Protein

Genbank accession
CAF34240.1 [GenBank]
Protein name
virion structural protein [Synechococcus phage S-PM2]
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 0,82
Protein sequence
MSDRFPLIVNETSRRIEELIAGDNLDLTGNGIALDGDVGLEGQSLHSNGSVVEWRFAGDVFLTGIQSVSDKIFSNCNISGTENALSNIGNDSLENSSITINGTSIPLGGSVTTADTNTTYSFAAVDGTTDVRKTIRLTSGGSGTSTDQDVTLVAGTNVSLTRAGNDIQISSSFTDTDTITTLRSAVGGNATSGDISIAGSGSTTVSQSVDGLTITIDSTDTDTITRLRGGTGENFLAGDFTLIAGDEVTLSQTGRDITINSVDTITRLKGGATGSFKSGDVTFTGSGATTVSQSQDGSTITIDSIDTNTITRIRGSNGGTLTSGDVTFLGSGVTTVEQSPDGRTITISSTDQDTTYDAALSGGLFLSGTSFSLKNNENINDQTIVKWDSSNFQLTNSIITDDGSTVTIGGDLLVTGTTTTINTQNLVVADNNIELRRGENLTGSNGGIQLNRTTDGTGLVTSFNAMQWFESGGYWRTWDGSVPHRLVTDDEIQTLTNKTLDSPTLNFPSLGAATATSINGLSFGSTVSASLSVGNSKAISFNNSVTFNTAQNDSTITVQLSNGGTVAYTSNTLAVFASTTSNQLRGVISDSTGVGKAVFNQNPSFADSITTSSSTFSVFNTGVTNINAFGAATTITMGAISGTTTIRNSLQVDGSATIGNESGDIITVNGATNFNNEDLTLRGSSDNPIKIGRGGNAIATNTRVGYRALESNTTGANNTAFGYESSFVLNTGSNNTSFGYQALRSSGIGEGNVAFGSQSCISVTEGVGNVGVGTLTLSSVTDTNYNVCIGHYAGAALTGSGNVLIGPASTEDSLSATYAPPAPTGNNQLVIASGTGVWIRGDNGFNVVMPNNVTIQKNLQISGDLTVNGTTTTVNSRVVTIDDKAIELGAVATINFVGNATLNSNVISNLPTTAGLIVGMEVQVLNVGITLPPGTIITSIGTDQIVLNGNIGGSGGTNVTFTAIGPSDTTANGGGIIVRGSTNKTILYDNDGILPFWKISDNVDIPSGKVFSINESSVLSATTLGSSVVNSSLTSVGTLQSLSVTGNVNLKGRITEKVVNNFVTSITPVSNELEVSAANGNTIIGTLAASAINTWNFTNLGLTNGSSITLTLIVDGNATAIYGDACKVEGNSITGGIQWSGGSPPANTSNIDILTFIVVRDTSGVTKVYGQGNTGFS
Physico‐chemical
properties
protein length:1177 AA
molecular weight: 120409,43140 Da
isoelectric point:4,27244
aromaticity:0,05268
hydropathy:-0,02897

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-PM2
[NCBI] 		238854 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAF34240.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
AJ630128.1 [NCBI]
CDS location
range 131561 -> 135094
strand -
CDS
ATGTCAGATCGTTTTCCACTAATAGTTAATGAAACTTCTCGTAGAATTGAAGAATTAATTGCAGGCGACAATTTAGATTTAACTGGTAATGGAATTGCACTCGACGGAGATGTTGGTCTCGAAGGTCAATCTTTACATAGCAATGGATCTGTTGTTGAATGGAGATTCGCTGGAGATGTATTCTTAACTGGCATCCAATCCGTTAGTGATAAGATTTTCAGTAATTGTAATATATCTGGCACAGAAAATGCCTTATCAAATATTGGCAATGATAGTTTAGAAAACTCATCAATTACTATCAATGGAACTTCCATTCCCCTTGGTGGTTCTGTTACAACAGCCGATACCAATACAACATATAGTTTTGCTGCAGTAGATGGAACTACCGACGTAAGAAAAACTATAAGATTAACTTCTGGAGGTTCAGGAACTTCAACGGATCAAGATGTGACATTAGTAGCAGGAACTAATGTCAGTTTAACAAGAGCAGGAAATGATATTCAAATTTCCTCAAGTTTTACAGACACAGATACCATCACAACATTGAGAAGTGCTGTTGGTGGCAATGCTACATCAGGTGATATTTCTATTGCTGGTTCTGGATCAACAACAGTATCACAATCTGTAGATGGTTTAACAATTACCATTGATTCAACTGATACAGATACTATCACTAGATTGAGAGGGGGAACTGGCGAGAACTTCTTAGCAGGTGACTTCACTCTAATTGCTGGTGATGAAGTAACACTATCTCAAACTGGTAGAGATATTACAATCAACTCTGTAGATACTATTACAAGATTAAAGGGTGGTGCTACAGGTTCATTCAAATCTGGTGATGTAACATTTACAGGTTCTGGTGCAACTACAGTTAGTCAATCTCAAGATGGTTCTACAATCACAATTGATTCAATTGATACTAACACTATCACGAGAATTAGAGGTTCGAATGGCGGAACACTAACATCAGGTGATGTTACATTCTTGGGTTCTGGAGTAACAACAGTAGAACAATCACCAGATGGTAGAACAATTACAATTAGTTCTACTGATCAAGATACAACATATGATGCTGCATTGTCTGGTGGTTTATTCCTTTCTGGGACTTCATTTTCTCTAAAGAATAATGAAAATATTAATGACCAGACTATTGTAAAATGGGACTCATCAAACTTCCAATTAACAAATAGTATTATCACTGATGATGGATCAACTGTTACCATTGGTGGTGACCTGCTCGTAACAGGAACTACAACAACAATTAATACACAAAATCTTGTTGTTGCAGATAATAACATTGAACTAAGAAGGGGAGAAAATTTAACTGGAAGTAATGGAGGTATTCAACTAAACAGAACTACAGATGGAACAGGTTTAGTTACTTCATTCAATGCAATGCAGTGGTTTGAAAGTGGTGGATACTGGAGAACTTGGGATGGTTCTGTACCACATAGATTAGTTACAGATGATGAAATTCAAACCCTAACAAATAAAACTCTAGATTCACCAACACTTAACTTCCCATCTCTTGGAGCTGCTACTGCGACAAGCATCAATGGTTTATCATTTGGTTCTACAGTTTCTGCATCACTGAGTGTAGGAAACTCAAAAGCAATTTCATTCAACAATTCAGTAACATTTAATACTGCTCAGAATGACAGCACCATAACAGTTCAATTATCTAATGGTGGTACCGTTGCTTATACAAGTAATACCCTGGCAGTATTTGCATCAACAACTTCTAACCAGTTAAGAGGTGTTATCTCAGATAGCACTGGAGTTGGTAAAGCAGTATTCAACCAGAACCCATCTTTTGCCGATAGCATTACAACTAGCAGTAGTACATTTAGTGTATTCAATACTGGTGTAACAAACATTAATGCATTTGGAGCTGCTACCACAATTACAATGGGTGCTATTTCTGGCACAACTACCATCAGAAATTCTCTGCAAGTAGATGGTAGTGCAACCATTGGTAATGAATCAGGTGATATTATTACAGTTAATGGAGCAACAAACTTCAATAACGAAGACCTTACTTTAAGAGGTAGTAGTGATAATCCAATCAAAATTGGTAGAGGTGGGAACGCAATCGCTACCAACACTAGAGTTGGATACAGAGCACTAGAGAGCAATACCACTGGTGCTAATAATACAGCATTTGGTTATGAGTCTTCATTTGTATTAAACACTGGATCAAATAATACATCATTTGGTTATCAAGCACTAAGAAGCTCTGGTATCGGGGAGGGTAACGTTGCATTTGGATCTCAATCTTGTATATCCGTAACCGAAGGCGTAGGTAATGTTGGCGTAGGAACTCTAACTCTATCATCAGTAACAGATACCAACTACAACGTCTGTATCGGTCACTATGCTGGTGCTGCTCTAACTGGAAGTGGTAATGTTCTCATTGGTCCTGCATCAACAGAAGATTCTTTAAGTGCAACATATGCTCCACCAGCACCAACAGGTAATAACCAATTAGTTATTGCGTCTGGAACTGGAGTATGGATTAGAGGTGACAATGGGTTTAATGTTGTTATGCCAAACAACGTTACAATTCAAAAAAATCTACAAATTAGTGGTGACCTAACTGTTAATGGTACTACAACCACAGTTAATTCTCGTGTTGTTACGATCGATGACAAGGCAATCGAGTTAGGTGCTGTAGCAACAATCAATTTTGTCGGTAATGCGACACTCAACAGCAATGTAATTTCAAATCTACCAACAACAGCTGGTCTGATTGTGGGTATGGAAGTACAAGTTCTCAACGTTGGTATTACTCTACCACCTGGAACTATCATCACTTCAATTGGCACAGACCAGATTGTATTGAACGGAAATATAGGTGGATCGGGAGGCACTAACGTAACCTTCACGGCAATCGGTCCTTCTGATACAACAGCTAATGGGGGAGGAATCATCGTTAGGGGATCTACAAATAAAACTATCCTCTATGATAATGATGGCATTCTTCCTTTCTGGAAAATCAGTGACAACGTTGACATTCCATCAGGAAAGGTATTCAGTATTAATGAATCGTCTGTTCTTTCTGCTACTACATTAGGATCTTCTGTTGTCAATTCTTCATTGACTTCTGTCGGAACTTTACAGAGTCTTTCAGTAACTGGAAACGTTAATCTAAAAGGTAGAATTACAGAAAAAGTTGTCAATAATTTCGTAACATCAATAACACCAGTTTCAAATGAACTTGAAGTTTCTGCAGCAAATGGCAACACAATTATTGGAACTCTGGCAGCGAGCGCAATCAACACATGGAACTTTACAAATCTCGGATTAACTAATGGTTCTTCAATAACGCTAACATTAATTGTAGATGGAAATGCAACAGCAATCTATGGCGATGCATGTAAAGTAGAAGGAAATTCTATTACAGGTGGTATCCAATGGTCTGGAGGTTCGCCACCAGCAAACACATCAAACATAGATATTTTGACCTTCATTGTTGTTAGAGATACCTCTGGTGTAACTAAAGTATACGGACAAGGCAATACAGGATTCAGCTGA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.