Protein

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Genbank accession
URY13904.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,58
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,87
Protein sequence
MVDIKRKFRAEDGLDAGGDKIVNVALADRTVGTDGVNVDFLVQENTVQNYDETRAYTKDFIVLYDNRFYQALNDIPAPAGPFSLAKWKATRTDAEWITVQGGDFQLSVGNSIAVDTSAGTDINFTLPQNPLDGDTVILSDIGGRVGYVKVQITAEAQSIVNFRGQQVRSVLMTHPKSKMVFIFSNRLWQMYVSDYERNAVTVTPAKPYQAQPNDFIIRRFTSAAPINITLPRNANNGDIINLVDLDKLNPLYHTIVKTYDDTTSIREAGVHVAEGRNTAEAFFVYDSANSLWRVWEGDQKSRLRIVRNDTDLHPNEEVLVFGTNNDTISTVNLTLPTDILSGDTVKISLNYMRKGQTVKIKAAEGDTIASSISLLQFPKRSEYPPDAQWVSVSELEFNGDTSYVPVLELAYIEDYSSETKYWVVQQNTVTVERVDASSNTTRARLGVIALASQAQANVDLENAPGKELAITPETLANRTATETRRGIARIATTAQVNQNTDFAFQDDLIISPKKLNERTATETRRGVAEVATQAETNAGTDDTTIITPKKLDARQGSEVLSGIVKYTSTSGTTAATIRGNAGTNVYNKAVDNLTISPKALDQYKATPTQQGAVILAIESEVIAGESQAGWANAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQAETNTGTDYTRAVTPKTLNDRKATEGLSGIAEIATQVEFDTGTDDTRISSPLKIKTHFDSSDRTSVNSDSGLIEEGTLWNHYTLDISKANETQRGTLRVATQAESNAGTLDDVLITPKKLLGTKSTETSEGVIKVATQAETVTGTSANTAVSPKNLKWIVQNEPTWAATTAIRGFVKTSSGSITFVGNDTVGSTQPLESYEKNSYAISPYELNRVLANYLPLKAKAVDSNLLDGLDSLQFIRRDIDQTVNGSLSLTKQTNLSAPLVSTSTASFGSEASVTRRLTLNDSSGSEIVFTKGTQSLSNKENFVVRAWGNSATDGARDTIFEAGDETGYHFYSQRASDNKVSFNINGTLYSTGIVSTNGLNVTGVSTFTGPISATGEIVSSSPIAFRAINGNYGVMLYNAGNSSYIALTNSGDQTGTFNNLRPITINNATGLVRLDNGVQITSGATITTGGLTVNNRIISNGVKTATVYTDKPTASTVGFWSIDINDSAVYSQFPGYWTRDNKGNRDQEIKYPGTLTQFGNSLDSLYQDWICYPTGANGGSIRYTRTWQKNKDAWTSFAMVFDSGNPPSPSDVGAIPSDNAVIGNLTVRDFLQLGNVRIVPDPVNKTVKFIWVE
Physico‐chemical
properties
protein length:1277 AA
molecular weight: 138519,16780 Da
isoelectric point:5,11837
aromaticity:0,07596
hydropathy:-0,33547

Domains

Domains [InterPro]
DC_1986
ATT
15–128
DC_1986 DC_1209
IPR048390
ATT
969–1089
IPR048390 IPR048391
URY13904.1
1 1277
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT 15-128 | STR 343-968 | ATT 969-1089 | STR 1090-1135 | ATT 1136-1225 | STR 1226-1258 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Shigella phage ESh27
[NCBI] 		2950773 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Shigella sp.
