Protein

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Genbank accession

XHY54301.1 [GenBank]

Protein name

tail fiber protein

RBP type

Evidence GenBank

Probability 1,00

Evidence RBPdetect2

Probability 0,95

Protein sequence

MYSIKTDLDITGAGTVGKDLLVKGNAVFNNNLTVNGTVTFANATFTAIESSTANITSTLDVGGKATLSGGLGVDGNTTIGSAVVGSDTATINSNATFNGTVSVGSDFTQTAGTTTLQATKVKNLEVAETTAFKGNITADVGTTAAFDKITANTAEITNVSTTDISSTGTATFKDVTISGTLGGEFNLSDLNAVTLNVTGASNQQGAVTFGANVTGINSTATFKDIRIGSNSESQTFRLSFPYTAPGKRPTVILQNEIQSELMSPANLTVLTSASFGNASLSSYGITGNGLNKLDYLTVSGNNTQSPDTPLLEVQKGKTKVADFEVTGTATIPNIESTGTANFNNINISGVLGGTFQLDDINAVTLNVTGATSLVGGVTLGSNITGYNSTATFKAISLGQNSQDAAVKLGFGYTAPGQRPTVILPNEVQSEVVSPSTLNVLKTATFGNASLSSYGITGNGLNKLDYLTVSGNETQAPDTPLLEVQKGKTKVADFEVTGTATIPNIESTGTANFNNINISGVLGGTFQLDDINAASLNVTGATSLVGGVTLGSNITGYNSTASFKAISLGQSSQDSAVKLGFGYTAPSQRPTVILPNEVQSELVSPSTLNVLKTATFGNAALSTYGITGNGLNKLDYLTITGNATQDPSTPFLQVGGKAILNDVDFTGTVTGLTVDVSGQDLTPNSVVAATNIKGATLESTGNTTVGAKLTVTGDIAGTTATLSGALSAGSVSSGSITGTTSVSAPTISASTEVTAPTITASGTVSGQTINGTNISATTLTAPTISGNTNFTENVDITGNLTVTGTVTPGTIDLSTTDVSAKSITTTAGANIGGDLVVQGSFDLSAADINVKSLTSSGIVKSNDLVNANVLPVLNSTTITATTVNADDITVTGSANLGTIYSSSSVLVGSTLTVTGETTTASLVTPTISNASGVTISNNTNVTGDLTVTGAVIPGSIDLATTDVNAKSITTTAGATIGGNLTVNGTVDLTTADVTVKSLTSTGAIVSNESTISSVLPKLQSTDATIATLGSTTANITNLNVTGASTVADVTSSGKVKAVSVETPTISNVDGVSISNNTSITGDLTVSGTVTPGAIDLSTTDVSAKSITTTAGANIGGDLVVSGTVDLSGADVSVKSLTSTGIITVSSAEGINVLPKVQSTEVTVSALNATNAVVSGDVSAATASISGAITGGSATLSGVGTALNVTNNATVGGVLTVGSITSAAENVSITKNTAITGNLAVSGTLTAGVIDLSTTDVSVKTLTSLGDATVQGNLTVDGSIDLSSANIVGVTLESTGSTTVGTDLILTTGNITGSPSISGNLGVTGTTTLTGATTVSNTLSTGGKLTVNTGGIQVVDGGIQVDAGTITAPSANISGDSTLNSATVTTTLGVTGAASMNGGLTASTLDVTGDSTVQKLTVKGAFIPEGGLDLSGADLNVNSVTAATTLSVTGASTLTGGVSTSTVTASGKVTAQELSTGTLAVTTNGTVGGTLDVTGKATVGSLDSGAISATSGTFSTTLGVTGAATFGNNVNITGTLTPGALDLSSTDVDANSLSVATTLHSNGNATIGGTLGVTGAATAPSIALNGEGTALAVTNNATIGGTLGVTGKATVGSLDSGAVSATSGTFSTTIDVTGAATFGNNVNITGTLTPGALDLASTDVVANSLSVATTLHSDGNATIGGTLGVTGAATAPSIALNGEGTALAVTNNATIGGTLGVTGAATLGSLTTSGAVKTGSNVIIGTKIGEQPETVQIFPNTYIAGSLRVDGGINADIDVSGQTIEPYAVVAADTISAAGNITSGAELISKSATIGDVGSQNNNLTINGNVVNNGNFTVTGVLNATLNQANSDVAVKSLTATNSVAAGTSITAGTSITATGLLKGNTLEVTTTGSFGGAVTMSSGANITGTVGITSGNLTVGGDISATGTATLAATSVTTITTSGAATLASASVTGAATIGGTLTVTGLMTANGSVVLGDAAADTLTVNATSSFKENAVFDKDVTVTGQLTTTNADLTTTTVTTKKYDVIPNQVTSSVIAPTGTWTPDGTSNVYFITLDQDTTLAPITGLIGGGKASSVYIYVKQDTTGNRNFTTDGTYAVVDGTLNKTAGSVTIYQVIYDGVSPVADMFIAQRTA

