Protein

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Genbank accession
AIX30747.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MPLNYLTGRVSRLQVGFPGFSTAKDLTVDVAGAIGIDTQNPRAAADFPDVSIRGDIVDSVGFTGGIGYFLAQDVQGVRWVEAPPINSNAILVLDNGVIVGAGSFIGLNFDSGKDEDFLSVVPDPLNPQIAKIAYDVRWVRYNYGNNKGISTGFGDNGDYSSIPGYGTTEAVGVTSVGIGTNQPLDDFQVGIGSTGVTINGPLGLVDAEIIKAKSISVEGNLEVESLIVRPGVATLTTLDVLNEAFIPVEYVGFSSIQDANIDALFANQLLAGITTLGFGGEDVFILNDLYVQGGLGTFDGDVFVGGDLTVKGETFFNQINAVNLSVSGIATIVQAEIAVGLVTDLKVSGFSTLSDFSFNIGVGTYLELEDLDVSGVGSFGVVNSGDINVSGGLTASEIDADKGYIGILTADSIVSGAGTIGSIESDGNLTTLNDIIVGGASTFVGLGTFQDDLFVGGDLFVRGDVTFKNINGEQLLISGIGTIKELVFDSGIGTSLEVRDQITTGISTINEADIQDAAVERLTVGDAEIIGIATITEIDVDRGRVGILTGTDLSYAGIGTITEIDVDQGRVGLVTGDTLLYYEQSRINRVTFFDNYLSVNQSLRVSGLSTFVGTGTFFNDLYVGGDLYVAGELNFKQLNGENLYLTGVGTIYDLRNTVGFITNLYVEESVTGLATISSLVGSSATITDFTGESLLIQNPFNPMPLDPTGIPGQGVIDSLLVRNLTSSNNILANDIDANFVDTDDLKAGVGTITDLEWTTAVGDDTTTNTLQVTDTATINIIDANQIDAEDANIGVATLSSLLVTGVTTFKGQVDIEDIEFVDQSVTGISSINILKFNVGYGTYLEVTDSVTGVGTIGLASITTAQVSFLDVRDEVVGASTIGVLSVTEGFAVSGFSTFVGFTTYKGDVFVDGNLTVTGFVSFTQLNADQSQIGILTVFDALDARTGVGTFKHLETVDSAVLSGVSTIGLTTFKNGDVNINRNLTVGGITTFIGNVFIEDTEFVELSVTNQANINKLFVNSGVATQFSIGVATITQSLTGIATIGDLNVTGLSTFVGLATFQGDVYVDSYLEVSKDVVVGSALTVPNLTFTDGDGQFLNIQEEVVGVSTIGFASITDEIVGTSTIFRSNIRDLAVSGLSTFIGDVLMGSNLDVVGDISGTNISIAQSVTSDTLFTRFADIEGSNTGVATIGFATITELFTEDLTVVGTSTFVGFTTMTGDLNIEGNLNVTGVVTFQQLDATQSQIGILTVFNYLDNQGDLRVVGFSTLGDFSANSGILTSIESGEIDVTGDVSIGGTLGVAGEVGFSSNFYTVGITTLASGTGIVTTGGDLYVGGNLFVYNDIVYDEIIGRNLDISGIGTIADLRVGLGSIADLRGTTLRYQTGIITSLRAEDSEVGRHIGTSVVVENITATGPSTFVGVVTTTNELFVGTNLFVGNNADIQGDIFGRNLTLELNASGTTLDFDSGQIDDLISQYILSDDLFVTGITTSVAAQINFLNVSGVTTSPIINSTLLTNSGLVTTGSLYVQGLAQVETTLLVDGNSIFNGPALFNDTVTVNDDINVTGDITFNDISGINGNFAGIVTATKLKSNFLEVNGQTAITGLATFFSGLNVRGGPLVVDNQIFANSGFVTTIQGTDLTYTDGIFLGDLQVNKDTTINQNLRVVGITTSTNLDVSAQTETSLLSVTGVGTIPILYSTNGEFKTSLKTDQLFFNTGLGTYLSVTDLNVVGVATIPTLDIEFLEADRAEIGILTVTNRTDISDTSSIFSYRLTTSGSATNVTLYDSSVYRSFEANIQVSTGSSFQSSKMHGLSDDNSTPNVLFNETSYLSNGGELAEFDVSGSAGNNVILTVTPYTVGITTYILSVTAVRV
