Protein

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Genbank accession
APU93302.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,72
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,91
Protein sequence
MSRSAFVEVNITNPTRLAQDSQDTANKAVKGVENLNDPNLMNVIEKQNNIVQFAGLTSQYSVLVQNAKDEGIDTTAVTTAYNNLNIFMADILADPDHASDIDRARYKKYQDAYNEELAKLQNDLQNNTNDKFTSAANAISQAASTANVAKSAADSAYTYANSEIAVQSTATAKAQSAADSAFSEAQKVGEQTSAEIAKQSEAIAGAQSKADSALSKAEEVDGKTSAEIAKQSAATAKAQSTADSAFKEAQSATAYTDKQIASQASAVSEVSKTATEASSKANSALDTANGANAEIMKLKGGSTATIAKLEDGLGTKVSNDTFDSYQTQTASQFAQTVKEADFKTYQTQTSKLIESKVDNGTYQTDKTQTAEAIASKVSSGEFKTYQTQTDKALASKVSGSDYESDREQTASQIADKVSNGEFSTYKTQTDKLIGSKVDNGAFKTYQTQTAELINSKVDNGTYQSDKTQTANQIASKVSSADFNSYKSQTDKAIISKVESSDFQSLQNQVQNSAVGANLIVQSGLEYGYLDRNTGGITSGGGDFHSENYIATNGATVFTFSSPDYVFKGAGNHTLAMYDSDKNYLGYQAITSPTQTLSKSNVAYIRFSMNFTDEGGTAGNLSDWLSNHRYKLEKGSVATDYSVNPEDQATQSQITQLSGQIDQKVSSGDFNSYKTQTDKLIGQKVDNGAFKTYQNQTAELIESKVDNGTYQSDKTQTVSQIASKVSSDDFKSYQAQTDKAIESKVDNGTYQSDKTQTASQISDKVSNGAFNTYKTQTDKLIAEKVSNGDFNTYKSQTAELISSKVATKDFSAYQATTAKAIESKVESSDFNTYKTQTAGEISSKVSSTDFNNLKISNRNLALNTATGFVMQGNNTTNQCLPFNTSKAITKGTTITVSFDIVSTTAIGTFLIQLIGGDWQQVTANGDNPLTTTKKHYTHTLVAMSDHTDGLQLRLDNATGKVTMTNFIISESSKEVSWTPAPEDQATQSQVTQLSNDINLRVTKNGLLDQINIQAGKTLISSSGQLTLSANSVFLDSANPVIMKSANIDKLLVGKKLTAADISANTFTTNNGTFTVKQDGSITAKNMTLNGGKLYSPTMNAGVINGSTINGTTFHSGDIISNPNNTAHYHSMTITPDGAYRSTYFDNAVGLQSIIESGGLQHKFRSMVAGSDGHFTAYNAALDGQGFHSQSGYTTSKDSEFNKPQTITGYVDVTPATGIYLSGPTQQISFAGNGSNAGHNGITMDAYGNIKGMISSATWNISSDNAKVAQFGIDHGGQNTIGFYRPTFVDEIGAIGGLANGRLFLHAQDGNAQMYLLNDGQPGFVSPTIYNRTYSNGANVYVTSYGRVGRSTSASKYKLAIARSNSTAQADRLMTLNPASWNDKVATEKVAESLSNGETPPESEINLNRHYGLIAEDLRDAGLDEFLITGKDGQIEGIEYDRLWTVLIPKIRQLNERINELERESL
Physico‐chemical
properties
protein length:1464 AA
molecular weight: 157048,10450 Da
isoelectric point:5,19971
aromaticity:0,07514
hydropathy:-0,54180

Domains

Domains [InterPro]
DC_0336
RBD
1–211
DC_0336 DC_2025 IPR030392
Coil
Unmapped
103–130
Coil DC_1418 DC_1334
APU93302.1
1 1464
Architecture
RBD
RBD
STR
RBD
RBD 1-211 | RBD 400-667 | STR 668-1394 | RBD 1395-1463 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Lactobacillus phage P2
[NCBI] 		1928330 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
APU93302.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KY381600.1 [NCBI]
CDS location
range 25954 -> 30348
strand +
CDS
