Protein

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Genbank accession
YP_010110964.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
Protein sequence
MQLSQILNFDTPYEHLKDGDLVHAGNVMIDKDTQTIQNEPGLKDFYIHGVDANIVGHIECNQEFVLFFDNSQIYRVNVDGSNPKLVDIRWHWCGGQVFGTYTYNVNNELIVCISEQNPTEDCPLKSINLDKDKDLNPYITDGNDELYTELATAPISNFGDVSFINGSRIKKGTYIFFIRYWIDDYYKTIWFPIGYPVHVTDIAALQTPKTVFSYSGNSTVGSGSIQDYYNEDDDYTNTNPQIQVRIYTDTIKAYNKYQLGAIINGNASTEAVVWKAKSITALVTFDIDNNFETISLDELTNEPFNFYNVKALDNYRNRVYLGNYKIANKNSVFEKHKDYLNEQMAKVVISAVDRREGSYPTSAEAINFFKPKPGRRGIYTFFIHYVYPNGTYTDGYPINTINNGANDVGGINLKAERITLANGESLYRYSCPTNLLYLGGVVFEHLPMLEGFVGYFISYEQPKYADVGSGFITKDDKSLYDVKNEQVGGSNFRFNYPEFSIIGGSTNANKISDTCLFNLDTVNDNLNAILTYNSKADEKITGIEKTEVIPPNSYSNRGKEGALRISTANQASHTRQGLVLSDIYTDDITDFYVDVDKNLISLGYIEYIKDVVTDGSVNYTYGSLERRANNTTVYPVYAWNYYWNLSTIYTYHSRGVIFSDVNWNPYDATDNTEFFKEGNTVANKPLLYSFTFVHESHYFLMGKKMNISPRTLYYNISSGETNTQVANLIIDASRINDLYVLDANYYNYYRRIIVNYNKKNDLYKKEFYGKTVYRTDVIGDESIANSWKHISPEAYKIISENKGDITNIVGIDTYLLVHTEKSLFAFNVNNQLKTAEQDVQMLMPDVFEVEYKEMFSSKYGIAGFQDFVSYIVGDFGYIFYDRNSKKLYNFNGSNIEDIDGNISKFIHTFNADYIYMGYDTANARLMFNFIKENKSRIKQSCIFSYSLYNNNWISTHSYTSDYKFITLKDNFYIVDKIQGMYRIREFDNENYNEYNDDNLNPFMNNEVIDDKLCSYVDVYFNNNNSYNTIKILNFITYIINKEKNDNFDVLGCYIYTNCCYSDYCNLLEERKSVAEYKKPYLEYGRWNYNWFSNKLNSFEEQEVVNRITGIINDNLEYNQTAVDAKLIVGKYCVIRFVFRNTNKKVLIKDIQAYFNK
Physico‐chemical
properties
protein length:1156 AA
molecular weight: 133685,61580 Da
isoelectric point:5,06728
aromaticity:0,15138
hydropathy:-0,45138

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
YP_010110964.1
1 1156
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 203 203 0,6704
Central domain 204 402 200 0,6776
C-terminal 403 1156 753 0,2427
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-203
Central
204-402
C-terminal
403-1156