Physico‐chemical
properties
protein length:1868 AA
molecular weight: 195186,84450 Da
isoelectric point:4,05003
aromaticity:0,07976
hydropathy:0,29775

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage ACG-2014f
[NCBI] 		1493511 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIX30747.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ019097 [NCBI]
CDS location
range 197822 -> 203428
strand +
CDS
ATGCCTCTAAATTATCTTACCGGAAGAGTAAGTAGATTACAAGTTGGATTTCCAGGGTTTTCAACAGCAAAGGACCTTACAGTTGATGTAGCAGGTGCCATTGGTATTGATACCCAAAACCCAAGAGCAGCTGCCGACTTCCCAGATGTCAGTATCCGTGGTGATATTGTTGACTCTGTTGGATTTACCGGTGGTATTGGGTATTTTCTAGCGCAAGATGTTCAGGGTGTTCGGTGGGTAGAGGCTCCACCTATCAACTCTAACGCCATCTTAGTGTTAGACAATGGAGTTATCGTTGGTGCTGGATCATTCATTGGTCTAAACTTTGACTCTGGTAAGGATGAGGACTTCCTCTCGGTTGTTCCTGACCCACTAAACCCACAGATTGCAAAGATTGCATATGATGTTCGTTGGGTAAGATATAATTACGGTAATAATAAAGGTATCTCCACAGGTTTTGGAGATAATGGTGACTACTCCTCTATCCCTGGTTATGGAACCACAGAGGCAGTTGGTGTTACCTCAGTTGGTATTGGTACTAACCAACCACTAGATGACTTCCAAGTTGGTATTGGATCTACTGGTGTTACTATCAACGGACCTCTAGGTCTAGTTGATGCAGAAATTATTAAAGCAAAATCAATCTCGGTTGAAGGAAACCTAGAGGTTGAATCACTTATTGTTAGACCTGGTGTTGCCACTCTAACCACTCTAGATGTATTGAACGAGGCGTTCATACCAGTAGAGTATGTTGGTTTCTCCAGCATTCAAGATGCAAATATTGATGCTCTCTTTGCTAATCAGTTACTAGCAGGTATTACTACCCTAGGTTTCGGTGGTGAAGATGTATTCATCCTCAACGACTTATATGTTCAGGGTGGTTTAGGTACCTTCGATGGCGACGTATTCGTTGGTGGAGACCTAACTGTTAAGGGTGAGACGTTCTTCAACCAGATTAACGCAGTCAACTTATCAGTATCTGGTATTGCCACTATCGTCCAAGCGGAGATAGCTGTTGGTTTAGTTACCGATCTAAAAGTATCTGGTTTCTCTACACTATCAGATTTCTCATTCAACATTGGTGTTGGTACATACCTAGAACTAGAAGATCTAGATGTATCTGGTGTTGGTAGTTTTGGTGTTGTCAACTCTGGTGATATTAATGTTAGTGGTGGTTTAACCGCTAGTGAGATTGATGCAGATAAGGGATACATTGGTATTCTCACAGCAGACTCTATTGTATCTGGTGCAGGTACTATTGGTTCTATCGAGTCTGATGGGAACCTAACAACACTTAATGATATTATTGTTGGTGGTGCTTCAACCTTCGTTGGTTTGGGTACTTTCCAAGACGATCTCTTTGTTGGTGGTGACCTCTTTGTTAGAGGTGATGTTACCTTTAAGAATATTAATGGTGAACAACTACTAATCAGTGGTATTGGTACCATCAAGGAACTAGTCTTTGATAGTGGTATTGGAACCTCACTAGAAGTGAGAGATCAGATTACGACTGGTATATCTACGATCAATGAAGCAGATATTCAAGATGCCGCTGTTGAGAGACTCACTGTTGGTGATGCAGAGATCATCGGTATCGCAACTATTACCGAGATTGATGTAGATAGAGGTAGAGTTGGTATCCTAACTGGTACAGACCTCTCCTATGCTGGTATCGGTACTATCACGGAGATTGATGTTGACCAGGGTAGAGTTGGTCTAGTCACTGGTGACACACTACTATACTACGAACAGTCTAGGATCAATAGAGTTACCTTCTTTGATAACTACCTATCAGTTAATCAGAGTCTAAGAGTTTCTGGTCTCTCCACCTTTGTTGGAACAGGTACATTCTTTAATGACCTCTATGTTGGTGGTGACCTATATGTTGCTGGTGAACTAAACTTCAAACAACTCAATGGTGAGAACCTATACCTAACTGGTGTTGGTACCATCTATGATTTACGTAACACTGTTGGCTTCATTACTAACCTCTACGTAGAAGAGTCTGTAACTGGTTTAGCAACCATCAGTAGTCTAGTTGGTTCTTCCGCCACTATCACAGACTTCACTGGTGAGTCACTACTCATCCAGAATCCATTCAACCCAATGCCTCTGGACCCAACTGGGATCCCAGGACAGGGTGTTATTGATAGTCTCCTAGTTAGAAACCTAACTTCCTCTAACAACATTCTAGCCAATGACATTGATGCCAACTTCGTTGACACCGATGATCTAAAGGCTGGTGTTGGTACTATCACTGACCTAGAGTGGACTACCGCTGTTGGTGATGACACTACTACCAATACTCTACAGGTTACTGATACAGCAACCATTAACATCATCGATGCCAATCAGATCGATGCCGAAGATGCTAATATTGGAGTTGCCACCCTCTCTAGTCTCCTAGTAACTGGTGTCACTACCTTCAAGGGTCAGGTTGATATTGAGGATATTGAGTTCGTTGACCAGAGTGTCACCGGTATTTCCTCCATCAACATTCTCAAGTTTAATGTTGGTTATGGAACTTACCTAGAGGTCACTGACTCAGTAACTGGTGTTGGAACTATTGGTCTTGCCAGTATCACAACCGCTCAGGTATCCTTCCTAGATGTAAGAGATGAGGTAGTTGGAGCATCCACTATTGGTGTTCTATCAGTAACTGAAGGATTTGCAGTATCTGGTTTCTCCACCTTTGTTGGTTTCACTACCTATAAAGGAGATGTATTTGTTGATGGTAACTTAACTGTTACTGGTTTCGTTAGTTTCACACAACTAAACGCTGATCAATCACAGATTGGTATCCTAACTGTATTCGATGCGTTAGACGCCAGAACTGGTGTTGGTACATTCAAACACCTAGAGACAGTAGATAGTGCAGTTCTATCAGGTGTATCTACCATTGGACTCACAACCTTCAAGAATGGTGATGTTAATATCAACCGCAACTTAACAGTTGGTGGTATCACTACCTTCATTGGTAATGTTTTCATTGAGGATACTGAGTTTGTAGAACTAAGTGTTACCAATCAGGCTAACATTAACAAACTATTTGTAAACTCTGGTGTTGCAACTCAGTTTAGTATTGGTGTTGCTACTATCACCCAGTCACTAACAGGTATCGCCACTATTGGTGACCTCAATGTAACTGGTCTTTCTACCTTCGTTGGTCTCGCTACCTTCCAGGGTGATGTTTATGTTGATAGTTACCTAGAAGTATCTAAGGATGTTGTAGTTGGTTCAGCACTAACAGTTCCTAACCTTACATTCACTGATGGTGATGGACAGTTCCTCAATATTCAGGAAGAGGTTGTTGGTGTATCCACTATTGGTTTTGCTAGTATTACAGATGAGATAGTAGGAACTTCCACTATCTTTAGATCCAATATTCGTGACCTAGCAGTATCCGGTCTCTCCACCTTTATTGGTGATGTGTTGATGGGTTCCAACCTAGATGTGGTTGGTGATATATCTGGAACTAATATATCAATTGCACAATCAGTAACCTCCGACACCCTATTCACTAGGTTTGCTGATATTGAGGGATCCAATACTGGTGTTGCTACTATTGGTTTCGCCACTATAACCGAACTCTTCACTGAGGATCTAACGGTTGTAGGAACCTCCACCTTCGTTGGTTTCACAACGATGACGGGAGACCTAAACATTGAGGGTAACCTTAATGTAACTGGTGTTGTTACCTTCCAACAGTTAGACGCAACTCAGTCACAGATTGGTATCCTAACGGTATTCAACTACCTAGACAACCAAGGAGACCTAAGAGTAGTTGGTTTCTCCACACTCGGTGACTTCTCAGCCAACTCCGGTATCCTTACCAGTATTGAATCTGGTGAGATTGATGTAACCGGTGATGTTTCTATCGGTGGAACACTAGGTGTTGCTGGTGAAGTTGGTTTCTCTAGTAACTTCTATACCGTTGGTATTACTACCCTCGCTTCTGGAACTGGTATTGTTACTACTGGTGGTGACCTCTATGTTGGTGGTAACCTATTCGTATATAACGATATTGTATATGATGAAATCATTGGTCGTAACCTAGACATCAGTGGTATTGGTACTATCGCAGACCTCAGAGTGGGTCTTGGTAGTATCGCAGACCTTAGAGGTACAACACTCAGGTATCAGACTGGTATTATTACTTCACTCAGAGCAGAAGATTCTGAAGTTGGAAGACACATTGGTACCTCAGTTGTTGTAGAGAACATAACTGCTACTGGTCCTTCTACTTTCGTTGGTGTTGTTACTACTACTAACGAACTCTTTGTTGGAACTAACCTATTCGTAGGTAACAACGCAGATATCCAAGGTGATATCTTCGGTAGAAACCTAACACTCGAACTAAACGCCTCTGGTACTACACTAGACTTTGATTCAGGTCAGATCGATGACCTTATCTCACAGTATATACTCTCTGATGACTTGTTTGTCACTGGTATTACTACTTCAGTTGCGGCACAAATCAACTTCCTGAATGTATCTGGTGTAACTACTTCACCTATCATTAACTCCACACTACTAACCAACTCTGGTTTAGTTACAACTGGTAGTCTATATGTTCAGGGTCTAGCACAGGTAGAAACAACTCTACTTGTAGATGGTAACTCCATCTTCAATGGTCCAGCACTCTTCAATGATACAGTTACAGTCAATGACGACATTAATGTAACAGGTGATATCACCTTCAACGATATCAGTGGTATTAATGGTAACTTCGCTGGTATTGTTACCGCAACGAAACTCAAGTCTAACTTCCTAGAGGTTAATGGTCAAACAGCCATTACTGGTTTAGCAACCTTCTTCAGTGGATTGAATGTAAGAGGTGGTCCTCTAGTAGTAGATAATCAGATCTTCGCTAACTCTGGTTTCGTTACTACCATTCAGGGTACTGACTTAACATATACTGATGGTATTTTCTTAGGTGATCTACAGGTCAATAAGGATACAACCATCAACCAGAACCTAAGAGTTGTTGGTATCACTAC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Tertiary structure

PDB ID
2f36379e6930ef32dc13c7ce694ae2ce9c392f26c655e47bbc5065fe4fd92fb9
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,4651
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Ecological redundancy of diverse viral populations within a natural community Gregory,A.C., LaButti,K., Copeland,A., Woyke,T. and Sullivan,M.B. 2015-03-20 — GenBank