Genbank accession
QOR58789.1 [GenBank]
Protein name
tail protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,87
Protein sequence
MEDLSKIVETLAANNQKLRVAVTKTSAQGEEAQKTTPNMMSFSNNENSIWFNGKLYGALFLHQVDGLTNESTNEEIIKVIGAATEERFKHIHSFILNGGLIIANDELDMCYCIANSDNTAKNIRIKWLSYKTSLLYRSIIFTLKNNSWSCNVIKRELTDGLTADIYKSALGTSIQMPNTVGGIAAGTTVATLNGKKQNEIIDMLLFPEQQPQVVAPSATILLSSDFINNEIMEVGMAAPVAGTNIKTAFNQGYGRVAGQPDKKRAGALNSEASFIYYGGQESNKTLPTKVVLGTMQYNYHAAYAQGEQLVTSWGNKASVQPNPLPAGTVNSGAVYIYGTYPYFANGADASTSNGDGSMPSAPVPNNKLKLYKWTDTLIGAKFASEASSGTRLEFKFPSTKNVTKVEFYNTVSGKWEVFASANYAISDAGNIQVQGVPVAYKKLTTQGAMSGALQLRFTVANVSRSENDEPDTYNGEPITDEVFRMLAANSTTLPFVEESIAMLAAAEPRTRPVGVAAFAVNFEPGGQAPLDARTVVGTKADLINAATYAAKNYYQGMLVIVKDTQEVYVLKDIAKITSADYSGWKRVDGGGVTQTVVENVLTSTSTTHALSAAQGKILNDSKLNKTDVVNNLTTVDTSKALSAAQGKALNDRIASIGNVYKYKGTKANISEVIAITNAFVGDVYNVEAEFSVGGKKYPAGTNVACIKNTSTTEHTEANWDPLGGTVDLSAYATKAEMNSGLNSKINTSAIKNDLTTGGATNVLSAEQGKILKQMIDQATADGGIVIE
Physico‐chemical
properties
protein length:787 AA
molecular weight: 84217,84170 Da
isoelectric point:5,91565
aromaticity:0,07751
hydropathy:-0,20229

Domains

Domains [InterPro]
IPR054500
STR
628–659
QOR58789.1
1 787
Architecture
ATT
STR
STR
ATT 510-595 | STR 621-718 | STR 724-785 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage uncultured phage cr11_1
[NCBI]
2772067 Uroviricota > Caudoviricetes > Crassvirales > Crudevirinae > Delmidovirus
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QOR58789.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MT774383 [NCBI]
CDS location
range 32494 -> 34857
strand +
CDS
ATGGAAGATTTATCTAAAATTGTTGAGACTTTGGCTGCTAATAATCAGAAACTTAGAGTAGCTGTTACTAAAACAAGTGCACAAGGCGAAGAAGCTCAGAAAACTACTCCTAATATGATGAGTTTTAGTAATAATGAAAATAGTATTTGGTTTAATGGTAAATTATATGGTGCTTTATTTTTACATCAAGTTGATGGTTTAACTAATGAAAGCACAAACGAAGAAATTATAAAAGTTATAGGTGCTGCTACTGAAGAACGTTTTAAGCACATTCATTCATTTATTCTAAATGGTGGATTGATTATTGCAAATGATGAATTGGATATGTGCTATTGTATTGCTAATTCTGATAATACCGCAAAAAATATTAGAATTAAATGGTTATCTTATAAAACCTCTTTATTATATAGAAGTATTATTTTTACATTAAAAAATAATAGTTGGAGTTGTAATGTTATTAAAAGAGAATTAACTGATGGCTTAACTGCTGATATATATAAGTCTGCTCTTGGAACTTCTATTCAGATGCCTAATACTGTTGGCGGTATTGCTGCCGGTACTACTGTTGCAACTCTAAACGGTAAGAAGCAAAACGAAATTATTGATATGCTTTTGTTTCCCGAACAGCAACCGCAAGTTGTTGCTCCGTCTGCAACTATTCTTCTTAGTAGCGATTTTATTAACAATGAAATAATGGAAGTAGGAATGGCTGCTCCTGTTGCCGGTACTAACATTAAAACAGCGTTCAATCAAGGTTATGGACGTGTTGCTGGTCAACCTGATAAAAAACGTGCTGGTGCTTTAAATAGCGAAGCAAGTTTTATTTATTACGGTGGACAAGAAAGCAATAAGACTTTACCTACTAAAGTTGTTTTAGGAACTATGCAGTATAATTATCATGCTGCGTATGCTCAAGGTGAACAACTTGTAACTTCATGGGGAAATAAAGCTTCTGTTCAACCTAACCCATTGCCTGCGGGTACTGTTAATTCTGGCGCTGTTTATATTTATGGTACTTATCCTTATTTTGCTAATGGTGCTGATGCTTCAACAAGTAATGGTGATGGAAGTATGCCATCTGCTCCTGTACCTAATAATAAACTTAAATTGTATAAGTGGACTGATACTCTAATTGGTGCTAAGTTTGCTTCTGAAGCATCAAGTGGTACTCGTCTTGAATTTAAGTTCCCGTCTACTAAAAATGTAACTAAAGTAGAATTTTATAATACTGTTTCCGGTAAATGGGAAGTATTTGCTTCCGCTAATTACGCTATTTCTGATGCTGGAAATATTCAAGTTCAAGGTGTACCTGTTGCTTATAAAAAGCTTACTACACAAGGCGCTATGTCCGGTGCTTTGCAGTTAAGATTTACTGTTGCTAATGTTAGTCGTTCTGAAAACGATGAACCTGATACTTACAATGGCGAACCTATTACTGATGAAGTATTTAGAATGTTAGCTGCTAATAGCACTACTCTTCCTTTTGTTGAAGAATCTATTGCTATGCTTGCTGCTGCCGAACCAAGAACTCGTCCTGTCGGTGTTGCTGCATTTGCTGTTAACTTTGAACCAGGAGGTCAAGCTCCTCTTGATGCTCGTACAGTAGTTGGAACAAAAGCTGATTTGATTAATGCTGCTACTTATGCTGCTAAGAACTACTATCAAGGTATGCTTGTTATTGTAAAAGATACTCAAGAAGTTTATGTTCTTAAGGATATAGCTAAAATTACTTCTGCTGATTATAGTGGTTGGAAACGAGTTGACGGTGGCGGTGTTACTCAAACAGTTGTTGAAAACGTTTTGACAAGTACGAGTACAACTCATGCTTTGTCTGCCGCACAAGGTAAAATTCTTAACGACAGTAAACTTAACAAGACTGATGTTGTTAATAATCTTACTACTGTTGATACAAGTAAAGCTCTTAGTGCTGCACAAGGTAAAGCTTTAAACGATAGAATTGCTTCTATAGGCAATGTTTATAAATATAAAGGAACTAAAGCTAATATCAGCGAAGTTATTGCTATTACTAATGCTTTCGTTGGTGATGTTTATAATGTAGAAGCTGAATTTTCAGTTGGTGGTAAAAAATATCCTGCTGGTACTAATGTCGCTTGTATTAAGAATACTTCTACTACTGAACATACTGAAGCTAACTGGGACCCTCTTGGCGGTACTGTTGATTTATCTGCTTATGCTACTAAAGCAGAAATGAATAGCGGTCTTAACAGTAAAATTAATACATCTGCAATCAAGAATGATTTAACTACTGGTGGCGCTACTAATGTTTTATCTGCCGAACAAGGTAAGATATTAAAACAGATGATTGACCAAGCTACTGCTGATGGTGGTATTGTTATTGAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
3dba885ef34094ee6be300711579007f5d34cab48f565ab7fee9aa214eae6afe
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,3061
Oligomeric State monomer
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Taxonomic proposal: Crassvirales, a new order of highly abundant and diverse bacterial viruses Shkoporov,A.N., Stockdale,S.R., Guerin,E., Ross,R.P. and Hill,C. 2023-03-24 GenBank