Protein

View in Explore
Genbank accession
WEW54170.1 [GenBank]
Protein name
putative long tail fiber proximal subunit
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,56
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MADIKRKFRAEDGLDAGGDKIVNVALADRTVGTDGVNVDFLVQENTVQVYDSTRGYNKGFVVLYDNRLYQAINDIVSPSGAFNLLQWRAVRTDAQWITVASGTCQLSSGESISVNTGAGNDMVFTLPNTPVDGDTVVLADIGGRTGTVKVQINASVQSILNFRGEQVRTVLMTRPRSQLLFVFSNRLWQMYITDYGKESITVTPATPYQAQANDFIVRRFTSAAPINITLPRNANNGDIISLVDLDRLNPLYHTIVKTFDDTTSIGEVGTHIAEGRNDSDAFFVFDAANSLWRIWEGDQKSRLRIIRADSNIRPNEEVLIFGTNNATTGTINLTLPTGILSGDTVKISMNYMRKGQTVKIKAAEGDTIASTVALLQFPKRSEYPPDAQWVSVTELEFNGTTSYVPVLELAYIEDTVAGTRYWVVQQNVPTVERVDAGTDATRARLGVIALATQAQANVDLENTPAKEVAITPETLANRTATEARRGIAKIATTAQVNQNSTATFVDDTIVTPKKLNERTATETRRGLAEIATQVETDAGLDDTTIITPKKLQARQGSETLSGIVKYVSTTSATPAATRGAAGTNVYNKDTTTLTISPKALDQYKATYAQQGAVILAVDSEVIAGQSQAGYSHAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQAETNAGTDYTRAVTPKTLNDRKATEGLSGIAELATQVEFDTGTDDTRISTPLKIKTHFDSSDRTSVNSDSGLIEEGTLWNHYTLDISKANETQRGTLRVATQAESNAGTLDDVLITPKKLLGTKSTETSEGVIKVATRAETVTGTSANTAVSPKNLKWIVQSEPTWAATTAIRGFVKTSSGSITFVGNDTVGSTQPLESYEKNSYAISPYELNRVLANYLPLKAKAVDSNLLDGLDSSQFIRRDIAQTVNGSLTLTQQTNLSAPLVSSSTATFGGSVSANSTLTISNTGTATRLIFEKGPQTGTNPAQTMTIRVWGNEFGGGSDTTRSTVFEVGDETSNHFYSQRNKAGNITFSINGTVMPINVNASGTLNANGVATFGRSVTANGEFISKSANAFRVISGDYGFFIRNDGGSTYFMLTASGDQTGGFNGLRPLSINNKSGQITIGEGLIIANGATINSGGLTVNSRIRSQGTKTSDLYTRAPTSDNVGFWSIDINDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVTGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTLDSLYQDWITYPTTPEARTTRWTRTWQKTKNSWSSFVQVFDGGNPPQPSDIGALPSDNATIGNLTIRDFLRIGNVRIIPDPVNKSVKFEWIE
Physico‐chemical
properties
protein length:1291 AA
molecular weight: 139369,52830 Da
isoelectric point:5,43491
aromaticity:0,07281
hydropathy:-0,30496

Domains

Domains [InterPro]
DC_1986
ATT
15–140
DC_1986 DC_1209 IPR048391
IPR048390
ATT
981–1094
IPR048390
DC_1209
STR
1001–1274
DC_1209
WEW54170.1
1 1291
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT 15-140 | STR 343-980 | ATT 981-1094 | STR 1095-1140 | ATT 1141-1239 | STR 1240-1274 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage 55
[NCBI] 		3018029 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli BW25113