Physico‐chemical properties

protein length:	2129 AA
molecular weight:	208682,72560 Da
isoelectric point:	4,16837
aromaticity:	0,03100
hydropathy:	0,21954

Domains

Domains [InterPro]

DC_0092
STR
118–331

DC_0092 DC_0092 DC_0092 DC_0062 DC_0092 DC_0931

DC_0092
STR
307–501

DC_0092 DC_0092 IPR058970

XHY54301.1

1 2129

Architecture

STR

RBD

STR 118-1034 | STR 1061-1370 | STR 1439-1632 | RBD 1738-2129

Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Domains [InterPro]

Domain ID	Category	Cluster	Start	End	Layer	Name	Pref Zone	Confidence	Evidence	Support
DC_0092	STR	DC_0092	118	331	Novel HMM	DC_0092	Central	Low	Positional only	72 proteins / 72 hits
DC_0092	STR	DC_0092	307	501	Novel HMM	DC_0092	Central	Low	Positional only	72 proteins / 72 hits
DC_0092	STR	DC_0092	477	765	Novel HMM	DC_0092	Central	Low	Positional only	72 proteins / 72 hits
DC_0092	STR	DC_0092	730	882	Novel HMM	DC_0092	Central	Low	Positional only	72 proteins / 72 hits
DC_0092	STR	DC_0092	860	1034	Novel HMM	DC_0092	Central	Low	Positional only	72 proteins / 72 hits
DC_0062	STR	DC_0062	1061	1370	Novel HMM	DC_0062	Central	Low	Positional only	50 proteins / 50 hits
DC_0092	STR	DC_0092	1439	1632	Novel HMM	DC_0092	Central	Low	Positional only	72 proteins / 72 hits
DC_0931	RBD	DC_0931	1738	2129	Novel HMM	DC_0931	C-terminal	Low	Positional only	65 proteins / 65 hits
IPR058970	RBD	DC_0552	2038	2117	InterPro cluster	Putative phage tail fibre, C-terminal domain	C-terminal	Low	Positional only	292 proteins / 292 hits

Taxonomy

	Name	Taxonomy ID	Lineage
Phage	Escherichia phage JP4 [NCBI]	3349802	Viruses >
Host	No host information

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession

XHY54301.1 [NCBI]

Genbank nucleotide accession

PQ330092.1 [NCBI]

