Protein
View in Explore- UniProt accession
- Q58LL8 [UniProt]
- Protein name
- Baseplate wedge initiator
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MTNINKVSSAIVAQTPEFIESDYPLFNRFLEYYYQSQEKTGLGQNILNNFLGYLDIDRLDVGILDGKTKLVEAIDATSDTIVVESIDQFIEKSGSILIGSEVIYYESTTSSPNIALSPGISYDQVKLKWVNLFSPINLFDGTTTQFNLVSQDNPIAPPSAQHLIVSVYGEVLTPGTDYTVNGTTITYASAPRTKIPSDDAINTFITYLDGFVENQIVPLDNISNSFGEGKTQFRITRSGIAYEPIVDEYVVAIYDKRLLIPKVDYFIDGADFIFATAPTNGRFLSLHSIEAPVPSFGSGAEGFARVNDLGQLTSISTNVNGSNYRFEYPPKVSISTTVGSGGAAQALVNGIKTVTLLNGGKGYSDTNPPVVQIESPTKTGSIQATLKATVENGSVTAVELLGSGSGYTFTPRITFRQPGGATVATPTISNGSISGGLTITNAGFGYTTPPVVYVDEPTGNNPIRASFQTVLASDGTIASITTINAGQGYTSVPRVAIVDPVGAQVLQTVVDGDGRVIRIDILDGGSGYDEVPSVYIVDNRVDGTGAYAGGTGATATAAIFNGAITDINVSAFGSGYSASNPPSVVIQAPTSAEASAEIGLNEVTGFKVNQSGKGYNKAQFTGCARAASGIVEYTEDGNAVFSNDTTAASATVDTEVKCLDALFVKRLLDKYTQQFLPDVPELDYKKIDVRTAIKTIKDFYSAKGTSFSIAYLFKLLYGETVSISYPKDQIIKPSAATWSIDTILRATKVSGLATDIQDGLLQQDADIADPNVKGASALVENYISIKTSTVEIFELVLSEETITGTFTVPYKTKLAEPLNQTDSIITVDSTIGWPERNGEFVIGTGSGAELVQYKEKSLNQFIECTRSVNGIVEDWDSATEVSSNFQVKINKDTPQEVVMNVVGIVDAQQTTLTDTGSYYLQGDKLTVSKLGGTGTSPLLTTWLYNVKKLITVSGITFGGVNNQSATVTCSNNHGLLVGDQVTVYGANPIIYNGTFTVTSRDSETVFQYALPQPAAIVPQGNILVSVDLNKGKSDTTTILNAIGPYTTNIQNSFFNDNYTYVASTGIPNYSIGPFPGSALLPGNQRKLNRFPTLPTTISTKSEISSGPIGTWVNGVSVWSYKSTQSKTFGAITNIAITNAGQGYDAASPPVITISGGGGTGATANVVVNGSISEITVTAGGSGYTSSPLVSIVGGGGSGAAATAIITKGAVSRILINSGGTGYTSQPSITIVGGGGTGAAGTASVRGPINTVNITNGGSSYTSAPTVSLSSGSGAVAQPIVQNGRIISIAIISAGSGYTTAPEVSIQGVGFGAVARATIDTDGENAGRVTSITIINRGIGYVQGTTLINMTSVGQDAVFTPSVFKWTYNLQATSVLDAAKGGVFEGYNNQYGGEYAHLSNPQKLRFILGDNLQEAVVGTITEQETQLQHSPIIGWAFDGNPIYGPYGYTDPTDQSSEITRLRTSYRVKPALVQTSNNPSPVRTAGPLLSVEAAGNFVEDYEYVFNLGDLDQYNGRFCKTPDYPTGRYCYFVTIDATEAGNPEFPYVLGPSFNSVVDTWNLSTSAVQQNIPTGVVRYRDPYENVDIDVERAPNASTNALTTEDGAILLFDPEDTNRDGQIDAEESAEVNLGQLFEESPLQLFDYFPKVRFDSKVDIEVETTNKFEDANVTGFTIENSGQSYQVNDRLVFDNTGTGGDGASARVSRIKGETVSAYTFESISGNNFGVLTTSSPHNLVAGDSIFVDYTPVMDNTNKQFTVRQYKGIEEIQITQTGSGYNTDIPPTIIIDSTSGQDGELEAIVTSVGSIDTVNIINSGSGYTSNPRVILSHPQIFKKADYYLSFINNNNYVKVNDTFVNDNKEVFICGKTKDASGNVVAFVSKLSATGVKEWSKTLELGSGLNYAEFNSLYVDGNDVWVVGINKPNSSILNAYNPDVILCKYTQAANGLSATLAFQKAYAGISGGTRADHITIIKKYSDTRYIIGGYTNTNSANPDDAFIASIDTSGNFAIKRKFASANKSERITDIICNYNSATGGQDVYFCMETASTVNALDVDVAVGKCQIGVNAITVDWINTYANSLHSMIDTSIAIDEFNEIYINATCRQKANDTDRDSIWVGKIDSTGALIWNYRYLTPGRDVTSCGKSAIDLFGDLNIAYTRDNNTNEYKTVDVLKIGYNGTIKNHTTTEFTADNIEGLQIHGLDVDTSGDVHTFGQTYWNRNEFVIPFTSSALTDTTTHYTAALTSTSDSFSYDTSGGWGKILGATTAAPSVWTNTNIKFAGTDLGQKLAGDWTLEFFIFKDATNSNVFSQPKETLFAIGDATVSTGGLHLYYDQSSAGPSGPLTLTITNSTTSINSAGSSLTSSQTNLYADNTWQAIAVTKSGDTFKAYVNGIEVLTGTISGTSLGAKDLYFGNIPGANGTLGQFRSNEQGQYHIDHLRLRNRAITPTVPSDILALPTAGAYGLTFNWVDDAWFADHMSRYDYIEYAGFGLKSDKNADAARLGNQGKKANTGITFTRTAVTPVIGSPLTINVNGYALGEAGYQSLDFDDSTTTMTEDTETLSHVQDIWSSRTATVPSPGSQKLKVTAVVKDRYYFKVTPTVKIDNVQALTINQAFNFSVGSKLVLKNDSGQFVNSGYIIRKDDTNNIVYLAVNNNAWSNDLNTGQLSTEQFNEQSNYGITGAIPNDINEISNYTFAEINNQTPGTFIINLDGFDLDGTVADVPATIALTAAGTGYPNTGDSVATTTTNGEASGLLVDYTASGGVIQSISIDSGGAAGSGYKVGDEVVVSGGNGDAKFTINSTTGNLDSFATFKPYSDADYSVRIDQVSGSSAYIVGSVVTIGSGAITWNSDYSQATISGLTGVLKITLVANLTKILQATAVANSDEVYVITNTSHYLSKGDMVYVDGNPTQTIGATSYDEYDGAFAVERVVSPLEFTYKLDQAALTAPATSASAVSIFVKSPTLKMYYGHQYLFDLSHSSMAGGNLSFAKDNLYKLEYSFNSIERVGTPGVTGGGQPTPTVKLKVDRNIVTNISYYFDPSRTGDDSPVVPGSYLDVVNSPYDGTFEISSIAGATITKGADILKFPLANEPEAAATISQASYTTSSTKAVGSIGDIRIVNPGGFYTKLPIVSGITSSRQIERVQINAPGTEYAVGTYNGVPITGDGEGGFVSITVADGTDAEGSTIPGQINNVVVTSPGKNYTTASIDINAIPGILGTGLTGSGAELVVVIPSAGTGASVFTKGANVGKIKKLKNNNFGYDYPHDYTLRPEISFPINAQLTSTSILDSITITDPGTGYSQAPAVIVTGGGGSGAIAEATIKNGRLDVIIVKDPGAGYSSTPTVSLRSSFNYVINLDLGLLQFAFPHGIANGAAVTLNVVDTGDGADFPLSAGAVGRLNGSTTYYAISGTANSLEDDQLKLAITAANAELGDALSFSNAGTGRQQVLTESFGGSAEANVITSTFLEGELVYQGDSLATATAQGFVSTNSGWQVGPRILKIVDYTGDFAENQRITGVISKSSGIITDLKIARGVLEIGSITRTTGQFIDDVGKPSEIIQKIQDSYYYQDFSYAVKSSTSISEWKEILIKNVHPASFKVFGELNLNEYGFIPNKETFFSLTKSVELAQEAIVPNIQNFALVEPVYTAFNNTEVLFRQKRLTSSENILTSVVQRIDDISNLFDGERTSFPLQVNQTNIVANANQLMIVLNGVVQTPGTAFSIQQDSIVFVEPPQPPASVKYVNVTINLIQTVDLTFTNISGIFPNIGNTVVGTSSNARLTVTKVTGNTITGFITQGTFILPTAGGGGELCTVSATGFSANIATRTADININNVTTGNFPAAADVTAGTVFTGATSGAQLTITQVVGTTISGTVTLGNFQTNEIITATLSGGAAFSGTTYTVTGGVASGGLFIFGEQVTNFDGDTAKVEQVNLQTGQEIPLAQLRYTVGLSTTSIEVVAYRTDNTAADAAVPAGTFTAGKNYQFGSEIVLVSAVTQGSESTTLTVTRAQNGTTAVSHQEDVPVYGTDISVTDQLTLSKTAGTYQSTPGLFDIQLNDYIIAAQSGVVAQVTASSVYQDPTTNEFIGQVNISPGSSFFGLLFNRITSQTYPNVVLDNIANSSVNIVDFTDNNTPFNENFPATEQINNYVITYDNASGALSEGEDIRNYKIEYGNSNGDFDSAEDAKIRKLTFTNQKGTGFFVAGQTIRIGSLAEGEGTKAEVVGYSQARKTVYLGKIGRCQYNGQDIHAITFAGNAQISTGSFKFGGSSLLLDGTGDYVNIAASSEFAWGTGAFTLEFWVNPDSSAISGTATLLDQRENATEVAVRVYLQAAQIRYNVNGSDLVTSGATTLNNATWYHVAIVRSGSTTKIWLNGVEVGTGTDSSNFATKPIRVGMDYNGANGFTGYIDELRVSNSNRYSSAFTSQTGIHQGDTNTKLLVHFDGSNGQTYTEDWSGFVSPAIGDEFNNDSILATSRTTGAPAGFVGRTHRYLNAADHILTNKELIKAEALYIMKQVFPAHTVKGGDSAQLARLEVLIQALVDDLRNGSNSHIWTTSASYINRTTNPISIATGTIEGDVPQEVYATEIVEKISKFVINNVPWDIQDTSHSFTQVYDGTLKDSDYPSAVNFTPTGATYNPATGDMVLTSNSHGLLSPREITASNATYTATTGVLGITSNGHNLQTGDRIKLKPNSITMTCTSDGNTVSQSYPRPDDPAGQGWMEVTRIDANNFSINVGKSPTVNYTVLDATYNGQTGFMTMDIGDNDLRTAWKYTPEGAAYNPSTGVMTITIANHGFYVGDRVMFDVYSLVFTCAQDSNATDHPYPRLTDPYYNKWLAISNVTTNTFDVNVGTSSNTTTHTFQYALPNSMVRSGETLRLSKDAVSFKCSQDNFKTIHSYPRTDDPGYNTSLPIWTNGTPLTATNASYNAQTGDMVITIPSHGLTTDNEIRIELNSLTFACTKDGNKTTHSYPRATDPAAQRWLRIEEKTDDTVKVNVGIGAVADQYVHTFVSALEHS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- Physico‐chemical
properties -
protein length: 7312 AA molecular weight: 780644,84080 Da isoelectric point: 4,67105 aromaticity: 0,09163 hydropathy: -0,15336
Domains
Domains [InterPro]
DC_0042
ATT
1–438
ATT
1–438
DC_0042
ATT
429–516
ATT
429–516
DC_1338
ATT
1404–2817
ATT
1404–2817
PF13385
LEC
2283–2440
LEC
2283–2440
IPR001791
LEC
2306–2437
LEC
2306–2437
IPR001791
LEC
4278–4401
LEC
4278–4401
1
7312
Architecture
ATT 1-3773 | STR 3835-4411 | STR 4640-5675 | RBD 5676-6154 | RBD 6514-7310 |
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Prochlorococcus phage P-SSM4 [NCBI] |
268747 | Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Ronodorvirus > Ronodorvirus ssm4 |
| Host |
Prochlorococcus [NCBI] |
1218 | Bacteria > Cyanobacteria > Prochlorales > Prochlorococcaceae > |
| Host |
Prochlorococcus marinus str. NATL2A [NCBI] |
59920 | Bacteria > Cyanobacteria > Prochlorales > Prochlorococcaceae > Prochlorococcus > |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AAX46881.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
AY940168
[NCBI]
CDS location
range 57144 -> 79082
strand +
strand +
CDS
ATGACAAATATCAACAAAGTCTCATCGGCAATTGTTGCCCAGACTCCCGAATTTATAGAGTCTGACTATCCTCTGTTTAACAGATTTCTTGAGTATTACTATCAGTCTCAAGAGAAGACTGGTCTTGGGCAGAATATCTTAAACAATTTCCTTGGATATCTTGATATTGACAGGTTAGACGTTGGTATATTAGATGGTAAGACAAAATTAGTAGAAGCAATAGATGCAACTAGCGATACAATCGTTGTAGAATCGATTGACCAGTTTATAGAAAAGTCTGGATCTATTCTCATAGGTAGTGAAGTTATCTACTATGAGAGTACAACCAGTTCTCCAAACATTGCTCTTTCACCAGGTATTTCATATGATCAGGTAAAATTAAAGTGGGTAAATCTTTTTAGTCCTATCAATCTCTTTGATGGTACTACTACTCAGTTTAATCTAGTATCTCAAGACAATCCTATTGCACCTCCATCTGCACAACATTTGATTGTCTCTGTATATGGTGAGGTATTGACACCTGGTACGGACTATACGGTCAATGGAACCACTATTACCTATGCAAGTGCTCCTAGAACAAAGATTCCTTCTGATGATGCTATAAACACCTTTATTACATACCTAGATGGTTTTGTAGAGAATCAGATTGTTCCACTCGATAATATTTCTAACTCATTTGGTGAAGGTAAGACACAATTTAGAATAACACGTAGTGGTATAGCATATGAACCAATTGTAGATGAGTATGTAGTTGCAATATACGACAAAAGATTATTAATACCTAAAGTAGATTACTTTATTGATGGTGCAGACTTTATATTTGCTACCGCACCTACAAACGGTAGATTTTTATCATTACACTCTATAGAAGCACCTGTACCTTCTTTTGGTAGTGGTGCGGAAGGTTTTGCACGAGTAAATGATTTAGGTCAACTTACTAGCATTTCAACTAACGTAAATGGTAGCAACTATAGATTTGAATATCCTCCAAAAGTTTCTATTAGTACAACTGTAGGATCAGGTGGTGCTGCACAAGCATTAGTAAACGGTATTAAGACCGTGACTCTACTTAATGGTGGTAAAGGATATAGCGATACAAACCCTCCTGTTGTTCAAATTGAATCTCCTACAAAAACAGGTTCTATACAAGCAACATTAAAAGCAACAGTTGAAAATGGTTCTGTCACTGCTGTAGAATTACTGGGATCAGGTTCTGGATATACATTTACACCTAGAATCACTTTCCGACAGCCTGGCGGTGCTACAGTCGCCACTCCTACGATATCTAATGGATCTATTAGTGGTGGTTTAACAATAACAAATGCAGGATTTGGATATACAACCCCTCCTGTAGTGTATGTTGATGAACCAACTGGTAATAATCCAATCAGAGCATCTTTTCAAACAGTCCTAGCATCTGACGGAACTATTGCATCTATTACTACAATTAACGCAGGGCAAGGTTATACATCCGTTCCAAGAGTAGCAATAGTAGATCCTGTTGGTGCACAAGTATTACAAACTGTAGTTGATGGAGACGGAAGAGTTATCCGTATTGATATACTTGACGGAGGAAGCGGATATGATGAAGTTCCTTCCGTTTATATCGTTGATAATAGAGTAGATGGTACAGGAGCATACGCAGGTGGTACAGGTGCTACCGCAACTGCTGCAATATTCAACGGTGCGATTACAGATATTAACGTAAGTGCGTTTGGTAGTGGATATTCTGCTTCAAATCCTCCTTCTGTTGTAATTCAAGCACCTACAAGTGCTGAAGCATCTGCGGAAATAGGTTTAAATGAGGTCACAGGGTTTAAGGTTAATCAATCAGGTAAAGGATATAATAAAGCACAGTTTACAGGATGTGCACGTGCTGCATCTGGTATCGTAGAATACACGGAAGATGGTAATGCAGTATTTTCTAATGATACTACTGCTGCATCTGCCACTGTTGATACTGAGGTAAAATGTCTTGATGCTTTATTTGTAAAACGTTTACTAGACAAGTATACACAGCAGTTCTTACCTGATGTACCAGAACTAGACTATAAGAAGATTGATGTACGTACAGCAATCAAAACTATTAAAGATTTCTACTCCGCAAAGGGTACATCATTCAGTATTGCGTATCTATTCAAGTTATTATATGGTGAGACAGTAAGTATATCATATCCAAAAGATCAGATTATCAAACCATCTGCTGCAACATGGTCTATTGATACTATTTTAAGAGCAACTAAGGTTTCTGGACTTGCTACAGACATTCAAGATGGTCTTCTACAACAAGACGCAGATATTGCGGATCCTAATGTAAAAGGAGCATCTGCACTTGTTGAAAACTACATTTCAATCAAAACATCTACAGTAGAAATATTTGAACTTGTTCTGTCTGAAGAAACTATTACAGGAACGTTTACCGTACCTTATAAGACAAAACTTGCTGAACCATTAAATCAAACCGACTCAATCATTACGGTTGACTCTACTATTGGATGGCCAGAAAGAAACGGAGAGTTTGTAATTGGTACAGGTTCTGGTGCAGAATTAGTACAATATAAGGAAAAATCACTTAACCAGTTTATTGAGTGTACTCGTTCCGTTAACGGAATTGTAGAGGACTGGGATTCTGCTACTGAAGTCTCATCAAACTTCCAAGTAAAAATTAATAAGGATACACCACAAGAAGTTGTGATGAATGTTGTTGGTATTGTTGATGCACAACAAACAACATTAACTGATACAGGTTCTTACTACTTACAAGGTGATAAACTAACAGTTTCTAAGTTAGGTGGTACTGGAACATCTCCTTTACTTACAACTTGGTTATATAACGTCAAGAAACTGATTACCGTTAGTGGTATCACATTTGGTGGTGTAAATAATCAATCTGCAACAGTCACATGTTCTAATAATCATGGTTTGTTGGTTGGTGATCAGGTCACAGTTTATGGTGCAAACCCAATCATCTATAATGGTACATTTACTGTCACATCAAGAGATAGTGAGACAGTATTCCAGTATGCACTACCACAACCTGCAGCAATCGTACCACAAGGTAATATTCTAGTATCAGTTGACTTGAACAAAGGTAAGTCTGATACTACTACGATTCTAAATGCAATTGGACCTTACACTACTAATATACAGAACTCTTTTTTCAATGACAACTATACTTACGTTGCATCAACTGGTATACCAAACTATTCTATAGGTCCTTTTCCTGGTTCTGCTCTTTTACCTGGCAACCAACGTAAATTAAATAGATTCCCTACACTCCCTACTACAATATCAACTAAGTCTGAAATTTCTTCAGGTCCTATTGGTACATGGGTAAATGGTGTTTCTGTATGGTCATATAAGTCAACACAAAGTAAAACTTTCGGTGCAATCACTAATATTGCTATTACTAATGCGGGACAAGGTTATGATGCTGCATCTCCTCCTGTTATCACTATTTCTGGTGGTGGAGGTACAGGTGCTACTGCTAATGTTGTAGTTAATGGTTCTATCTCTGAAATTACAGTCACAGCAGGTGGTTCTGGTTATACATCTTCTCCTCTAGTATCAATCGTTGGTGGAGGCGGTTCAGGAGCAGCAGCGACCGCTATTATTACTAAAGGTGCTGTAAGCCGTATTTTGATTAACTCTGGTGGTACAGGTTATACTTCTCAACCTTCAATTACTATTGTTGGTGGAGGCGGAACGGGTGCTGCGGGTACTGCCAGTGTTAGAGGTCCTATTAATACTGTTAATATTACTAATGGTGGTAGTTCTTATACCAGTGCTCCTACTGTAAGTCTATCTTCTGGTTCAGGAGCAGTGGCACAGCCGATTGTACAAAATGGTAGAATCATTTCTATTGCTATCATCTCTGCAGGTTCAGGATATACTACAGCACCTGAAGTTAGTATTCAGGGTGTTGGATTTGGTGCTGTTGCTCGTGCTACCATAGACACTGATGGTGAAAATGCAGGAAGAGTGACAAGTATCACCATTATTAACCGTGGTATTGGATACGTTCAAGGAACTACTCTTATTAATATGACATCTGTTGGTCAGGATGCAGTCTTTACACCTTCAGTATTCAAGTGGACATATAACTTACAAGCAACATCTGTATTAGACGCTGCTAAAGGTGGAGTGTTTGAAGGATATAATAATCAGTATGGTGGAGAATATGCTCACTTATCAAATCCACAAAAACTACGTTTCATTCTAGGTGATAACTTACAAGAGGCAGTTGTAGGAACTATTACTGAACAAGAAACACAACTACAACACTCTCCTATCATTGGTTGGGCATTTGATGGAAACCCAATTTACGGTCCTTATGGATATACTGATCCTACTGACCAGTCATCTGAAATTACAAGATTAAGAACTTCATATAGAGTTAAACCTGCTCTTGTACAAACTTCAAATAATCCATCTCCTGTAAGAACTGCAGGTCCTCTACTATCTGTTGAGGCAGCAGGTAATTTTGTTGAAGATTATGAGTATGTTTTCAACCTTGGTGATCTAGATCAGTACAATGGTAGATTTTGTAAGACACCTGACTACCCTACAGGTAGATACTGCTACTTTGTCACTATAGATGCTACAGAAGCAGGTAATCCAGAATTCCCTTATGTCTTAGGTCCTAGTTTCAACTCTGTTGTTGATACATGGAACTTAAGCACAAGTGCAGTGCAGCAAAATATTCCAACTGGTGTTGTAAGATATCGTGATCCATATGAGAATGTTGATATTGATGTTGAAAGAGCACCTAATGCTTCTACAAATGCTCTAACAACTGAAGATGGTGCAATATTACTCTTTGATCCAGAAGATACTAATAGAGATGGACAGATAGATGCTGAAGAATCAGCAGAAGTAAATCTAGGTCAATTATTTGAAGAATCACCTCTACAACTCTTTGACTACTTCCCTAAAGTTAGATTTGACTCGAAAGTTGATATTGAAGTAGAAACAACTAATAAATTTGAAGATGCTAACGT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