[NCBI] 		679895 Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales > Enterobacteriaceae > Escherichia > Escherichia coli

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WEW54170.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OQ599310 [NCBI]
CDS location
range 76816 -> 80691
strand -
CDS
ATGGCCGACATCAAACGTAAGTTCAGAGCCGAAGACGGTCTGGACGCCGGTGGCGACAAGATTGTTAACGTAGCATTAGCCGACCGTACAGTAGGTACTGATGGCGTAAACGTTGACTTCCTGGTACAAGAAAACACCGTTCAAGTATATGATTCTACGCGTGGATATAACAAAGGATTTGTTGTTCTTTATGACAACCGTTTATATCAAGCAATAAATGATATCGTGTCTCCTTCCGGGGCATTTAACCTTTTACAATGGCGTGCAGTTCGTACTGATGCACAATGGATAACTGTCGCTTCTGGGACTTGTCAACTTTCTTCAGGTGAATCGATTTCGGTTAACACTGGTGCCGGCAATGATATGGTTTTTACATTGCCAAATACTCCAGTTGATGGTGATACTGTTGTTTTGGCTGATATTGGTGGACGAACCGGGACAGTTAAAGTACAGATTAACGCGTCTGTACAGAGTATTTTAAACTTTAGAGGTGAACAAGTTCGTACGGTTTTAATGACGCGCCCACGTTCACAACTATTGTTTGTGTTTAGTAATCGTTTGTGGCAGATGTATATTACCGATTATGGTAAAGAATCAATCACTGTTACACCTGCGACACCATATCAAGCACAAGCAAATGATTTTATCGTTCGTCGTTTTACTAGTGCAGCACCAATCAACATTACACTTCCACGTAATGCTAACAATGGTGATATAATCAGCCTAGTCGATTTAGATAGATTAAACCCACTGTATCATACAATTGTTAAAACATTTGATGATACAACGTCTATTGGTGAAGTCGGGACTCATATTGCCGAAGGCAGAAATGACTCTGACGCGTTTTTTGTTTTTGATGCTGCAAATAGTTTATGGCGTATATGGGAAGGCGACCAGAAATCGCGTCTTCGTATTATCCGTGCGGATTCAAATATTCGTCCAAATGAAGAAGTTCTTATCTTTGGCACAAATAACGCTACAACCGGAACTATTAATCTTACGCTGCCTACCGGAATTTTGAGTGGTGACACTGTTAAAATTTCAATGAACTACATGCGTAAAGGCCAAACAGTAAAAATTAAAGCTGCCGAAGGTGATACAATTGCTTCCACTGTTGCATTGCTTCAGTTCCCTAAACGTTCTGAATATCCACCTGATGCTCAATGGGTCTCTGTTACTGAACTAGAATTCAATGGCACTACTTCATATGTTCCTGTATTAGAATTAGCGTATATCGAAGACACCGTTGCTGGTACACGTTATTGGGTTGTGCAACAGAATGTCCCTACGGTAGAACGTGTTGATGCTGGAACTGATGCTACACGAGCTCGTTTAGGTGTTATTGCTCTTGCTACTCAAGCGCAAGCAAATGTTGATTTAGAGAATACTCCAGCTAAAGAAGTGGCTATTACTCCTGAAACATTGGCAAATCGTACAGCAACTGAAGCTCGACGTGGTATCGCTAAAATTGCTACAACAGCACAAGTTAACCAGAATTCCACAGCAACATTTGTAGATGATACTATTGTTACGCCTAAAAAACTAAATGAGCGTACAGCAACTGAAACTCGTCGCGGTCTTGCTGAAATTGCTACTCAGGTTGAAACAGATGCTGGTCTTGATGACACAACGATTATTACACCTAAGAAATTACAGGCACGTCAGGGTTCTGAAACACTATCTGGTATAGTTAAATATGTATCAACTACTTCTGCTACACCTGCCGCGACTCGTGGAGCTGCAGGCACTAATGTTTATAATAAAGACACAACCACGTTAACTATTTCTCCTAAAGCCCTTGACCAATATAAAGCAACTTATGCTCAACAAGGTGCAGTAATTTTAGCTGTTGATAGTGAAGTAATTGCTGGTCAATCACAAGCAGGTTATTCTCACGCTGTAGTAACTCCTGAAACACTACATAAGAAAACTTCTACTGATGGACGTATTGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAGCAGAAACTAATGCTGGGACTGATTATACACGTGCAGTAACGCCTAAGACATTAAATGATAGGAAAGCTACGGAAGGATTATCCGGCATAGCCGAACTTGCTACGCAAGTTGAATTTGATACTGGAACTGACGATACTCGTATCTCAACTCCACTGAAAATTAAAACTCATTTTGATTCTTCTGACCGTACCAGTGTTAATTCTGATTCCGGACTTATTGAAGAAGGAACCTTGTGGAACCATTATACTCTTGATATTTCTAAAGCAAATGAAACACAACGTGGTACGCTTCGCGTAGCGACCCAGGCAGAATCTAATGCAGGAACTTTAGATGATGTTCTTATTACTCCTAAAAAGCTTTTAGGGACTAAGTCCACTGAAACGTCTGAAGGCGTAATTAAGGTTGCTACTCGGGCTGAAACTGTAACAGGAACTTCTGCTAATACTGCTGTATCTCCTAAGAATTTAAAATGGATTGTCCAGTCTGAACCAACATGGGCTGCTACTACGGCGATTCGTGGATTCGTTAAAACTTCATCTGGTTCTATTACATTCGTTGGTAATGATACAGTTGGTTCAACACAACCTTTAGAATCATATGAAAAAAATAGCTATGCTATATCTCCATATGAATTAAACCGTGTACTTGCTAACTATTTGCCATTGAAAGCTAAAGCCGTAGATAGTAATTTATTAGATGGTCTAGATTCATCTCAGTTCATTCGTAGGGACATTGCACAGACGGTTAATGGTTCACTAACCTTAACCCAACAAACGAATCTGAGTGCCCCTCTTGTATCATCTAGTACTGCTACGTTTGGTGGTTCAGTTTCGGCAAATAGTACATTAACTATTTCTAATACTGGAACGGCAACTCGTCTGATTTTTGAGAAAGGACCTCAAACTGGAACAAATCCTGCTCAAACGATGACTATCAGAGTTTGGGGAAATGAATTTGGTGGTGGTTCAGATACAACGCGTTCTACTGTATTTGAAGTCGGCGATGAAACATCTAATCACTTTTATTCTCAACGTAATAAAGCTGGGAATATAACGTTTAGTATCAATGGTACTGTGATGCCAATAAATGTTAACGCTTCAGGCACGTTAAATGCGAATGGCGTTGCAACATTTGGTCGTTCAGTTACAGCCAATGGTGAATTCATTAGCAAGTCTGCAAATGCTTTCAGAGTAATTAGTGGTGATTACGGATTCTTTATTCGCAATGATGGCGGCAGCACATATTTTATGCTTACTGCATCTGGTGATCAGACTGGTGGATTTAATGGATTACGTCCATTATCAATTAATAACAAATCCGGTCAGATTACAATTGGTGAAGGCTTAATCATTGCCAATGGTGCTACTATAAATTCTGGCGGTTTGACTGTTAACTCGAGAATTCGTTCTCAGGGTACTAAAACATCCGATTTATATACCCGTGCGCCAACATCTGATAATGTAGGATTCTGGTCAATCGATATTAACGATTCAGCCACTTATAACCAGTTCCCGGGTTATTTTAAAATGGTTGAAAAAACTAATGAAGTGACTGGGCTTCCATATTTAGAACGTGGTGAAGAAGTTAAATCTCCTGGTACTTTGACTCAATTTGGTAATACGCTTGATTCTCTTTACCAAGATTGGATTACTTATCCAACGACACCGGAAGCACGTACAACCCGTTGGACTCGTACATGGCAGAAAACTAAAAATTCTTGGTCAAGTTTTGTTCAGGTATTTGATGGTGGAAACCCTCCTCAACCTTCTGATATTGGTGCTTTACCTTCTGATAATGCAACAATCGGAAACTTGACAATAAGGGATTTCTTAAGGATTGGTAATGTCCGCATTATTCCAGACCCTGTGAATAAATCTGTTAAATTTGAGTGGATTGAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
6760d1081c6de9cc81e4bda82a6eafc3128e3df3d2f39fbb2fcb094a4f7db7df
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5572
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete Genome Assembly and Annotation of Escherichia coli Bacteriophage 55 Burmeister,A.R. — — GenBank