Protein

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Genbank accession
ATE84846.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,71
Protein sequence
MTPILYEKQSDRINYSTGTSTPQVVTGTNASNQTSNVYKTSLTSGQMFTQWGVGAPFTISFDYTVSVPSGSTLSGSMIPQWNNTPWGIGGTTATIAASGHYSFTGAVASSWSGTSATIVGLRFDNFVGTITITNWKFEQGSADYSDAGIGFLQDALTCTVDEQRNGDFTLSMTYPVDGIHSSDLVINNAIKVNVGTTLLGQIFIIKTVTTEVDTGIITVYAEHIRYLINDLIMKPTGSVTGTAQVALNYWLTQLVENSDLFTVTSDITTSETVTIGSPDFTTAQLALGGQDGSILDTYDGEYKFDNLNISLLKQRGKSSGATITYGKNLTTATQENDITNTVTSIVPYATITTEDSSGNDVNTVHWLTPMYIDSEYASNFPHRVFELVDFSSSFQQSSDDTTLPAYSDTEMTTLATQYMKDNSWGEPTVSITVNTIDLARSLNGGNSDNIELCDWVNVYFENIGIQTTAECSEAIWDVLAEQYTSYTFGALTTTLGDQITQVASDTSDAVGALVQQVQKVTDSAGHTDYTIESSEAMPTEANPGDTLFVEDGSDIVIYTWATGTDGNYTWVKKVGTDNAAASAAASLASSQAAVATQSASAAAASAAAAENNASLAQISAASAYASAVAASTAANSASQAASTANSNVTLAQSSASTANSNAALAQSSASAAVKSAASAYGSAQTAWSNASAALSSANALQSSLANVSSAVSSYATSAGVAVSNAIQSAENYTDDTKANIEAQYSSVNKVVNTEFDTHDAEKEVTTPAVSMPTPNTNGYPDQNIINNLVANSSFNPDAGNWDIITQSGATGTTITGAHSVMDWNGDGVDIVEITNTNGSGQYRIMSKPIPLTELDLTKPISIGFRYYPFTFGTSGSFFHQVEYLNAAGEEIGHTGIGSFTTGSGWNNFQQNAITLAPVTGTVSIALLFDVRGSGTHVGIAAPYLVNASNGTPYMTSNYDGSPITIHDPADGTYEISGKATIPYTNYVSSPLNEVSLNDTTAVTELYSLSTALTVGNTYAIRADFVYEPTASTYGTLSLIMTGVTNQTVASGIALDPTQVNHVYYVFTATSANTAISAQVTNTTDNLVFSAPALIDSRLIEVEDNTSKVVGSEDLGDKYNSDKIVEDDLSAISTVQHDNDNSTNQLSGASAMNETTVQVKDPSGNTVQKFTHIGTKNLITDSEMLLGLQTSSANGWNNGNSAGTIVTGAYTDSSSKTHNAIQISQSSATSSVVVSHDIDIEIGQTYYWQCYVRVVSGVTIGTGTMDIHMDGRTSAGVSSENSANTSVNTGSAYAWKLYTGVYTPTNASTDVLRLRFENLTTGTVQFTQPIVTQSVSLPYFADTVDKTPFTYTLPSDGKTYTQTVSSQYLIDHHNNVENSDILNNGVSWSAVDFDNWNVLSEPDEQYYGSNIWEFNSSTAVIDHIRSVATTQNLILNGWYTAAFTYKFLSDVATSSSGYYHMTISLWNSNHVRILYSDVNLSITNDWTTQYARIQVPTGAYSISLELGVSGTGHIYMTHPLLYATDDDFTDIIYEPDSNPVVSTTKITTFTQIDRSSFDFTIPANSGNDTLIAGAQGNYPFTVAQNLWPIAFNGITIDESGNFIGTGYPAGAQIFASNATSNDTYSCYADSNGNFVLAVSTFGEVLQFNYEYYEAISVITNWKDNVDNNFDAQKATVASELYNNSKVLEIEGASQTVNLDAQEIAVFAGQVVSAQVTAKIVSGTGVPQLQILCMDSSDNQLEVLKAVNITGSTFTDFIANDLTTITNTANVKFRIYVPSGTVVRISQPILVFLSAVAGYTVGTGVNASAILGLFSDSFALGLFDNSGAIITGINGTSSAMKITGKNIYLNGDTTVTGGFWADNIDAVQVNANTGIFGQIQTENLTAATIDVDQLTGNISNFITSYWEDPYKNSITVNGSQIVLSNPNNDSEMTLNANGVYLKTGGLQISPKTGGRYGIYVTKWGDYNGTLTSSLGAYIGTNNDNQDGFIAFTGNGLGTTLLWADTNMSSGAQQVMGGAWNFYQEILMSSATRIYFYNGNNYIYGGSTGLYLSGLSYVYSNHAITVSSKLSKKNIHGDYQLNALDEIIKTIPSIKLFNYKTDPDDTPETLSPIIDDVHKKSEFYIPKIINNGEGIDTYSMISLAYLGIGKLNEKQNSLEKRINTLELAIGDKK
