Protein

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UniProt accession
U5PXK4 [UniProt]
Protein name
Tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence UniProt/TrEMBL
Probability 1,00
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,86
Protein sequence
MVERLKQTIRHPKMEVLVDFKGLGLNRINEWENITDYVLDISGSKEKATESVGGVTSDIVTFATDNKGNVFSNTNPKSPFYQKVKSNVDFVLKTGFKGEELKIYAAGIITKFAPSWNDKKYNVSAEDYFYLLKNTDAPKTAYQDVSLDELVHILLDAAEIPSQIKRIIPKTEFNFQYFKFEEANCFDALKKLMEISVGQAYFEGLNFVFETKLALDYELDLTVKHTIEEDDIFTFDETIEDSDIVNAVSIISDPKTIFPKELVFQTPENIVQVNEEPITFGDGSSFFIDNTHLPIINNTENPISVKNLTQGRTINILTVDKNTGKITIAPESLAYVAKGDLLVVSYSYQQLVLLPGQSRTYSLSLSGEVHALTDVDVAVWDATGQLPRDYSTTPNKANTVSLNQFNFNQTSGLVTVVLKNNYNEGITISTLQLRGNPIKSANPLEIYVRDLPSINEYKKQEIQIANNYFTNTKLAQKIAQYIVDNRSQPRKKIGVDMDGYTELELNDIAKVIENESGTNHTFYADRIDYSFSADGGWTAKVTFTQTETEQWVYESFKGESWEKTNPGNPIDDFIFDINANMIKNGGAELHTGIADYVDAGAIGSAHYVPDYWRFTRSTGNASARIRTGGELALHADQSFEISASNSGSGYYEQTIEGVVPSKTHSASFIARLDGCTGVFIVEQYANTSLIKTLSYDLPEGLKEYEFQFASEPTATSFIVKFKKKAGTKGSESMIFDKVKVEEADKASLYLEANETQSVQAGQKYDNSVIIGNNYGVSVYDANNSQRVRMGQYAPGKYGMRIDNGALEIVNGLLYEQLANDVGKKLDISANNAITSLAMSMSGLDGDLDTVSGIVNSHTSLIQQNSEQIQLRVLSSTYKTDKDGILKRLSDNETAISQTAHDITLLATKDSLDELGNVVESNTAAINVNATAITQRVTTSTFNQAITDTKAYADSAATSKANTAESNAKAASEKNIHIGNTSPTDTTRKWLDTNTTIPILKYYTGGTWKKLIPTAASDIGAETPSGAQTKATTAETNAKKYMDSVNATIQDQFTAQSSSITQLSNRIDSKVESTTYTQGIADAKTYADGKASTAESNAKGYADTKDTATLNSAKGYADTKDAVIVERVETNSSLISQQADKILSMVTKTEFNSLKIGGQNKVTGTDFKNAVGWTRWNVGTLSFAQADSSMPKNYLKVETKDGSGNNLTVASGQAIGLQHSGRTFRVIAGQTYTASMIVATSELGGMLDYLYVIHKDGQGNKRLTNVDTTNFVTVHPAYSGAPSTYDFRMVYFTFTAARTDDVYLLIGGTTKRDLGSTAYAWIRLYDFKVEDGDKATAWTPSTEDVKQDINTLSTQISQTAEDISLNVVKNNKVLTAINASAEGVKIKADRLDITGLVTFNVLNNDMQSRISNADQAYADTVRWKLPNTTLINGGLIAADTVTASQILVGSWENLYQNGGFEKKDAGWKNASVWSVVSTAPYNGTYHAEGTWGSSGAVSYYDDREIDVRPGEKYYFEGYFRTKTSTTTKARTILVRFKDKTGSYSYNIVEETLSTSWQKFSYVVDIPSDCVSMTIGLSVKGGMPSGNSTYADNLFCKRMTDGSLIVDGTITASMIKSLNGLNIGSGQFTVDGSGNVIIGGGATLRAAKFEGLRGNTISFGDHGAKIDTSIAGTIKRTRFAGNDTNYLAIDDDGTFNFVMNGDFNPKFYIANGGHKGLKLGMGQIIGLTDGEAIHVRNGANSDYGKFAAGDVAVTKELDVWGKAKIGGTDLTINGSTAGMLKLKGSPYAYMEFYANGTQVGFVGLEQASGQNNVMLQNNNGGEVLIKTAATRVKFDRSVGQVVFKDQNDNGYISLIAKDFVPGSLRELKKDITPFEKTSTGRTVLEEICSTTVFNYRYKEENSEIDPLRMGLIYDSAPYEVIDPRGQGINLYGLATMSFQGVKELNIKLEERVSELEMTIDSLSARIAILETK