[NCBI] 		625 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
URY13904.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
ON528737.1 [NCBI]
CDS location
range 104654 -> 108487
strand -
CDS
ATGGTTGACATCAAACGTAAGTTCAGGGCCGAAGATGGTCTTGACGCAGGCGGTGATAAGATAGTTAACGTTGCGCTTGCTGACCGCACAGTTGGCACCGATGGCGTGAACGTTGACTTTTTGGTGCAAGAAAACACCGTACAGAATTATGACGAGACGCGCGCGTATACAAAAGATTTTATTGTTCTTTATGATAATCGTTTTTATCAAGCTTTAAACGATATTCCAGCTCCGGCGGGCCCTTTCTCTTTGGCTAAATGGAAGGCAACTCGTACAGATGCAGAATGGATTACAGTTCAAGGCGGAGATTTCCAATTATCAGTAGGTAACTCTATCGCGGTTGATACTTCAGCTGGCACTGATATTAATTTCACTTTGCCTCAAAATCCTTTAGATGGCGATACAGTTATTTTGTCTGATATTGGCGGTAGAGTAGGCTATGTAAAAGTTCAAATTACTGCAGAGGCTCAAAGTATTGTAAACTTTAGAGGACAACAGGTTCGTTCAGTTTTAATGACGCACCCAAAATCTAAAATGGTCTTCATTTTTAGCAACCGCCTATGGCAAATGTATGTTTCTGATTACGAACGTAATGCAGTCACAGTAACTCCTGCTAAGCCATATCAGGCGCAACCTAATGATTTTATCATTCGACGTTTTACATCAGCCGCTCCTATTAATATTACATTGCCTCGTAATGCTAATAATGGCGATATTATTAATTTAGTTGATTTAGACAAATTAAACCCATTATATCACACAATTGTCAAAACTTACGATGATACAACTTCTATACGAGAAGCTGGTGTTCATGTAGCAGAAGGACGTAATACTGCGGAAGCATTCTTTGTTTATGATTCTGCTAATAGCTTATGGCGTGTTTGGGAAGGTGACCAGAAATCTCGTTTACGTATAGTTCGTAATGATACTGATTTACACCCTAATGAAGAAGTTCTTGTTTTTGGAACTAATAATGATACAATCTCGACGGTAAATCTTACTTTGCCTACAGATATTTTGTCTGGCGATACTGTTAAAATATCGTTGAATTATATGCGTAAAGGGCAAACTGTAAAAATTAAAGCTGCTGAAGGCGATACAATTGCTAGCAGTATTTCTTTATTACAGTTCCCAAAACGTTCGGAGTATCCACCTGATGCACAATGGGTTTCTGTTAGTGAGTTGGAATTTAATGGTGATACTTCGTATGTACCTGTACTTGAGTTAGCTTATATAGAAGATTATTCATCTGAAACAAAATATTGGGTAGTTCAACAAAACACCGTAACCGTCGAACGAGTCGATGCATCGAGCAATACCACTCGAGCTCGTTTAGGTGTTATTGCTCTTGCTTCTCAAGCGCAAGCAAATGTTGATTTAGAAAATGCTCCTGGTAAAGAACTGGCTATTACTCCGGAAACATTAGCAAATCGTACAGCAACTGAAACTCGTCGTGGTATTGCTCGTATTGCAACAACTGCACAAGTTAACCAGAATACTGATTTTGCATTCCAAGACGACTTGATTATTTCTCCTAAGAAATTGAACGAACGTACAGCAACTGAAACCCGTAGAGGTGTTGCTGAAGTTGCAACTCAGGCTGAAACTAATGCTGGCACAGATGATACCACTATTATTACTCCTAAGAAATTGGATGCCCGTCAAGGTTCTGAAGTTTTATCTGGTATTGTAAAATACACATCTACGTCTGGTACTACAGCTGCTACTATTCGTGGTAATGCTGGGACTAACGTTTATAACAAAGCCGTAGATAATTTAACTATTTCTCCAAAGGCTCTTGACCAGTATAAAGCTACCCCTACTCAACAGGGCGCAGTAATTCTTGCTATTGAAAGTGAAGTTATCGCTGGCGAATCACAAGCCGGTTGGGCTAATGCTGTAGTGACTCCTGAAACTCTGCATAAGAAAACTTCTACTGATGGGCGTATTGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAGCAGAAACTAACACTGGAACTGATTATACTAGAGCAGTAACGCCTAAGACGTTAAATGATAGGAAAGCTACGGAAGGATTATCCGGCATAGCCGAAATTGCTACGCAAGTTGAATTTGATACTGGAACTGACGATACTCGTATCTCGTCTCCACTGAAAATTAAAACTCATTTTGATTCTTCTGACCGTACCAGTGTTAATTCTGATTCCGGACTTATTGAAGAAGGAACCTTGTGGAACCATTATACTCTTGATATTTCTAAAGCAAATGAAACACAACGTGGTACACTTCGTGTAGCGACCCAAGCTGAATCTAATGCAGGAACTTTAGATGATGTTCTTATTACTCCTAAAAAGCTTTTAGGGACTAAGTCCACTGAAACTTCTGAAGGCGTGATTAAGGTTGCTACTCAGGCTGAAACTGTAACAGGAACTTCTGCTAATACTGCTGTATCTCCTAAGAATTTAAAATGGATTGTCCAGAATGAACCAACATGGGCTGCTACTACTGCAATAAGAGGTTTTGTTAAAACTTCATCTGGTTCAATTACATTCGTTGGTAATGATACAGTTGGTTCAACACAACCTTTAGAATCATATGAAAAAAATAGCTATGCTATATCTCCATATGAATTAAACCGTGTACTTGCTAACTATTTGCCATTGAAAGCTAAAGCCGTAGATAGTAATCTGTTAGATGGTCTAGATTCTCTTCAGTTCATCCGTAGAGACATCGACCAGACGGTTAATGGTTCTTTAAGTCTTACTAAACAGACCAACCTGAGTGCTCCTTTAGTATCTACAAGCACTGCTTCTTTTGGGTCCGAAGCATCTGTTACTCGTAGATTAACTCTTAATGACTCTAGCGGTTCTGAAATAGTTTTCACTAAAGGAACCCAATCTCTTAGTAATAAAGAGAATTTCGTTGTTAGAGCATGGGGTAATAGCGCTACAGATGGTGCCCGTGATACAATATTTGAAGCTGGTGACGAAACAGGATACCATTTCTATTCTCAGCGCGCTTCTGATAATAAAGTATCGTTTAATATTAATGGAACACTTTATTCAACAGGCATTGTTTCTACAAATGGATTAAATGTTACAGGTGTTTCTACCTTTACCGGGCCTATTAGTGCTACAGGCGAAATTGTTTCTAGTTCTCCTATTGCATTCAGAGCTATTAACGGTAACTATGGTGTTATGCTTTATAATGCCGGTAACAGTTCTTATATTGCATTAACTAACTCAGGTGACCAGACCGGGACGTTTAATAACTTACGCCCGATCACGATTAACAATGCCACAGGATTAGTTCGTCTTGACAATGGTGTTCAAATCACAAGTGGTGCAACAATAACTACTGGTGGGTTAACTGTAAATAACAGGATTATTTCTAACGGCGTTAAAACTGCTACGGTTTATACCGATAAACCAACAGCTTCTACTGTAGGTTTTTGGTCTATTGACATTAACGATTCTGCCGTATATAGCCAATTCCCTGGATATTGGACGCGTGATAACAAAGGTAACCGTGACCAAGAAATTAAATATCCTGGTACTTTGACTCAATTTGGTAATAGCTTAGATTCGCTTTATCAGGATTGGATTTGTTATCCTACAGGTGCAAATGGTGGTAGTATTCGTTATACTCGTACCTGGCAGAAAAATAAAGATGCTTGGACTTCATTTGCAATGGTATTTGATAGTGGCAACCCGCCTTCACCTAGCGATGTCGGTGCTATCCCATCTGATAATGCTGTTATTGGAAACCTTACTGTTCGAGACTTCTTACAATTAGGAAATGTGAGAATTGTTCCAGACCCGGTTAACAAAACCGTTAAATTTATATGGGTTGAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
9cc110b4cfc788dee6e747a045c25afeb3fb1339db601e291b7b56f20166fb39
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5518
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Design of a bacteriophage cocktail active against Shigella species and testing of its therapeutic potential in Galleria mellonella Filippov,A.A., Su,W., Kevorkian,R.T., Sergueev,K.V., Srijan,A., He,Y., Lurchachaiwong,W., McGann,P.T., Ellison,D.W., Swierczewski,B.E. and Nikolich,M.P. — — GenBank