ATGTCACGAAGCGCATTCGTTGAAGTTAATATCACCAACCCCACTAGACTAGCGCAAGATTCACAGGACACTGCTAATAAGGCGGTTAAGGGTGTTGAAAACTTAAACGACCCTAACTTGATGAACGTTATTGAAAAGCAAAACAATATCGTACAATTCGCCGGTTTAACATCTCAATACAGCGTTCTCGTGCAGAACGCTAAAGATGAGGGGATTGACACAACCGCCGTAACTACGGCATATAACAACTTAAACATATTTATGGCCGATATTCTGGCAGACCCTGACCATGCTAGTGATATTGACCGTGCAAGATACAAAAAGTATCAAGACGCTTACAATGAAGAATTAGCAAAGCTTCAAAACGATTTACAAAATAACACAAACGATAAATTCACCAGTGCCGCGAATGCCATAAGTCAAGCGGCCTCAACAGCTAATGTTGCTAAATCAGCCGCAGATAGTGCCTACACTTATGCCAATTCAGAGATAGCTGTACAATCAACAGCTACTGCTAAGGCTCAAAGTGCCGCTGACAGTGCATTTAGTGAGGCACAAAAGGTCGGGGAACAAACCAGTGCCGAAATTGCCAAACAGTCAGAAGCCATTGCTGGGGCCCAAAGTAAAGCTGATAGTGCTCTTTCCAAGGCCGAAGAGGTTGACGGCAAGACTAGCGCTGAAATCGCTAAACAATCAGCGGCCACTGCTAAGGCTCAAAGTACGGCTGATAGTGCATTTAAAGAGGCACAATCAGCTACGGCCTACACCGACAAACAGATTGCTTCACAAGCAAGTGCTGTTTCGGAAGTTTCTAAAACTGCTACCGAAGCTTCATCAAAAGCCAACAGTGCTCTTGATACAGCCAATGGTGCTAACGCTGAAATTATGAAGCTAAAGGGTGGCTCAACCGCAACTATTGCAAAGCTAGAAGATGGTTTAGGTACAAAGGTTTCTAATGACACGTTCGATTCATATCAAACACAAACCGCCAGTCAGTTTGCTCAAACGGTTAAGGAAGCCGACTTTAAAACTTACCAAACTCAAACCAGCAAGTTAATTGAGTCCAAGGTTGACAACGGAACCTATCAAACTGATAAAACACAAACTGCCGAAGCTATTGCTTCTAAGGTTTCCTCTGGTGAGTTTAAAACTTACCAAACACAAACTGATAAAGCACTTGCAAGCAAAGTTTCGGGTTCCGATTACGAATCTGACAGAGAACAAACCGCCAGTCAAATCGCAGACAAAGTAAGCAATGGCGAGTTCTCAACGTATAAAACACAAACCGATAAGTTAATTGGTAGTAAAGTTGATAACGGTGCTTTTAAGACTTATCAGACGCAAACTGCCGAATTAATTAACTCAAAGGTTGATAATGGCACCTATCAGTCAGATAAAACACAGACAGCAAACCAAATTGCCTCAAAAGTATCTTCTGCCGACTTTAATTCATATAAGTCACAAACTGATAAAGCAATTATTAGTAAGGTTGAATCAAGTGACTTTCAATCGCTTCAAAATCAGGTTCAAAATAGTGCTGTTGGGGCTAACTTAATCGTCCAATCAGGATTAGAATACGGTTATCTTGATAGAAATACTGGTGGTATTACCAGCGGTGGTGGTGATTTTCATTCAGAAAATTATATAGCCACTAATGGAGCAACTGTATTTACATTCAGCTCACCGGATTATGTATTCAAAGGGGCTGGTAATCATACTCTGGCAATGTATGATAGTGATAAAAATTATCTTGGTTATCAAGCTATAACTTCACCAACACAAACATTAAGCAAATCTAATGTTGCGTATATTAGATTCTCTATGAATTTTACGGACGAAGGTGGCACTGCTGGAAATTTATCTGATTGGCTAAGTAATCACCGATACAAGTTAGAAAAAGGTAGTGTAGCTACTGATTATTCGGTCAACCCCGAAGACCAAGCTACTCAATCTCAAATCACGCAATTAAGTGGTCAAATCGACCAAAAAGTAAGTAGCGGCGATTTCAACTCTTATAAAACTCAAACTGATAAGTTAATCGGGCAAAAAGTTGATAACGGTGCTTTTAAGACTTACCAAAATCAAACCGCAGAATTGATTGAGTCTAAAGTCGATAACGGAACTTATCAATCTGATAAGACACAGACGGTCAGTCAAATCGCTTCTAAGGTTTCATCTGATGACTTCAAGTCCTACCAAGCACAAACGGATAAGGCAATCGAATCTAAGGTTGATAATGGCACTTATCAGTCAGATAAGACGCAAACCGCCAGTCAAATTTCAGATAAGGTAAGCAACGGAGCTTTTAACACCTATAAGACACAAACAGATAAATTAATCGCTGAAAAAGTAAGTAACGGTGATTTTAACACTTACAAATCACAAACGGCTGAATTAATCAGCTCAAAAGTAGCTACTAAGGACTTCTCAGCTTATCAAGCTACAACTGCTAAAGCAATTGAAAGCAAGGTTGAATCTAGCGACTTTAACACTTACAAAACGCAGACTGCTGGTGAGATTTCTAGCAAAGTTTCAAGCACGGATTTTAATAACTTAAAAATCAGCAATCGTAACTTAGCACTCAATACGGCGACAGGGTTTGTTATGCAAGGTAATAATACCACTAACCAATGTTTGCCATTTAACACATCAAAAGCAATTACAAAAGGAACTACTATCACGGTTAGCTTCGATATAGTATCAACAACCGCAATAGGGACGTTCCTAATTCAACTCATTGGTGGAGATTGGCAACAAGTTACGGCAAACGGAGATAATCCACTAACGACAACTAAGAAACACTACACTCATACTTTGGTTGCTATGTCAGACCACACCGATGGTCTTCAATTACGGCTAGACAATGCAACTGGAAAAGTAACCATGACCAACTTCATTATTTCCGAATCTTCCAAAGAAGTTAGCTGGACGCCTGCACCAGAAGACCAAGCTACTCAATCTCAGGTTACGCAATTGAGCAATGACATTAACTTACGAGTTACAAAAAATGGTTTGCTTGACCAGATTAATATTCAAGCTGGTAAAACTTTGATTTCATCTAGTGGTCAACTGACATTATCTGCCAATAGCGTTTTCCTTGATAGTGCTAACCCCGTTATCATGAAAAGTGCGAATATTGACAAGCTCCTTGTCGGCAAAAAATTGACAGCGGCAGACATTTCCGCTAACACCTTTACTACCAACAACGGGACTTTCACGGTAAAACAAGATGGTTCCATAACAGCTAAGAACATGACGCTTAACGGTGGCAAATTATACTCGCCAACAATGAATGCTGGCGTAATTAATGGCTCAACTATTAATGGGACAACATTCCATAGTGGTGACATTATTAGCAATCCCAATAATACCGCTCACTATCATTCAATGACTATTACACCAGATGGAGCGTATAGGTCAACGTATTTTGATAACGCTGTTGGACTACAATCAATCATCGAATCTGGTGGGTTGCAACACAAGTTCCGCTCAATGGTAGCCGGTAGTGACGGACACTTCACCGCTTATAATGCGGCATTGGACGGTCAAGGGTTCCACTCACAATCTGGATATACAACATCTAAGGATTCAGAATTCAATAAGCCACAAACAATTACGGGTTATGTTGATGTAACTCCAGCAACTGGAATTTATCTAAGCGGGCCAACTCAACAAATTAGTTTTGCTGGTAATGGTTCCAATGCCGGTCATAACGGTATCACAATGGACGCCTATGGTAATATTAAGGGAATGATAAGTTCAGCTACTTGGAATATTAGTTCCGACAACGCCAAGGTTGCTCAATTTGGTATTGACCATGGTGGTCAAAACACAATTGGCTTCTATCGTCCAACATTTGTTGATGAAATTGGAGCAATCGGAGGACTAGCCAATGGTAGGCTATTTCTACATGCTCAAGATGGTAACGCACAAATGTATCTCTTAAATGATGGTCAGCCGGGATTTGTATCGCCAACGATTTATAATCGAACCTATTCTAACGGTGCAAACGTATACGTTACCTCATATGGTCGTGTTGGTAGGTCAACATCGGCAAGTAAGTACAAACTAGCTATTGCTAGAAGTAACAGCACAGCGCAAGCTGACCGTTTGATGACATTAAACCCAGCTAGTTGGAATGACAAAGTAGCCACTGAAAAGGTGGCTGAATCATTGTCAAACGGTGAAACACCGCCCGAATCAGAGATAAACTTGAATCGGCACTATGGTTTAATTGCCGAAGACCTACGGGACGCTGGATTAGATGAATTTTTAATCACTGGTAAAGATGGTCAAATCGAAGGGATTGAATATGACCGCTTATGGACGGTATTAATTCCTAAGATAAGACAGTTGAATGAAAGAATTAACGAACTTGAAAGGGAGTCCTTATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
db33b0d4b5692ec1a990939da9aa8c47674756fa34961c61d6b1d72f34b2f373
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5303
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome sequence of Lactobacillus virulent phage P2 Chen,X., Fan,M., Liu,Y., Wang,Z., Wu,W. and Zhang,H. 2021-02-05 — GenBank