Physico‐chemical
properties
protein length:1970 AA
molecular weight: 215537,19760 Da
isoelectric point:5,14503
aromaticity:0,09086
hydropathy:-0,34579

Domains

Domains [InterPro]
DC_0107
STR
1–548
DC_0107 G3DSA:2.60.120.260 DC_1955 DC_1035 DC_2025
G3DSA:2.60.120.260
STR
1449–1594
G3DSA:2.60.120.260 Coil
U5PXK4
1 1970
Architecture
STR
STR
STR
RBD
STR
RBD
STR 1-548 | STR 579-749 | STR 1026-1081 | RBD 1224-1448 | STR 1449-1594 | RBD 1595-1970
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Bacillus phage Staley
[NCBI] 		1406792 Uroviricota > Caudoviricetes > Slashvirus >
Host Bacillus megaterium
[NCBI] 		1404 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Bacilli > Bacillales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AGY48740.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KF669663 [NCBI]
CDS location
range 38043 -> 43955
strand +
CDS
ATGGTTGAACGCTTAAAACAAACAATCAGACATCCTAAGATGGAAGTGTTAGTGGATTTTAAAGGTTTGGGCCTGAACAGAATCAATGAGTGGGAAAATATCACTGATTATGTCCTAGATATTTCAGGTAGTAAGGAGAAAGCTACAGAATCAGTCGGTGGTGTTACTAGTGATATTGTTACATTTGCAACAGATAACAAAGGTAATGTATTTTCAAATACTAATCCTAAAAGCCCTTTTTATCAAAAAGTAAAATCGAATGTTGACTTTGTTCTCAAGACAGGATTTAAAGGTGAAGAGTTAAAAATTTATGCTGCTGGTATTATCACAAAATTCGCTCCTTCGTGGAATGACAAGAAATACAATGTAAGTGCTGAAGATTATTTTTATTTGCTGAAAAATACTGATGCTCCTAAAACAGCTTACCAGGATGTTTCATTAGATGAACTAGTGCATATCCTTTTAGATGCAGCTGAAATTCCTTCACAAATTAAGCGGATCATACCGAAAACTGAATTCAACTTTCAGTATTTTAAATTTGAAGAAGCTAATTGTTTTGATGCCCTGAAGAAATTAATGGAGATTTCCGTTGGTCAGGCATACTTTGAGGGGCTTAATTTTGTATTTGAAACAAAGTTAGCACTTGATTATGAATTAGATTTGACTGTAAAACACACAATTGAAGAGGATGACATCTTTACCTTTGACGAAACAATTGAAGATTCAGATATCGTAAATGCTGTTTCGATTATTTCTGATCCTAAGACGATCTTTCCAAAAGAGCTTGTATTTCAAACTCCTGAAAATATCGTACAGGTAAATGAAGAACCTATTACGTTTGGTGATGGTAGTTCGTTCTTTATTGACAATACTCATTTGCCAATCATCAACAATACTGAAAATCCTATTTCGGTAAAGAATTTAACTCAAGGCCGTACGATTAATATTCTTACTGTAGATAAAAATACAGGTAAAATCACAATCGCTCCTGAAAGTTTAGCTTATGTAGCAAAAGGTGACTTGTTAGTTGTTTCTTATTCTTATCAGCAACTAGTTTTACTTCCAGGCCAATCACGTACTTATTCACTTAGCTTATCAGGTGAGGTACACGCTCTTACAGACGTTGATGTAGCTGTTTGGGATGCAACAGGGCAATTACCTAGAGATTATTCAACAACGCCAAATAAAGCAAATACAGTATCTCTAAACCAATTCAACTTCAATCAAACTTCAGGTTTGGTTACTGTTGTTTTAAAGAACAACTATAATGAAGGTATCACAATTTCTACGCTGCAATTACGTGGTAATCCAATTAAAAGTGCTAATCCATTAGAAATTTACGTTCGTGATCTTCCTTCTATTAACGAATATAAAAAGCAAGAAATACAAATCGCTAACAATTACTTCACGAATACGAAGTTAGCTCAAAAAATTGCACAATACATTGTAGACAATCGTTCTCAACCTAGAAAGAAAATCGGCGTTGATATGGATGGTTACACTGAATTAGAACTTAATGATATCGCAAAGGTAATTGAAAATGAAAGCGGAACAAACCATACGTTCTACGCTGATCGTATCGATTATTCTTTTTCTGCTGATGGTGGGTGGACTGCTAAAGTTACATTTACTCAAACTGAAACTGAACAATGGGTGTATGAATCATTCAAAGGTGAATCATGGGAGAAAACAAATCCTGGAAATCCTATCGATGACTTCATTTTCGATATCAATGCAAATATGATTAAGAATGGTGGAGCTGAACTTCATACTGGAATTGCTGATTATGTAGATGCTGGTGCAATTGGTTCTGCTCATTATGTTCCGGACTATTGGAGATTCACACGTTCAACAGGAAATGCTTCAGCTAGGATTCGTACCGGCGGTGAATTAGCTTTACATGCGGATCAGTCTTTCGAAATCTCAGCATCAAATAGCGGTTCAGGTTATTATGAACAAACTATCGAAGGTGTTGTTCCTTCTAAGACACATTCAGCTTCTTTTATAGCACGTTTAGATGGGTGTACCGGCGTCTTTATCGTTGAGCAATACGCTAACACTAGTTTAATCAAAACGCTTTCATATGACCTTCCTGAAGGCTTAAAAGAATATGAATTCCAATTCGCTTCTGAACCTACAGCAACTTCTTTTATTGTCAAGTTTAAAAAGAAAGCTGGTACAAAAGGTTCTGAATCAATGATCTTTGACAAAGTAAAAGTTGAAGAAGCCGACAAAGCTAGTTTGTATTTAGAAGCTAATGAAACTCAAAGTGTTCAAGCTGGACAAAAGTATGATAATTCAGTTATAATCGGTAATAACTACGGTGTATCGGTTTATGATGCTAATAATTCTCAACGTGTTCGCATGGGCCAATATGCACCAGGAAAGTACGGTATGCGTATTGACAATGGAGCACTTGAAATTGTTAACGGATTATTATATGAACAACTAGCTAATGATGTAGGTAAAAAGTTAGACATCAGCGCAAATAACGCTATAACAAGTTTAGCTATGAGTATGTCAGGTCTTGATGGTGATTTAGATACAGTTTCAGGTATCGTCAATAGTCATACAAGCCTTATCCAGCAGAACTCTGAACAGATACAATTAAGAGTTTTATCGTCAACATACAAAACGGATAAGGATGGAATATTGAAACGTCTTTCTGACAATGAAACGGCTATCAGTCAAACGGCCCACGATATCACCTTACTTGCTACTAAAGACTCTTTAGATGAATTAGGTAACGTTGTTGAATCAAATACAGCAGCAATCAATGTCAATGCTACTGCTATTACTCAACGTGTAACAACATCAACTTTCAATCAGGCCATTACTGATACTAAAGCTTATGCTGATTCTGCTGCTACTTCTAAAGCAAATACCGCTGAAAGTAATGCTAAAGCTGCTTCAGAAAAGAATATTCACATTGGCAATACTTCGCCAACCGACACAACGAGAAAATGGTTAGATACAAATACAACCATTCCGATCTTGAAGTATTATACAGGTGGAACATGGAAAAAGTTAATTCCTACAGCTGCTTCAGATATTGGCGCTGAAACTCCATCAGGAGCACAAACTAAAGCAACAACAGCGGAAACAAACGCTAAAAAGTATATGGATTCAGTGAATGCAACAATTCAAGATCAATTCACGGCCCAATCATCAAGCATTACTCAACTTTCGAACAGAATAGATAGTAAAGTTGAATCAACAACTTACACTCAAGGTATCGCTGATGCTAAAACTTACGCTGATGGTAAAGCTTCTACAGCTGAATCAAACGCAAAAGGATACGCCGATACTAAAGATACCGCAACTTTAAATAGCGCTAAAGGTTATGCAGATACTAAAGATGCTGTTATCGTCGAAAGAGTAGAAACGAATTCATCTTTAATTAGTCAACAAGCGGATAAAATTTTATCTATGGTTACTAAAACCGAATTCAATAGCTTGAAAATCGGTGGTCAGAATAAAGTAACTGGAACTGATTTTAAAAACGCTGTAGGATGGACTAGATGGAATGTTGGTACACTTTCATTTGCTCAAGCTGATTCTAGTATGCCTAAAAATTATCTGAAAGTAGAAACAAAAGATGGATCAGGTAACAATTTAACTGTAGCAAGCGGTCAAGCGATAGGTTTACAACATAGTGGACGAACTTTCAGGGTAATCGCTGGTCAAACTTATACAGCTTCTATGATAGTTGCTACTAGTGAATTAGGCGGTATGTTGGATTATCTTTATGTAATTCACAAAGATGGTCAAGGTAACAAGAGATTAACCAACGTTGATACAACTAATTTCGTAACTGTTCATCCTGCTTATAGTGGTGCTCCTTCAACTTATGATTTCAGAATGGTTTACTTCACATTTACAGCAGCACGTACAGATGATGTTTACTTGTTAATCGGCGGTACAACTAAACGTGACTTGGGTTCTACTGCTTATGCCTGGATTCGTTTATACGATTTCAAAGTAGAAGATGGTGATAAAGCTACTGCTTGGACTCCTTCAACAGAAGATGTTAAACAAGATATCAACACACTTTCTACTCAAATCAGTCAAACAGCTGAAGATATCTCATTGAATGTTGTTAAAAATAACAAAGTATTGACAGCTATCAACGCTTCAGCAGAAGGCGTTAAAATCAAAGCTGATCGTTTAGATATCACTGGATTAGTTACCTTCAACGTACTAAATAACGATATGCAATCAAGAATTTCTAATGCAGATCAAGCTTATGCTGATACTGTTAGATGGAAATTACCAAATACAACTTTAATCAATGGTGGTTTAATTGCTGCTGATACAGTTACAGCTAGTCAGATTTTAGTTGGATCGTGGGAAAACCTTTACCAAAACGGCGGTTTCGAAAAGAAAGATGCTGGATGGAAAAATGCTTCTGTTTGGTCAGTAGTTTCAACAGCTCCTTACAATGGAACGTATCACGCTGAAGGAACTTGGGGTAGTAGCGGTGCTGTTTCTTACTATGATGACCGCGAAATTGATGTCAGACCAGGAGAAAAATATTACTTCGAAGGTTATTTCCGTACAAAAACTTCTACTACAACGAAAGCTAGAACTATCCTGGTGAGATTTAAAGATAAAACAGGATCTTATTCTTACAATATCGTTGAAGAAACGTTATCTACTTCTTGGCAAAAGTTTTCTTATGTTGTAGATATTCCTTCTGATTGTGTATCGATGACTATAGGTTTATCTGTAAAAGGCGGTATGCCTTCAGGAAATTCAACATATGCAGATAACTTATTCTGTAAGCGAATGACAGACGGTTCTTTGATTGTCGATGGAACAATTACAGCTAGTATGATTAAATCATTAAATGGTTTAAATATTGGTAGCGGTCAGTTTACAGTAGATGGATCAGGCAACGTAATTATTGGTGGTGGAGCAACTTTAAGGGCCGCTAAGTTTGAAGGTCTAAGAGGTAACACAATTTCATTTGGCGATCACGGTGCTAAAATTGATACTTC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Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
d93b15c8edfa5ba205df39be6a3badb63b6a8f44c0f406d81a7b32345722f11e
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,6619
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50