CDS location

range 291232 -> 297621
strand -

CDS

ATGTACTCAATAAAAACTGACTTAGATATTACTGGTGCTGGTACGGTTGGTAAGGATCTTTTAGTCAAAGGAAATGCTGTTTTCAATAATAACCTAACTGTAAATGGTACTGTAACTTTTGCAAATGCAACTTTTACTGCCATTGAATCATCAACTGCCAACATTACATCTACTTTAGATGTTGGTGGCAAAGCAACACTTTCTGGTGGTCTTGGTGTTGATGGTAATACTACAATCGGTAGTGCAGTTGTCGGGTCTGATACAGCAACAATTAATTCAAACGCTACCTTTAACGGTACTGTATCAGTTGGTTCTGATTTTACACAAACTGCTGGTACAACCACTCTACAAGCAACTAAAGTTAAAAACTTAGAAGTTGCTGAAACAACAGCATTTAAAGGTAATATTACTGCTGATGTTGGTACTACTGCTGCATTTGATAAAATTACTGCTAATACCGCAGAAATTACTAATGTAAGTACAACCGATATTAGTAGTACTGGTACTGCTACATTTAAAGATGTGACAATTAGTGGTACACTTGGTGGTGAGTTTAATCTATCTGACTTAAATGCAGTAACATTGAACGTTACTGGTGCATCTAACCAACAAGGTGCAGTAACTTTCGGTGCTAACGTAACTGGTATTAACAGTACTGCTACTTTTAAAGACATTCGTATTGGTTCTAACTCTGAATCACAAACCTTCAGATTAAGCTTCCCTTACACTGCTCCAGGTAAACGTCCAACTGTAATTCTACAAAACGAAATTCAGTCCGAGTTAATGTCACCTGCAAACTTAACAGTTTTGACATCTGCTTCTTTTGGTAATGCGTCATTATCTTCTTATGGTATTACTGGTAATGGTCTAAACAAATTAGATTATCTAACAGTTTCTGGTAACAATACACAATCACCAGACACCCCACTATTAGAAGTTCAAAAAGGAAAAACCAAAGTTGCCGATTTTGAAGTTACAGGAACCGCAACTATACCAAATATTGAAAGTACTGGAACTGCTAATTTTAATAATATTAATATTTCTGGTGTTCTTGGTGGAACATTCCAACTAGATGATATTAATGCAGTAACATTGAACGTTACTGGGGCCACTTCGTTAGTTGGTGGTGTTACTCTTGGTTCTAATATTACTGGTTATAATAGTACTGCTACCTTTAAAGCTATTAGCTTAGGTCAAAATAGTCAAGATGCAGCAGTGAAACTAGGTTTTGGATATACTGCACCCGGTCAACGCCCAACAGTTATTCTACCTAATGAAGTTCAATCAGAAGTAGTTTCTCCTTCTACATTGAACGTTCTTAAAACTGCAACTTTTGGTAATGCGTCATTATCGTCTTATGGCATTACTGGTAATGGCCTAAACAAATTAGATTATCTAACAGTTTCTGGTAACGAAACACAAGCTCCAGATACACCACTATTAGAAGTTCAAAAAGGAAAAACCAAAGTTGCTGACTTTGAAGTCACCGGAACTGCAACTATACCAAATATTGAAAGTACTGGAACTGCTAATTTTAATAATATTAATATTTCTGGTGTTCTTGGTGGAACATTCCAATTAGACGATATTAATGCAGCATCTTTGAACGTTACTGGTGCAACTTCATTAGTTGGTGGTGTTACTCTTGGTTCTAATATTACTGGTTATAACAGTACTGCATCATTTAAAGCTATCAGCTTAGGCCAAAGTAGTCAAGATTCTGCTGTAAAACTTGGATTTGGATATACTGCACCAAGTCAACGTCCAACCGTGATTTTACCTAACGAAGTTCAATCAGAATTAGTTTCTCCTTCAACACTGAACGTTCTAAAAACGGCAACTTTTGGTAATGCTGCACTTTCTACGTATGGTATTACTGGTAATGGCCTAAACAAATTAGATTACCTAACCATTACAGGTAACGCAACACAAGACCCTAGTACACCATTCCTACAAGTTGGTGGTAAAGCAATTCTTAATGATGTCGATTTTACTGGCACCGTAACTGGGTTAACTGTTGATGTAAGTGGTCAGGATCTAACACCAAACTCAGTTGTTGCTGCGACAAATATTAAAGGTGCAACCCTTGAAAGTACTGGTAACACTACCGTGGGTGCTAAACTAACTGTTACTGGTGATATTGCTGGTACAACTGCAACTCTTTCTGGTGCATTATCCGCTGGTTCAGTAAGTTCTGGTTCTATTACTGGTACAACTTCTGTATCTGCACCAACAATTAGTGCATCTACTGAAGTAACGGCTCCTACTATCACTGCGAGTGGAACTGTAAGTGGACAAACAATTAACGGTACTAATATTAGTGCAACAACTCTGACTGCACCAACTATTAGTGGTAATACTAACTTCACAGAAAATGTTGATATTACTGGAAATCTAACAGTTACTGGTACAGTAACCCCAGGTACAATTGATTTGAGTACTACTGATGTTAGTGCGAAATCAATCACTACTACCGCTGGTGCAAATATTGGTGGAGATCTTGTGGTTCAAGGTTCTTTTGATTTATCAGCAGCAGACATTAACGTTAAATCACTAACTTCTTCTGGTATTGTTAAAAGTAATGACCTTGTTAATGCTAACGTACTTCCTGTACTTAATAGTACTACCATAACGGCAACTACTGTTAATGCTGATGATATAACTGTTACCGGATCTGCTAATTTGGGTACAATTTACTCAAGCTCATCTGTTCTAGTTGGGTCAACTTTAACTGTAACTGGTGAAACTACAACTGCATCGTTGGTTACCCCAACCATTTCAAATGCAAGTGGTGTCACTATTTCCAATAATACAAATGTAACTGGTGACCTAACCGTTACTGGTGCAGTTATTCCAGGCTCTATCGATCTAGCAACAACTGATGTTAATGCTAAATCCATTACTACTACTGCTGGTGCAACTATTGGTGGTAACCTAACTGTTAATGGTACAGTAGATCTTACTACTGCTGATGTTACTGTCAAATCTTTAACTAGTACTGGTGCAATTGTTAGTAATGAATCTACAATTAGTAGTGTTCTACCTAAACTTCAAAGTACTGATGCAACTATTGCAACCCTTGGTTCAACAACTGCAAATATTACTAATTTGAATGTTACTGGTGCATCTACCGTAGCTGACGTAACTTCTTCAGGTAAAGTTAAAGCAGTTTCTGTAGAAACCCCAACAATTAGTAACGTTGATGGTGTATCTATTTCCAATAATACATCTATTACTGGTGACCTAACAGTTTCTGGTACAGTAACACCAGGTGCAATTGATTTGAGCACAACTGATGTAAGTGCAAAATCCATTACTACTACCGCTGGAGCAAATATTGGTGGAGATCTTGTTGTTTCTGGTACAGTTGATTTAAGTGGTGCTGATGTATCTGTTAAATCTCTAACAAGTACTGGTATTATTACAGTTAGTAGTGCAGAAGGTATCAACGTTCTACCTAAAGTTCAAAGTACTGAAGTTACAGTGTCTGCTCTAAATGCAACAAATGCAGTAGTTTCTGGTGATGTTTCAGCAGCAACAGCTTCAATCTCAGGTGCAATTACTGGTGGGTCAGCAACACTATCTGGTGTTGGAACTGCTCTAAATGTAACTAATAACGCAACTGTTGGTGGTGTACTTACTGTTGGTTCTATTACTTCAGCGGCAGAAAATGTATCCATTACTAAAAATACCGCGATTACTGGTAATTTAGCAGTATCTGGAACACTAACTGCGGGTGTTATTGATCTTAGCACAACTGATGTGTCTGTGAAGACATTAACTTCTCTAGGTGATGCAACCGTTCAAGGTAACTTAACTGTTGATGGTTCTATTGACCTAAGTTCTGCAAACATCGTCGGTGTAACACTAGAAAGTACTGGCTCTACCACTGTAGGTACTGATTTGATTCTAACTACAGGTAACATTACAGGTAGTCCATCTATTTCTGGTAACTTGGGCGTTACTGGAACCACAACGTTAACTGGTGCAACTACAGTTTCAAACACATTGTCAACTGGTGGTAAACTAACAGTTAATACTGGTGGTATTCAAGTAGTTGATGGTGGTATTCAAGTTGATGCAGGAACTATTACCGCACCAAGTGCTAATATTTCTGGTGACTCTACCCTTAATAGTGCAACTGTAACTACTACCCTTGGTGTTACTGGTGCAGCTAGTATGAATGGTGGCCTTACAGCATCTACTCTAGATGTAACTGGTGACAGTACTGTACAAAAACTAACTGTTAAGGGTGCATTTATTCCTGAAGGTGGTTTGGACCTATCCGGTGCTGATCTTAACGTGAATAGCGTAACTGCTGCAACCACATTAAGTGTTACTGGTGCAAGTACTCTAACTGGTGGTGTTTCCACTTCAACTGTTACTGCATCCGGTAAGGTAACTGCACAAGAATTAAGTACTGGTACATTGGCAGTAACCACAAATGGAACAGTTGGTGGTACTTTAGATGTAACTGGAAAGGCAACAGTCGGTTCACTAGATTCAGGTGCAATATCTGCAACTTCTGGTACATTTAGTACTACACTAGGTGTAACAGGTGCAGCAACATTTGGTAACAATGTTAATATTACTGGCACGTTAACCCCAGGTGCATTGGATTTATCTAGTACTGATGTAGATGCTAACAGTCTTTCTGTTGCAACAACCCTACATTCAAACGGCAATGCAACAATCGGTGGTACACTAGGTGTAACTGGTGCAGCAACTGCTCCATCAATCGCTCTTAATGGTGAAGGAACTGCATTAGCAGTTACTAACAATGCAACAATTGGTGGTACACTAGGTGTAACTGGAAAGGCAACTGTCGGTTCACTAGATTCAGGTGCGGTATCTGCAACTTCTGGTACATTTAGTACTACAATAGATGTAACTGGTGCAGCAACCTTTGGTAATAATGTTAACATTACTGGTACATTAACGCCAGGTGCATTGGATTTAGCTAGTACTGATGTAGTTGCAAACAGTCTTTCTGTTGCAACCACACTACATTCAGATGGTAATGCAACAATTGGTGGTACACTAGGTGTAACTGGTGCAGCAACTGCTCCATCAATCGCTCTTAATGGTGAAGGAACTGCATTAGCAGTTACTAACAATGCAACAATTGGTGGTACACTAGGTGTAACTGGTGCAGCAACTTTAGGTTCACTAACAACTTCTGGTGCAGTGAAAACTGGTTCTAATGTTATTATTGGTACTAAGATCGGTGAACAACCAGAAACAGTTCAGATTTTCCCTAACACTTACATTGCTGGTTCCTTGCGTGTAGATGGTGGTATCAACGCTGATATTGATGTTAGTGGTCAAACAATCGAACCTTATGCAGTTGTTGCGGCTGACACTATTAGTGCAGCGGGTAATATTACTTCTGGTGCAGAGTTGATTTCTAAATCAGCAACTATTGGTGATGTTGGTTCACAAAACAACAACTTAACAATCAATGGTAACGTAGTTAACAACGGTAACTTTACAGTAACTGGTGTTCTAAACGCAACACTAAACCAAGCAAACTCTGATGTAGCTGTTAAATCATTAACTGCAACCAACAGTGTTGCTGCTGGTACTAGCATTACCGCAGGTACAAGTATTACTGCAACTGGTCTGCTAAAAGGGAACACCCTTGAAGTAACTACTACTGGTTCATTTGGTGGTGCAGTAACAATGTCAAGTGGTGCTAACATTACTGGAACCGTTGGGATTACTTCTGGTAACCTAACTGTTGGTGGTGATATTTCTGCAACAGGTACTGCAACCCTAGCAGCAACTTCAGTAACTACTATTACTACTTCTGGTGCAGCAACACTTGCTAGTGCATCTGTTACTGGAGCAGCAACAATCGGTGGTACTTTAACTGTTACTGGATTAATGACTGCAAATGGTAGTGTTGTTTTAGGTGACGCGGCTGCTGATACATTAACTGTCAATGCAACATCTTCTTTCAAAGAAAATGCAGTATTTGATAAAGATGTAACTGTAACTGGTCAATTAACAACTACTAATGCTGACTTGACTACTACAACAGTAACTACTAAAAAATATGATGTTATTCCTAATCAAGTAACTTCTTCTGTTATCGCACCAACTGGTACTTGGACCCCAGACGGTACTAGCAACGTATACTTTATCACTCTAGATCAAGATACAACTCTAGCACCAATCACTGGTCTAATCGGCGGTGGTAAAGCATCTTCAGTATACATTTATGTGAAACAAGATACAACAGGTAATAGAAACTTTACTACTGACGGTACTTATGCGGTTGTTGATGGAACTCTAAACAAAACTGCTGGTAGTGTGACCATTTACCAAGTCATTTATGACGGTGTGAGTCCAGTAGCAGATATGTTTATTGCACAACGTACAGCTTAA

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID

3fa929015450165ed6dfbf84ee2da523a5b470398a6f049a6d4c6509097479d2

ColabFold

Source ColabFold

Method ColabFold

Resolution 0,4742

Oligomeric State monomer

Download PDB

Model Confidence

Very high
pLDDT > 90

High
90 > pLDDT > 70

Low
70 > pLDDT > 50

Very low
pLDDT < 50

Literature

Title	Authors	Date	PMID	Source
Characterization of a novel jumbo phage JP4 with potential to control drug-resistant pathogenic Escherichia coli	Zhang,K., Wei,X., He,B., Liao,J., Wang,J., Le,S. and Lu,S.	2025-11-25	—	GenBank

Protein

Domains

Domains [InterPro]

Domains [InterPro]

Taxonomy

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

Predicted Aligned Error (PAE)

Model Confidence

Literature