAAGGCAGCTCTGGAAATAATAGTCCTGTGAATATTAATATAGATTATAAAGATGGTATGTTTTTAATATCTGTTCTTGATTCTATAAATTACATAAATAATAGAATTAATAAAAATGCAGAATTACTTACAGGGTCAGGCAAACCTAATTTTTCATTAAACCCTAATAAAGTAGGTTCTCTATACTCTGATACAACTAATAAAGCTGTATATATGTGTATAGACAATACTTCTGGTGCTAATAAATGGGTAAATATAGTAACAGGAGATGAAATTAAACCAAACCTTAGAAAAATAGAAATTACTTGTAATGTAAGATTAAGAAGTGGCCAATATGGTGGTTGTATGAGCGGTGTTAAAATAGGATTTGATAACGGATATGCTTCTACAAAACAAATAGTTAAAGGGTTAAATAGTGGTCAAATATTGCTATCTCTAGATGGGTTGGGTAACCTTTCTGGATATTCTGAAGTCAGTTCTTTAACTCCTAGCAGTCAAGATATAAAAGTTGATGTGGATACTACTGGTATATATAATGACCCTTCATATCATTGCGTTACTAATATATTCAAACAATATCTTGGAAATGCTGATCAATGTTCGCTATGGTCTGATGCTAGTGTTAAACAACTTAAAATAACTTTATTATCTAAAAAGATTCCTAATAAAATATTGTATGTAGGAGACGGATATTATGGTCAAACATCTGTTTCTGATGTAAAAGCTATATGGTATTATGTAAATGATAATGGAGACAAAATAGAAGGCAGTATAGATAATGATTTGGAAATAAGCAATAATGACTCTGAAACAAACGATAGTTCTTATATATATGCGTTCAATATAAATTAA

Genome Context

Tertiary structure

YP_004421602.1
ESMFold structure
Source ESMFold
pLDDT 45.6
Oligomeric state monomer
Download structure