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage uncultured phage cr11_1
[NCBI] 		2772067 Uroviricota > Caudoviricetes > Crassvirales > Crudevirinae > Delmidovirus
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_010110964.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_055876 [NCBI]
CDS location
range 46795 -> 50265
strand +
CDS
ATGCAATTAAGTCAAATATTAAACTTTGATACTCCTTATGAACATCTTAAGGATGGTGACTTAGTTCATGCTGGAAATGTAATGATTGATAAAGATACTCAAACTATTCAGAATGAACCCGGTCTTAAAGATTTTTACATTCATGGTGTTGATGCAAATATAGTTGGACACATTGAATGTAATCAAGAATTTGTTTTATTCTTTGATAATAGTCAAATTTATCGTGTTAATGTTGATGGTAGTAATCCTAAACTTGTTGATATTCGTTGGCATTGGTGCGGCGGACAAGTGTTTGGAACTTATACTTATAATGTTAATAATGAACTTATAGTTTGTATTAGTGAACAAAATCCTACTGAAGATTGTCCTCTTAAAAGCATTAATCTTGATAAAGATAAAGATTTAAATCCTTATATAACTGATGGTAATGATGAACTTTATACAGAATTAGCTACTGCTCCGATTAGTAATTTCGGCGATGTTAGTTTTATTAATGGTTCTCGTATTAAGAAAGGAACTTATATCTTTTTTATTCGTTATTGGATTGATGATTATTATAAAACTATATGGTTTCCTATTGGCTATCCTGTACATGTTACTGATATAGCCGCTCTTCAAACTCCTAAAACTGTATTTAGCTATTCCGGAAATTCTACTGTTGGTAGTGGTAGTATTCAAGATTATTATAATGAAGATGATGATTATACTAATACTAATCCTCAAATTCAAGTTCGTATTTATACTGATACTATTAAAGCATATAATAAATATCAATTAGGTGCAATCATTAATGGTAATGCTTCTACCGAAGCTGTTGTATGGAAAGCAAAAAGTATTACCGCTCTTGTTACATTTGATATTGATAATAATTTTGAAACTATTTCTCTCGATGAACTTACTAATGAACCTTTTAATTTTTATAACGTAAAAGCTCTTGATAATTATCGAAACAGAGTTTATTTAGGTAATTATAAAATTGCTAATAAAAATTCTGTTTTTGAAAAACATAAAGATTATCTTAACGAGCAAATGGCGAAAGTTGTTATTAGTGCTGTTGATAGACGAGAGGGTAGTTATCCTACTTCTGCCGAAGCTATAAATTTCTTCAAGCCGAAACCTGGTCGTCGTGGTATTTATACTTTCTTTATTCATTATGTTTATCCGAACGGTACTTATACTGATGGTTATCCAATTAATACTATCAATAACGGCGCTAATGATGTCGGTGGAATTAATCTTAAAGCTGAAAGAATAACTCTTGCTAATGGAGAAAGTCTTTATCGTTATAGTTGTCCTACTAATTTATTATATCTTGGTGGAGTTGTTTTTGAACATCTTCCTATGCTTGAAGGGTTTGTCGGTTATTTCATTAGTTATGAACAACCAAAATATGCTGATGTTGGTAGTGGTTTTATAACTAAAGATGATAAATCTTTATATGATGTTAAAAACGAACAAGTTGGTGGTAGTAATTTTAGATTTAATTATCCAGAGTTTAGCATAATTGGCGGTTCTACTAATGCTAATAAAATATCTGATACTTGTTTGTTTAATTTAGATACAGTTAATGATAATCTAAATGCTATTCTTACATATAATAGTAAAGCTGATGAGAAAATAACTGGTATTGAAAAGACGGAAGTTATTCCTCCGAATAGTTATTCTAATCGTGGTAAAGAGGGTGCTCTTCGTATTAGTACAGCTAATCAAGCTTCTCATACTCGTCAAGGTTTAGTTCTTTCTGATATTTATACTGATGATATTACTGATTTTTATGTTGATGTTGACAAAAATCTTATATCGTTAGGATATATAGAATATATAAAAGATGTCGTTACTGATGGTAGTGTTAATTATACTTATGGTAGTCTTGAACGTAGAGCAAATAATACTACTGTTTATCCTGTATATGCTTGGAACTATTATTGGAATTTAAGTACAATATATACTTATCATAGTCGTGGTGTTATTTTTAGCGATGTTAATTGGAATCCGTATGATGCTACTGATAATACAGAATTTTTCAAAGAAGGAAATACTGTTGCTAATAAACCTTTATTATATAGTTTTACTTTTGTTCATGAAAGTCATTATTTCCTAATGGGAAAGAAAATGAATATTAGTCCTCGAACATTATATTATAATATTAGTAGTGGCGAAACTAATACACAAGTTGCTAATTTAATAATTGATGCTTCTCGTATAAATGATTTATATGTTCTTGATGCTAATTATTATAATTATTATCGTAGAATTATAGTTAATTATAATAAGAAGAATGATTTATATAAGAAAGAATTTTATGGTAAGACTGTTTATCGAACAGATGTTATTGGCGACGAAAGTATTGCTAATAGTTGGAAACATATTTCTCCTGAAGCTTATAAAATTATTTCTGAAAATAAAGGTGATATAACTAATATAGTTGGTATTGATACTTATCTTCTTGTACATACTGAAAAATCTTTGTTTGCTTTTAATGTTAATAATCAACTTAAAACTGCTGAACAAGATGTTCAGATGTTAATGCCAGATGTATTTGAAGTTGAATATAAAGAAATGTTCTCAAGTAAATATGGTATTGCTGGTTTTCAAGATTTTGTTTCTTATATAGTCGGTGATTTCGGTTATATATTCTATGATAGAAATTCAAAGAAACTATATAATTTTAATGGTAGTAATATCGAAGATATTGATGGAAATATAAGTAAATTTATTCATACTTTTAATGCTGATTATATTTATATGGGATATGATACTGCTAATGCTCGTTTGATGTTTAACTTTATAAAAGAAAATAAATCTCGTATTAAACAAAGTTGTATATTTAGTTATAGTCTTTATAATAATAATTGGATTAGTACTCATAGTTATACTTCTGATTATAAATTTATTACTCTAAAAGATAATTTTTATATTGTTGATAAGATTCAAGGAATGTATCGTATTCGTGAATTTGATAATGAAAATTATAATGAATATAATGATGATAATCTTAATCCGTTTATGAATAACGAAGTTATTGATGATAAACTTTGTTCGTATGTTGATGTTTATTTTAATAATAATAATAGTTATAATACTATTAAGATATTAAACTTTATTACTTATATTATTAATAAAGAAAAGAATGATAATTTTGATGTTCTTGGTTGTTATATTTATACTAATTGCTGTTATTCAGATTATTGTAATTTGCTTGAAGAAAGAAAAAGTGTTGCTGAATATAAGAAACCTTATTTAGAATATGGTCGTTGGAATTATAATTGGTTTAGTAATAAACTTAATAGTTTTGAAGAACAAGAAGTTGTTAATCGTATTACAGGAATTATAAACGATAATCTTGAATATAATCAAACTGCTGTTGATGCTAAATTAATAGTTGGTAAATATTGTGTTATTAGATTTGTATTTAGAAATACTAATAAGAAAGTTTTAATCAAAGATATACAAGCGTATTTTAATAAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
7b6fc6f40e508a6afccab836b817cdb488c2683206e614070cd080bd1f3c6e76
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2454
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Taxonomic proposal: Crassvirales, a new order of highly abundant and diverse bacterial viruses Shkoporov,A.N., Stockdale,S.R., Guerin,E., Ross,R.P. and Hill,C. 2023-03-24 — GenBank