Protein

Genbank accession
CAJ42254.1 [GenBank]
Protein name
putative tail fiber [Escherichia phage Rtp]
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
Protein sequence
MAIYDLGSASLAANGEVTGVGTTWKAPLTLIRVGATIVFKTEPVKIYTISEIISDTQINVYNPNSETVPAGTGYAILAHDGITVQGLAQDVAETLRYYQSRETEVADAVDVFNNFDFNDFESKVTQVNNQYGDVVNMSSQVAQNAAQVAGDMASAAASAGLAMSSEQAARGYAESLSGALISSFESGGVIESRNQQMIWLDSGKPKSYVWMGDLPKTVPENSTPYSSGGIGDSSWSELGSKGYVSFYDFGCVGDGITNDISGINRAINYAKSKNLKIKQNDGVFLVSGSDYIDIGSLSADFTGSVIKPSSSWTGQITITNGEPTTYDASSSVVSSFNSMSNESRTAGSNLFDSISENRDLDGCFIVFYTNQDMYTYRDSVQKRIELNRVYNRGYLENSLKYDLGNNVTSVRALKINKTTQEIKGLTIDESLSTRYQIVYVNNSTRLSIKDISFINKPITQGFSDTRLAIANSYDITVDGLFAESVADARDSSGELYSYALSIGESMNVRIMNARVNGKGWGANGSNNCANVTFENCDLSRIDFHMPFHNYLKIENCNIGARGVVVTGLGDLHIRDSAFNASRYTNGNIITTRADAGGFFDGNLYMDNITFTGTRSTGLTGTGLINGISYEGNGPVAGSPIKSTLFNSVRIKGLNFKSGSYSSHPGNLFYSSRDGALLFPSDVSISDVNMSAFPSSASLGLTIDFSRFKGPFSDMTNSESSLTGRFTTNISIKGILSNNIVFMGANSLHNPNVSIYDLSSPVGSSRYPIFETNQRGSYYMVNCNVERLRAYYGSDPNGPVAIKFVGGIVKSTSDTASPVDGSVNHDISFINTRFVCNFNGQSQSTLPITTGISRRALLSSCDFFDISGVRLNGLNIPVSESTSVTVGFGFRLNQDLVVTTGFSGSNTFTANKISVISDSPQRFATRSSSTGAISFALSGTLVSSTTISTTSGNELRSVKLI
Physico‐chemical
properties
protein length:960 AA
molecular weight: 103040,14730 Da
isoelectric point:5,17334
aromaticity:0,09479
hydropathy:-0,16302

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage Rtp
[NCBI]
2994041 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAJ42254.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
AM156909.1 [NCBI]
CDS location
range 30856 -> 33738
strand -
CDS
ATGGCAATTTATGACTTGGGATCCGCATCATTAGCTGCAAACGGCGAGGTGACTGGTGTCGGGACAACATGGAAAGCACCGCTTACACTGATTCGCGTAGGTGCCACCATTGTATTTAAAACTGAGCCAGTAAAAATTTACACCATCTCTGAGATCATCAGCGATACGCAGATTAATGTTTATAACCCTAATTCTGAAACTGTTCCTGCTGGAACTGGTTACGCTATTCTTGCTCATGATGGGATTACCGTTCAGGGATTAGCTCAAGATGTTGCTGAGACTCTTCGTTACTATCAGTCACGTGAAACTGAGGTTGCTGATGCAGTTGATGTATTTAACAACTTTGACTTTAATGATTTTGAATCTAAAGTAACACAGGTTAACAATCAGTATGGCGATGTTGTAAACATGTCATCACAGGTTGCGCAGAATGCTGCCCAGGTAGCAGGTGATATGGCTTCTGCTGCAGCGAGTGCTGGATTAGCAATGTCATCAGAACAAGCTGCACGGGGTTATGCGGAATCATTATCTGGTGCCTTAATTTCATCATTTGAGTCCGGAGGTGTAATAGAGTCAAGAAATCAACAAATGATATGGCTTGACTCCGGTAAGCCAAAGTCATACGTATGGATGGGAGATCTACCTAAGACAGTCCCGGAAAACTCGACACCATATTCTTCTGGTGGGATTGGTGATTCTTCGTGGTCTGAGCTAGGATCTAAAGGTTATGTTAGTTTCTATGATTTTGGGTGTGTTGGAGATGGTATTACTAATGATATTTCAGGTATAAATCGAGCGATAAACTACGCAAAATCCAAAAATCTAAAGATAAAGCAGAATGATGGTGTTTTTCTTGTTTCTGGTTCCGATTATATTGATATTGGTTCATTGAGTGCTGATTTTACAGGCTCTGTTATAAAACCATCATCCTCATGGACCGGGCAGATAACTATAACCAACGGGGAACCTACAACTTATGACGCTTCGTCATCTGTTGTTTCATCTTTTAACTCCATGTCTAATGAATCAAGAACTGCTGGAAGTAATTTGTTCGACTCTATATCTGAAAATCGTGACCTTGATGGTTGTTTTATTGTTTTTTATACAAATCAGGACATGTACACATATAGGGATTCTGTTCAGAAAAGAATTGAACTCAATAGGGTTTACAATAGGGGTTATCTGGAGAACTCACTGAAGTATGATCTTGGAAATAATGTTACATCAGTTAGAGCCTTGAAGATAAACAAGACAACTCAGGAAATCAAGGGTTTAACTATAGATGAAAGTCTTTCGACACGGTATCAGATAGTTTATGTTAATAATTCTACAAGGTTGTCAATAAAAGATATTTCTTTTATTAACAAGCCGATAACACAAGGGTTTAGCGATACAAGGTTGGCAATAGCTAACTCATATGATATCACAGTTGATGGTCTTTTTGCCGAGTCTGTTGCAGACGCAAGAGATTCTTCTGGTGAGCTTTACTCATACGCCTTATCAATAGGTGAATCAATGAACGTAAGGATTATGAACGCAAGGGTTAACGGTAAAGGATGGGGCGCAAATGGTAGTAACAACTGCGCAAACGTAACTTTTGAAAATTGTGATCTAAGTAGAATTGACTTTCACATGCCTTTCCATAACTACCTTAAGATTGAAAACTGCAATATCGGTGCCCGTGGTGTTGTTGTTACTGGTCTTGGCGATTTGCATATAAGGGATAGTGCATTTAATGCGTCTAGATATACGAATGGGAATATCATAACAACAAGGGCAGACGCTGGAGGTTTCTTTGACGGAAACCTTTACATGGATAACATTACTTTTACAGGCACAAGAAGTACTGGCCTGACCGGGACGGGTTTGATAAATGGAATTTCTTATGAAGGAAATGGACCTGTAGCTGGCTCACCAATAAAGAGCACTCTGTTTAACTCAGTTAGGATTAAGGGCCTTAACTTCAAGTCAGGAAGCTACAGTTCTCATCCTGGTAATTTATTCTACTCAAGTAGAGATGGTGCGCTGCTTTTCCCTTCTGACGTTTCAATATCAGATGTTAACATGTCGGCTTTCCCATCATCTGCTAGCTTGGGGCTTACTATTGATTTTTCAAGGTTTAAGGGGCCATTCTCGGACATGACAAATTCTGAAAGCTCATTGACTGGAAGGTTTACTACCAACATAAGTATAAAGGGGATTTTATCAAATAATATCGTTTTCATGGGTGCTAACAGTCTTCATAACCCTAACGTTTCTATATATGATCTCTCTTCACCTGTCGGAAGCTCGAGATACCCTATATTTGAGACAAACCAGAGGGGGAGCTATTACATGGTTAATTGTAATGTTGAAAGGCTTAGAGCTTACTATGGTTCAGACCCAAATGGACCTGTGGCAATAAAATTTGTTGGCGGTATTGTTAAGTCAACATCTGATACGGCCTCTCCGGTTGATGGCTCTGTTAATCATGATATTAGTTTCATTAACACAAGATTTGTATGTAACTTCAATGGACAGTCTCAGAGTACGCTACCAATAACAACAGGCATTTCAAGAAGGGCGCTTCTTTCTTCTTGTGATTTCTTTGATATCTCAGGTGTGCGGCTAAATGGGCTTAACATTCCTGTGAGCGAGTCAACCTCTGTTACTGTTGGATTTGGATTTAGACTCAATCAGGATTTGGTTGTAACTACTGGTTTTTCTGGCTCTAATACTTTTACAGCAAATAAGATAAGTGTTATAAGCGATTCACCTCAAAGGTTTGCTACTAGATCCTCATCGACTGGAGCTATTTCGTTTGCATTGTCTGGGACGTTAGTTAGTTCAACAACAATATCTACAACTTCTGGTAATGAGTTAAGATCTGTTAAATTGATTTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.