Physico‐chemical
properties
protein length:2170 AA
molecular weight: 231327,29540 Da
isoelectric point:4,27744
aromaticity:0,09401
hydropathy:-0,13355

Domains

Domains [InterPro]
DC_1274
ATT
116–794
DC_1274 G3DSA:2.60.120.260 DC_0203
IPR007119
Unmapped
159–489
IPR007119 IPR030392
IPR010572
ENZ
293–501
IPR010572 Coil
ATE84846.1
1 2170
Architecture
ATT
STR
RBD
ATT 116-794 | STR 1175-1333 | RBD 2031-2168 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Oenococcus phage vB_OeS_unk162
[NCBI] 		2036701 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Oenococcus oeni IOEB S277
[NCBI] 		1428431 Bacillota > Bacilli > Lactobacillales > Lactobacillaceae > Oenococcus > Oenococcus oeni

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
ATE84846.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MF939898 [NCBI]
CDS location
range 14802 -> 21314
strand +
CDS
ATGACACCAATCTTATATGAAAAACAATCAGATAGAATAAACTACTCAACAGGTACATCAACACCTCAAGTTGTTACTGGTACGAATGCTTCTAACCAAACAAGTAATGTATACAAGACGTCCCTAACTTCTGGGCAAATGTTTACTCAGTGGGGTGTTGGCGCCCCGTTTACAATTTCATTTGATTATACAGTTAGTGTTCCGTCTGGAAGTACGCTTAGTGGGTCTATGATACCGCAATGGAATAATACACCATGGGGAATTGGTGGAACGACGGCCACTATCGCAGCTTCCGGACATTATTCATTCACTGGTGCAGTTGCTTCGTCATGGTCAGGAACTTCCGCAACCATTGTGGGGCTCAGATTTGATAATTTTGTTGGAACAATAACAATAACAAACTGGAAATTTGAACAAGGAAGCGCCGATTATTCAGATGCTGGAATCGGTTTTCTTCAAGACGCTCTCACGTGTACTGTTGATGAACAACGAAATGGCGATTTTACGCTATCGATGACTTATCCGGTCGATGGCATTCATTCAAGCGATCTTGTAATAAACAATGCAATAAAAGTCAATGTCGGAACAACTCTGCTCGGGCAGATTTTTATTATAAAGACTGTTACAACCGAAGTTGATACAGGTATCATCACGGTTTATGCCGAGCATATTCGTTATTTAATTAATGACTTGATAATGAAACCAACGGGTTCAGTAACTGGAACTGCTCAAGTTGCATTGAATTACTGGCTTACTCAATTAGTCGAGAATAGTGATTTATTTACTGTCACGTCAGATATAACAACTAGTGAAACAGTGACAATTGGTTCGCCTGATTTCACAACTGCTCAATTAGCTTTGGGCGGTCAAGATGGTTCTATTCTTGACACATATGATGGCGAATATAAATTTGATAATTTGAATATTTCTCTTTTAAAGCAACGTGGAAAATCAAGTGGTGCAACTATCACTTATGGCAAGAATTTAACGACTGCGACACAAGAAAATGATATTACCAATACCGTTACATCAATCGTCCCTTATGCGACCATTACAACAGAAGATTCTAGTGGAAATGATGTTAATACAGTTCATTGGCTCACGCCGATGTATATTGATTCAGAATATGCATCTAATTTTCCTCATCGAGTATTTGAATTAGTTGATTTTTCAAGCAGTTTCCAACAGAGTTCAGACGATACAACTTTACCGGCTTATTCTGATACAGAAATGACAACTCTGGCTACTCAATACATGAAAGACAATTCATGGGGAGAACCGACTGTTTCAATCACTGTGAATACGATTGATCTTGCTCGTTCATTGAATGGCGGAAATTCTGACAATATCGAATTATGTGATTGGGTCAATGTTTACTTTGAAAATATTGGAATTCAAACAACAGCAGAATGTTCGGAAGCAATTTGGGACGTTTTGGCAGAGCAATATACGTCATATACTTTTGGTGCATTAACTACTACTCTTGGCGATCAAATTACACAGGTTGCATCTGACACAAGTGACGCTGTTGGTGCCTTAGTTCAACAAGTTCAAAAAGTAACAGATTCAGCAGGTCACACTGATTACACAATTGAATCTAGTGAAGCAATGCCAACTGAAGCAAATCCCGGCGATACTCTTTTTGTTGAAGACGGTTCAGATATTGTTATTTATACTTGGGCAACAGGAACAGATGGAAATTACACATGGGTTAAAAAAGTAGGAACTGACAATGCGGCGGCAAGTGCGGCGGCTTCTCTAGCTTCATCACAGGCGGCAGTTGCAACTCAAAGTGCAAGTGCGGCGGCGGCAAGTGCGGCGGCGGCTGAAAATAATGCAAGTTTGGCTCAAATATCAGCGGCAAGTGCTTATGCAAGTGCGGTAGCGGCTTCAACTGCTGCAAATTCTGCTTCACAAGCGGCAAGTACGGCTAACTCAAATGTTACATTGGCTCAATCATCTGCAAGTACTGCTAACTCAAATGCTGCATTGGCTCAATCATCTGCAAGTGCCGCTGTTAAGAGTGCGGCAAGTGCTTATGGCTCTGCACAGACAGCGTGGAGTAATGCTTCGGCGGCTCTTTCATCTGCAAATGCTCTACAAAGTTCATTAGCAAATGTCAGTTCAGCAGTTTCAAGTTATGCAACCAGTGCAGGTGTTGCTGTCTCAAATGCAATTCAATCAGCAGAAAATTATACTGATGACACAAAAGCAAATATTGAAGCTCAATATTCGTCAGTTAACAAAGTTGTTAATACGGAATTCGATACACACGATGCAGAAAAAGAAGTAACAACACCAGCTGTTTCAATGCCAACTCCTAATACGAATGGCTATCCTGACCAAAATATTATCAATAATTTAGTTGCTAATTCATCCTTTAATCCTGACGCTGGCAATTGGGATATCATAACTCAAAGCGGAGCTACAGGAACAACTATTACTGGAGCACATAGCGTAATGGATTGGAATGGAGACGGCGTTGATATTGTTGAAATAACCAATACTAATGGTTCTGGACAATATAGGATAATGTCTAAGCCTATTCCACTAACAGAATTAGACTTAACAAAGCCTATTTCTATTGGTTTCAGATATTATCCGTTTACTTTTGGGACTAGTGGCAGTTTTTTTCATCAAGTAGAATATTTAAATGCCGCTGGGGAAGAGATAGGGCACACAGGTATTGGAAGCTTTACTACAGGCTCAGGGTGGAACAACTTTCAACAAAACGCCATAACTCTTGCTCCGGTTACCGGAACTGTTTCGATTGCCCTTTTGTTTGATGTTCGTGGTTCGGGTACTCATGTAGGTATTGCCGCTCCATATTTAGTTAATGCTTCGAACGGAACACCTTATATGACAAGCAACTATGATGGATCGCCTATTACAATTCATGACCCAGCAGATGGAACTTATGAAATTTCTGGCAAGGCCACAATTCCTTATACGAATTATGTTTCAAGTCCATTAAATGAAGTTTCTTTAAATGACACAACGGCTGTCACAGAACTTTATTCATTGTCGACTGCACTAACGGTTGGAAACACATATGCAATCCGTGCCGATTTTGTCTATGAACCTACTGCGTCAACTTATGGTACTTTGTCTCTTATTATGACGGGAGTAACAAATCAAACGGTGGCTTCGGGAATTGCGCTTGACCCGACACAAGTTAACCATGTTTATTATGTATTCACTGCAACATCGGCTAATACAGCCATTTCGGCGCAGGTTACGAATACAACTGATAATCTAGTATTTTCAGCACCTGCTTTGATTGATTCAAGATTAATTGAAGTTGAGGACAACACAAGCAAAGTCGTTGGGTCAGAAGATCTTGGGGATAAATATAATTCAGATAAAATTGTTGAAGATGATTTGAGTGCAATCAGTACTGTTCAACATGATAATGACAACAGTACCAATCAATTGTCTGGTGCTTCTGCAATGAATGAGACAACAGTGCAGGTTAAAGACCCGTCAGGGAACACAGTTCAAAAGTTTACGCATATTGGAACGAAAAACTTGATTACAGATTCAGAAATGCTTCTTGGGCTCCAAACAAGTTCAGCAAATGGCTGGAACAATGGAAATTCTGCTGGAACAATTGTTACTGGTGCATATACTGATTCAAGTAGCAAAACACACAATGCAATTCAAATATCTCAATCATCTGCAACAAGTTCTGTTGTTGTTTCGCATGATATTGATATCGAAATTGGACAAACTTATTATTGGCAATGCTATGTTCGTGTTGTTTCAGGTGTAACAATTGGAACTGGAACAATGGATATTCACATGGACGGTAGAACATCTGCAGGTGTTTCAAGTGAAAATTCGGCAAATACAAGCGTTAATACTGGCTCGGCTTATGCTTGGAAATTATATACAGGCGTTTATACACCAACAAATGCTTCAACTGATGTTTTGAGATTGCGTTTTGAAAACTTGACGACTGGAACAGTTCAATTTACACAACCAATCGTTACTCAATCTGTTTCATTGCCATATTTTGCCGATACAGTTGATAAAACGCCATTTACTTATACATTGCCATCAGATGGAAAAACTTATACACAAACTGTTTCTTCTCAATATTTGATCGATCATCACAATAATGTTGAAAACTCTGATATTTTGAATAACGGTGTCAGCTGGAGTGCAGTTGATTTTGATAATTGGAATGTCTTAAGTGAACCCGATGAACAATATTACGGTTCTAATATTTGGGAATTTAATTCTTCGACAGCAGTTATTGATCATATTAGGTCAGTTGCGACAACTCAAAATTTGATTCTTAATGGTTGGTACACTGCGGCATTTACTTATAAGTTCTTATCAGACGTTGCAACATCTAGTTCTGGTTATTATCACATGACAATATCATTATGGAACTCGAATCATGTGCGCATTTTATATTCTGATGTTAATTTATCAATTACAAATGATTGGACTACTCAATATGCAAGAATTCAAGTTCCGACAGGTGCTTATTCTATTTCCCTTGAATTAGGTGTAAGCGGCACGGGGCATATTTATATGACACATCCATTGTTATATGCAACCGATGATGATTTCACTGATATTATTTATGAACCTGATAGCAACCCAGTTGTATCGACAACAAAAATTACGACATTTACACAAATTGACCGGAGTTCGTTTGATTTCACAATCCCGGCAAATTCTGGGAATGACACTTTAATTGCTGGTGCTCAAGGAAATTATCCATTCACAGTTGCTCAAAATCTCTGGCCAATTGCTTTTAATGGAATAACGATTGACGAATCCGGTAATTTTATTGGAACTGGCTATCCTGCAGGCGCTCAAATATTTGCTTCAAATGCAACGTCAAATGATACTTATTCTTGTTATGCGGATTCAAATGGTAATTTTGTTCTTGCCGTTTCAACTTTTGGCGAAGTGCTTCAATTCAATTATGAATATTATGAAGCAATTTCAGTTATCACGAACTGGAAAGATAATGTTGACAATAA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Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
5daf77a2ffe641dd152bf1d4a46f71c27f0b72481c02136de8ee7dd51fb5aa42
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,4666
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Genome sequence of a new lytic phage vB_OeS_unk162 of Oenococcus oeni Jaomanjaka,F., Philippe,C., Claisse,O. and Le Marrec,C. 2018-08-16 — GenBank